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scRNA-seq对细胞形态比较敏感,由于细胞形状和仪器设计的不兼容性,许多细胞类型,如肌细胞或神经元,不能被描绘,怎么解决

相关实验:单细胞多组学

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dxy_68hp5g04


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2 个回答

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土井挞克树

有帮助

可以把肌细胞制备成单细胞悬液然后做空间组学+代谢组学,利用多组学研究来解决这种描绘差异

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loveliufudan

有帮助

针对这个问题,可以尝试以下方法来解决:

尝试使用其他单细胞分析技术:例如,单细胞ATAC-seq、单细胞蛋白质组学等技术,可以从不同的角度获取单个细胞的信息,从而解决SCRNA-seq在细胞形态分析上的限制。

优化细胞分离和处理方法:尽量避免细胞在处理过程中的损伤,可以减少形态失真的可能性。优化细胞分离的方法,选择适当的酶或细胞分离缓冲液,避免细胞破裂或变形。

优化数据处理和分析方法:对于形态特殊的细胞,可以通过对数据进行优化处理或者采用特殊的分析方法来提高其测序数据的质量。例如,针对细胞形态变化引起的基因表达变化,可以采用形态因子来纠正数据中的偏差。

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