qPCR产物长度会影响Ct值吗
IrisWA4GO
今天突然想到的问题：qPCR产物长度会影响Ct值吗？
文献给出的引物序列qPCR产物长度在200bp左右，但是跑出来熔解曲线不好，所以另外设计了一对引物，qPCR产物长度只有100bp（当时没考虑到这个问题）。
用的是SYBR GREEN染料法，从原理上来说，qPCR产物缩短到1/2，Ct值会加1，不知道这样理解是否正确？这样跑出来的Ct值还能和同家族的其他基因（产物200bp）定量比较吗？（ps 我的内参基因产物为120bp）
希望有前辈同道指点一下 感谢！
3 个回答
灵枢天问
有帮助
qPCR扩增过程中，扩增产物的荧光信号达到设定的荧光阈值时的所对应的扩增循环数（Cycle Threshold）。C代表Cycle，T代表Threshold。简单讲，Ct值就是qPCR中起始模板扩增达到一定产物量时，所对应的循环数。所谓“一定产物量”后续作进一步解释。和产物长度没关系
汤姆卜丽波
有帮助
不会影响啊，你跑qpcr的Ct值是循环的次数，荧光的量是循环数够了就能检测到了和大小没关系
bamboopiggy
有帮助
qpcr的产物长度不影响Ct值啊，ct值反应的是基因拷贝数的改变
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