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        以质粒为模板的pcr克隆线性化载体pcr不出来怎么办

        相关实验:间接原位 PCR(原位杂交PCR)

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        ColaFJYF

        如题,质粒用的是从DH5α中提取出来的转化后的索来宝Pet-32a质粒。浓度为132ng/ml。现在想做同源重组,以质粒为模板做的载体线性化克隆pcr选取的酶切位点是ecor1和hind3。总共5900bp,用的vazyme p515 mix

        50ul体系:

        dd水 20.5ul

        上下引物 (10um)2ul

        质粒模板 0.5ul

        mix 25ul

        反应程序

        预变性 95℃ 30s

        变性 95℃ 15s

        退火 58℃ 10s

        延伸 72℃ 6min

        彻底延伸 72℃ 5min

        之后用dnp1 2ul37℃处理15分钟

        有一次做温度梯度实验时10ul体系做的发现58℃有条带很暗但是单一正确。再做50ul体系进行胶回收发现一直扩增不出来结果如图所示。也不知道是什么原因。已经p了2个星期了。。。

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        4 个回答

        user-title

        研究生小白阿尚

        有帮助

        楼主你好,我现在也遇到了同样的问题 困扰多半个月了,请问您最后怎么做的呢

         

        user-title

        dxy_kg0gr2v5

        有帮助

        你这个问题我也遇到过,首先去设阳性跟阴性对照,确保载体跟模板没有问题,如果实在不行,建议传统克隆试一下

        user-title

        Eason老歌迷

        有帮助

        做好对照,然后确保你的引物和酶没有啥问题,基本上就OK了

        user-title

        天一湖医者

        有帮助

        如果你以质粒为模版扩pcr,然后跑胶时还能看到质粒的条带,那说明你的模版量太大了。降低模版量至最多20ng应该可以了,一般我实验中都用1-10ng就够了,而且这还是50ul体系,如果你的体系更小,我想最多1ng就够了

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