求教SNP格式chr:pos与rsID转换方法
六道闲人
如题，最近在做TwoSampleMR，从UKB下载都是chr:pos这种格式，但是我的暴露数据是rsIDs这种格式，格式不同后面就没法做clumped，求大神赐教怎么转换格式！谢谢！
2 个回答
土井挞克树
有帮助
先明确原始数据的dbsnp版本，然后标准化，之后匹配完就可以转化了。
Dr_劉医生
有帮助
具体看你SNP数量，少的话，直接用NCBI的dsSNP直接搜rsID，批量转换的的话可以用SNPnexus这个工具试试，得用教育邮箱注册
相关问答
关于丁香通
公司信息
个人用户
企业机构
提问
扫一扫
实验小助手
扫码领资料
反馈
TOP
打开小程序