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        (实时荧光定量PCR)非竞争性内标定量中间的公式(从CT值到浓度)是怎么确定的?怎么建立模型?

        相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

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        dxy_z7y46the


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        2 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        在实时荧光定量PCR中,常用的非竞争性内标法是采用外源性参比基因或人工合成的内标分子作为定量的基准,通过比较参考基因和目标基因的荧光信号差异,计算出目标基因的相对表达量。具体的公式和建模方法如下:

        1.构建标准曲线

        首先,需要在实验中构建一个标准曲线,将已知浓度的DNA模板进行反转录合成cDNA,然后进行实时荧光定量PCR,测量荧光信号与初始DNA浓度的对数之间的关系。根据标准曲线,可以通过计算目标基因和参考基因的CT值差异,得出目标基因的相对表达量。

        2.计算相对表达量

        根据实时荧光定量PCR的数据,可以使用2^-ΔΔCT法计算目标基因的相对表达量。具体公式如下:

        ΔCT = CT(目标基因)- CT(参考基因)

        ΔΔCT = ΔCT(样品)- ΔCT(对照)

        目标基因相对表达量 = 2^-ΔΔCT

        其中,ΔCT表示目标基因和参考基因的CT值差异,ΔΔCT表示样品和对照的ΔCT值差异,样品和对照分别是实验组和对照组的样品。根据ΔΔCT值的大小,可以判断目标基因的表达量相对于对照组的变化程度。

        3.建立模型

        建立模型的目的是确定样品中目标基因的绝对拷贝数或浓度。一般来说,需要先对标准曲线数据进行分析,得到荧光信号与模板浓度之间的函数关系,如一次线性回归模型或二次曲线模型等。然后,根据标准曲线的函数关系和目标基因的CT值,可以计算出样品中目标基因的拷贝数或浓度。



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        dxy_z7y46theuser-title

        感谢您的回答,我还有点疑问,希望您能答复。建立模型中,根据标准曲线的函数关系和目标Ct值计算目标基因浓度,那不就和外标法一样了吗?计算相对表达量的目的是什么呢?感觉没用到。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        ct值是做qpcr实验测得的,测得之后带入公式即可

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