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        同源重组连接问题

        相关实验:同源一步荧光等位基因特异性PCR

        user-title

        dxy_ohe0tcf0

        载体体和目标片段同源重组连接,热激法转DH5α,6500和3500的片段或者两个5500的片段,试过各种连接比例,也延长过无缝克隆和转化复苏的时间,涂板要么一个菌落都不长,要么只有四五个单菌落,而且都是假阳性;换过好几次感受态,并且感受态转现成的质粒是正常的,构建三千多的质粒成功了,说明无缝克隆酶也没问题吧,但是一直不成功的原因是什么呢 求助各位大神, 卡在这一步很久了 555555

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        3 个回答

        user-title

        huarenqiang5

        有帮助

        你的这个情况考虑是质粒选择不正确,建议选用其他质粒试试。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        建议更换质粒类型,重组质粒是不适合的

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        从你提供的信息来看,可能有以下几个原因导致你的载体体和目标片段同源重组连接不成功:

        同源重组效率低。同源重组是一种复杂的过程,很容易受到多种因素的影响,如DNA序列相似性、长度、GC含量、连接比例、转化复苏等。如果同源重组效率很低,那么单菌落的数量就会很少,甚至没有。建议检查DNA序列和GC含量,同时考虑优化连接比例、增加转化量等措施来提高同源重组效率。

        质粒不稳定。质粒构建成功后,可能存在不同程度的不稳定性,如线性化、剪切、降解、酶解等。这些都会导致质粒损失或降解,从而无法获得目标表达。建议检查质粒的完整性和纯度,可以通过PCR、限制酶切、测序等方法进行检验。

        转化复苏不佳。转化复苏是一个关键步骤,也是影响同源重组效率的一个重要因素。如果复苏不佳,就会导致细胞的死亡和无菌情况的破坏,从而影响单菌落的形成和生长。建议在转化复苏过程中严格控制无菌操作、培养基成分和条件,以及使用高质量的感受态细胞。

        实验条件不适合。实验条件可能会影响同源重组效率,如温度、时间、培养基、转化体积等。建议根据自己的实验条件进行优化和调整,例如尝试不同的温度、时间、转化体积等参数。

        总之,同源重组和质粒构建是一项复杂的工作,需要仔细地进行规划和实验操作。

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