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        求教SNP格式chr:pos与rsID转换方法

        相关实验:SNP分型分析实验

        user-title

        六道闲人

        如题,最近在做TwoSampleMR,从UKB下载都是chr:pos这种格式,但是我的暴露数据是rsIDs这种格式,格式不同后面就没法做clumped,求大神赐教怎么转换格式!谢谢!

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        2 个回答

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        先明确原始数据的dbsnp版本,然后标准化,之后匹配完就可以转化了。

        user-title

        Dr_劉医生

        有帮助

        具体看你SNP数量,少的话,直接用NCBIdsSNP直接搜rsID,批量转换的的话可以用SNPnexus这个工具试试,得用教育邮箱注册

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