GEO数据库提取lncRNA
海狸先生乀
从TCGA提取的lncRNA在GEO数据库中找不到 而且TCGA数据库有些lncRNA是以A开头然后一堆数字 比如AC006160.1. GEO则有些是LOC100049716 没办法对应。尝试从GENCODE网站下载全部lncRNA的信息用ensembl号进行对应，但能筛选出的lncRNA很少且不全，请问各位大神，有什么其他办法能筛选出lncRNA呢？还是利用ensembl号对应有什么需要注意的地方呢，万分感谢！！
2 个回答
地下河9QNE
有帮助
你好，问题解决了吗，我遇到了同样的问题
土井挞克树
有帮助
一般不用ense号，直接提取之后自己去对应一下试试
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