小白:把基因分为高低表达组，可以依据原始的counts数据分组吗？比较不同组别的基因表达情况，可以直接比较原始的count数据吗

将基因分为高低表达组可以依据原始的counts数据分组。常用的方法是根据基因的均值和标准差进行分组，将均值和标准差范围内的基因分为高表达组，均值和标准差范围外的基因分为低表达组。

比较不同组别的基因表达情况，可以使用差异表达分析（DEA）方法进行比较。常用的DEA方法有基于贝叶斯统计的方法（如DESeq2，edgeR等）和基于假设检验的方法（如limma）。在进行差异表达分析之前，需要对原始counts数据进行标准化处理（如RPKM, TPM等）。

注意，在使用差异表达分析之前，需要保证样本的组别具有独立性，并且分析时应该考虑到其他可能影响基因表达的因素。并且需要注意的是,虽然差异表达分析可以发现基因表达的差异，但是并不能说明因果关系，还需要进一步研究才能确定因果关系。

不可以，需要先对基因表达量进行归一化

可以依据原始的counts数据分组。

可以依据原始的cunsts数据分组，也可以直接比较原始数据