为什么病毒感染细胞后收集上清进行密度梯度离心后检测病毒基因组拷贝数会有两个峰值？

可能是存在病毒基因重复，或者是细胞本身感染

考虑可能是病毒基因组是否有结合，比如形成多聚体。

病毒基因组拷贝数会出现两个峰值的可能原因如下：

异常病毒颗粒：感染过程中，病毒复制可能出现错误或异常，导致形成一些不完整或缺失基因组的病毒颗粒。这些异常颗粒的密度可能与完整的病毒颗粒不同，因此会在密度梯度中形成另一个峰值。

细胞固有病毒：某些细胞本身就存在病毒感染，这些病毒称为细胞固有病毒（endogenous virus）。这些病毒的基因组可能与外源病毒不同，密度也可能与外源病毒不同，因此会在密度梯度中形成另一个峰值。

为了确定这些峰值所代表的组分，需要对每个峰值进行进一步的检测和鉴定。例如，可以进行电镜观察、基因测序等实验，来确定每个峰值中的组分。