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        请问circRNA的convergent引物怎么设计啊

        相关实验:用T4 RNA 连接酶连接 RNA 分子

        user-title

        天路旅客99

        可以直接用线性亲本基因的引物吗

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        4 个回答

        user-title

        沉沦6RZH

        有帮助

        https://www.sohu.com/a/215186821_802014

        user-title

        dxyc42u

        有帮助

        不可以用线性亲本基因的引物,这两个的扩增方式都不一样

        user-title

        天路旅客99user-title

        请问convergent引物怎么设计啊?

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        在设计cirCRNA(环形RNA)的convergent引物时,需要考虑以下几点:

        1. 引物定位:convergent引物应该定位在环形RNA的两个相对方向的连接点上,确保引物能够扩增整个环形RNA的序列。

        2. 引物设计:引物应该具有良好的特异性,避免与线性亲本基因的序列重叠。可以使用引物设计工具如Primer-BLAST、Primer3等,确保引物的特异性和稳定性。

        3. 引物长度:引物长度通常在18-25个碱基对之间,较短的引物可能会增加非特异性扩增的风险,而过长的引物可能会导致扩增效率降低。

        4. 引物Tm值:引物的熔解温度(Tm值)应该在合适的范围内,一般推荐在50-65°C之间。确保引物的Tm值相近,可以提高PCR扩增的特异性和效率。

        需要注意的是,由于cirCRNA与其线性亲本基因具有不同的结构和序列特征,直接使用线性亲本基因的引物可能不适合cirCRNA的扩增。cirCRNA的引物设计需要针对其环形结构进行优化,以确保引物能够扩增环形RNA的全长序列。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        可以直接用线性亲本的引物做,只要特异度好就没问题

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