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        全基因组测序

        相关实验:T7RNA 聚合酶系统基因表达实验

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        求求给个工作吧

        实验组和对照组WGS数据已经拿到手,相比较几个基因变异在两组间有没有差异,数据不会分析怎么办,怎么搞啊,有没有大神懂的啊?

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        3 个回答

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        这个可以在基因组测序网站分析,还可以去类似ncbi分析

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        全基因组测序的数据分析是一项复杂的任务,需要进行多个步骤的数据处理和分析。以下是一个简单的数据分析流程,供参考:

        质量控制和去除低质量数据:使用工具如FastQC和Trimmomatic等对测序数据进行质量控制和去除低质量数据。

        序列比对:使用工具如Bowtie2和BWA等将样本的测序数据比对到基因组参考序列上。

        变异检测:使用工具如GATK和VarScan等检测样本中的变异,如SNP、InDel等。

        注释和功能分析:使用工具如ANNOVAR和SnpEff等对检测到的变异进行注释和功能分析。

        变异差异分析:将实验组和对照组的变异进行比较,可以使用工具如DESeq2和edgeR等进行差异分析。

        根据您的需求,您可以关注上述步骤中的第5步,使用相应的差异分析工具比较实验组和对照组的基因变异情况。在进行差异分析时,需要注意选择合适的差异分析模型,控制假阳性和假阴性的比例,进行多重检验校正等问题。

        user-title

        dxyc42u

        有帮助

        一般的在线分析网站可以做一些简单的分析,复杂的分析就要用到R了

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