RIP出的RNA，怎么去检测具体有哪些RNA呢

你提到的两种方法都可以，这两种方式检测rna都是比较基本的，按照教程来就可以。

利用RNA结合蛋白的抗体免疫沉淀RNA/蛋白复合物，再从沉淀的RNA/蛋白复合物中分离得到特定RNA结合蛋白的RNA;分离得到的RNA可以通过末端标记和变性胶电泳对RNA分子的大小进行鉴定，也可以利用高通量RNA测序方法对RNA序列进行分析。

qPCR和NGS是两种不同的RNA定量方法，qPCR适用于对单个或少数几个RNA分子进行定量，而NGS可以对整个RNA组进行定量和分析。

对于aPCR，内参基因通常被用作归一化参考基因。因此，通过与内参基因的比较，可以确定不同样本中RNA的相对表达量。

RNA的下游验证包括多种方法，例如EMSA和Northern blotting，这些方法可以验证RNA的翻译产物，以及它们是否与蛋白质结合。不过，这些技术可能较为复杂。

CLIP技术（Cross-linking and Immunoprecipitation）是一种用于分析RNA-protein互作的方法。该技术通过紫外线交联将RNA和其相邻的蛋白质结合在一起，然后通过免疫沉淀分离RNA-protein复合物，最后对分离的RNA进行测序分析以验证RNA-protein互作位点。使用CLIP技术需要丰富的经验和相关设备，也是比较复杂的。