如何判断一个菌能否使用CRISPR系统进行基因敲除？
相关实验：全基因组CRISPR-Cas9基因敲除和转录激活筛选实验
dxy_cffftvqr
现在看文献有一个菌目前还未有基因层面的敲除等实验，NCBI上有全基因组测序结果（level为contig）。菌所在的属也没看到有基因敲除等相关实验。该怎么判断这个菌能否使用CRISPR系统或敲除体系进行基因敲除呢？（PS: 一直不太懂基因组组装结果为conting或scaffold会对什么研究有影响？影响代谢模型建立？）
2 个回答
土井挞克树
有帮助
首先前提条件这个菌要有结构区域的外显子
dxy_cffftvqr
原核生物没有内外显子之分吧
Dr_劉医生
有帮助
两个原则，一是能查询到NLS序列；二是能够对序列进行核定位，进行CRISPR剪切。
dxy_cffftvqr
我想了解一下细菌的NLS序列可以在哪查到？
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