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        单细胞转录组测序新手求助?

        相关实验:单细胞多组学

        user-title

        lyang556

        单细胞转录组测序,哪些细胞适合置备细胞核悬液,哪些细胞适合置备细胞质悬液,那个悬液RNA质量更高,以及置备两种悬液检测结果一致吗,新手求助一下?

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        2 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        一般来说,对于细胞核/细胞质比例较高的细胞(如血细胞),选择置备细胞核悬液可以提高RNA测序的灵敏度和特异性;对于细胞核/细胞质比例较低的细胞(如神经元),选择置备细胞质悬液可以获得更全面的转录本信息。此外,对于一些有细胞壁或有刺突的细胞(如酵母菌或植物细胞),需要先进行细胞壁或细胞膜的破碎,然后分别置备细胞核悬液和细胞质悬液。

        至于哪种悬液的RNA质量更高,一般来说,置备细胞核悬液可以获得更高的RNA纯度和完整性,因为细胞核中含有RNA的主要转录产物,而且细胞核中的RNA不受胞质内核糖体RNA的干扰。但是,细胞核悬液RNA的含量相对较低,而且可能存在DNA污染。相比之下,细胞质悬液可以获得更高的RNA产量,但可能存在胞质内核糖体RNA的污染。

        最后,对于置备两种悬液检测结果是否一致的问题,一般来说,这取决于细胞类型、实验条件和测序平台等多个因素,因此需要具体情况具体分析。在进行单细胞转录组测序之前,建议进行预实验和验证,选择最适合的方法和步骤,以获得高质量的RNA和可靠的测序结果。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        成纤维细胞、巨噬细胞、神经胶质细胞、心肌细胞以及肝、肺、肾、乳腺、皮肤细胞等)和肿瘤细胞一般适合细胞质悬液

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