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        circbase ID转换

        相关实验:传递基因进皮肤的基因枪技术

        user-title

        星舟0316

        根据GEO2R分析所得的circRNA的基因ID(六位数),怎么转换成circbase的七位数ID啊。circbase有提供一个转换的表格,但是不完整,想问一下还有什么方式可以转换?

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        3 个回答

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        可以去circbase网站做转换,输入基因id后点击转换即可

        user-title

        sswei

        有帮助

        在circAltas 2.0数据库的convert可以转换。

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        可以使用以下方法:

        在circBase网站中使用“search by gene symbol”选项,输入GEO2R分析中的基因D,然后检索与该基因D相关的circRNA。

        在circBase网站的“search”页面中使用circRNA的基因名称进行搜索,并查找与GEO2R分析中得到的基因D相关的circRNA。

        如果以上两种方法都不起作用,可以使用BLAST(基于序列相似性的搜索工具)来搜索与GEO2R分析中得到的circRNA序列相似的circRNA,并查看它们的circBase ID。


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