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科研学霸天团,48小时有问必答
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GEO数据集里面病例数较少
juyue2010
会有疑问,病例数少,统计结果可信度大为下降
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问
流式细胞PI单染中为什么用RNAse?
dxy_ju4vzuyw
PI是常用染料,但嵌入到双链Dna和Rna的碱基对中与之结合,无碱基特异性,故染色前必须用RNase A处理细胞,排除双链Rna的干扰
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问
流式检测细胞周期时加RNA酶所需的温度?
Dr_劉医生
37度孵育30min,然后加裂解液,4度继续孵育30min。园子里有方案,可以去看看
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问
实验过程中出现非特异性染色处理有哪些?
土井挞克树
一抗用多克隆抗体容易出现非特异性染色,建议用高纯度,高效价的针对更具特异性抗原决定簇的单克隆抗体来解决。单克隆抗体很贵,不过结果真的很好。尤其是背景非特异性染色不会太深。真是一分价钱一分货。一抗过期也会造成杯具,所以要注意抗体的有效期。
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问
实验过程中荧光强度弱怎么处理?
土井挞克树
1 荧光染料和显微镜的荧光块可能不是很配合 2 汞灯的中心没有调节好,或者汞灯的寿命到了 3 样本的制作是否可以更好, 4 是否用用了合适的物镜
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问
要验证某个细胞上有无该蛋白的存在,需要做免疫组化和westernblot试验吗?做这两个试验时的一抗和二抗可以共用吗
土井挞克树
需要做两个实验,抗体可以共用。
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问
请问下这个circo图该怎么看啊
Dr_劉医生
这是典型的细胞聚类的circo图,看细菌和细胞类型的相互作用。你在网上看到的那是常规的外圈染色体和基因的,用R作图的时候都是可以修改外圈的数据信息。推荐你看下这篇文章的figure1A,和你这个是一样;“Tumor microenvironment characterization in gastric cancer identifies prognostic and immunotherapeu
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问
请问神经系统的spine turnover是什么意思,如何翻译
Dr_劉医生
树突棘周转,一般和突触连接,树突形态一起反应神经元的内源性可塑性指标。基本所有神经元检测都会测这个,推荐一篇文献,Gao BY, Cao YX, Fu PF, et al. Optogenetics stimulates nerve reorganization in the contralesional anterolateral primary motor cortex in a mouse
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问
为什么空载质粒转染也能诱导炎症啊?
juyue2010
质粒内毒素超标,会导致炎症因子产生
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问
细胞层面怎么筛选出相关基因的外泌体?
juyue2010
细胞和它产生的外泌体同时做质谱,进行蛋白质组分析,或检测外泌体中的基因片段
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问
两个蛋白质直接作用的检测方法有哪些?
juyue2010
免疫共沉淀,promega荧光素酶方法biacore
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问
基因敲除选用大鼠和小鼠哪个好?
子昂-
基因敲除大小鼠 ,目前技术已经很成熟了,具体使用大小鼠,还是结合客户的需求来综合考虑
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问
流式实验中,检测的组织上是否表达该抗原?
Dr_劉医生
细胞表面的分子抗原是否表达,是已知公开的,你得先确认或者预测有这个抗原,然后买相应的抗体去验证
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问
流式细胞术实验中细胞无法标记怎么解决?
juyue2010
抗体选择不合适,蛋白有构象,你的抗体是否适合流式
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问
悬浮细胞铺板不均匀有什么好的解决办法吗
juyue2010
细胞吹吸均匀后铺板,缓慢画8字摇匀,
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问
纯化蛋白过镍柱时聚沉?
土井挞克树
蛋白浓度过高的时候,会发生聚集而沉淀。有些不易溶蛋白随着镍柱的富集作用就会沉淀。
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问
把放入真菌的PDB培养液放到摇床上进行摇晃,但是去观察的时候发现摇床停止转动了,会有什么影响吗?
土井挞克树
摇的时间不够肯定影响你后续结果的。
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问
代谢组学差异性代谢物太少
Dr_劉医生
建议初筛用倍数变化法,就是FC;因为代谢产物的倍数变化范围广,然后再用p值或者VIP来筛有统计学差异或者可能是阳性的关联代谢物
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问
SEER数据库求助 ,SEER数据库里有复发的内容么
Dr_劉医生
有,但不是全有,一般癌症随访都有,再recurrent和re-time那块
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问
求助 | meta分析审稿人意见解读
土井挞克树
他是想让你注明数据的来源,至于四分位间距是反映标志变动度的指标之一,变量数列中第三个四分位数和第一个四分位数之间的差距。
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