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        circRNA的多种ID

        相关实验:用T4 RNA 连接酶连接 RNA 分子

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        wanna11

        求问各位大佬们,circRNA的各种ID是如何转化的?还有想请问图中的红色框框所框住的这2个circRNA应该是同一个circRNA吧图片描述

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        2 个回答

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        土井挞克树

        有帮助

        是不同的表达方式,可以在基因组中查相应的基因名称

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        先解释一下,D是指不同的指标或参数,用来描述和分析circRNA的特性和功能。下面是几个常用的D及其含义:

        Divergence:circRNA与其线性同源基因的剪切位点的差异程度;

        Co-expression:circRNA与其线性同源基因在表达水平上的相关性;

        Abundance:circRNA在特定组织或细胞类型中的表达水平;

        Stability:circRNA相对于线性RNA的稳定性;

        Localization:circRNA在细胞中的亚细胞定位。

        至于您提到的图中的红色框框,确实是同一个circRNA。在文章中,作者通过RT-qPCR测量了不同处理条件下circ_0001679的表达水平,并进行了统计分析,结果表明LPS刺激会显著提高MLE-12细胞中circ_0001679的表达水平。同时,为了进一步验证circ_0001679的功能,作者还通过RNA干扰技术对其进行了敲低,发现circ_0001679的敲低可抑制MLE-12细胞的凋亡和炎症反应。

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