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关于SNP与神经生物学起始研究的一种工具

对于神经科学中分子生物学部分,特别是相关疾病方面的研究手段并不是很多。特别是对于多个因素的作用,现在的研究手段还比较稚嫩,对于DNA 的初步大规模分型无疑是一种好的方法。AFFY用基因来检测SNP达到了高通量的目的,非常适合于第一步的筛查。 复杂DNA 的大规模基因分型 Nature Biotechnology Volume 21 Number 10 October 2003 以复杂的人类表型的 ...

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从普通琼脂糖凝胶电泳中用玻璃奶回收DNA段

实验步骤: 1、待回收的DNA段经电泳分离后,从琼脂糖凝胶上切下所需DNA段,放在1.5ml EP管中; 2、加入3 倍(请准确估量凝胶的体积)体积的溶胶液(以100μl 体积胶加入300μl 溶胶液为一次标准反应),室温下放置5分钟或50℃ 保温3分钟,其间轻摇EP管几次使胶完全融化; 3、加入10μl玻璃奶(玻璃奶使用前请充分摇匀),颠倒混匀,冰浴下放置10分钟。每隔2~3分 ...

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BAC提取方法

BAC提取前准备(前两天 ) 配制含25 mg/l Kan的LB培养基选择平板,在超净工作台上用接种环从购买的BAC划线接种至选择平板,于37℃培养箱培养过夜,供选择单。 BAC提取前准备(前一天) 1、在超净工作台上,用50 µg/ml Kan和液体LB培养基配制成25 mg/l Kan培养基,每个Falcon试管分装10 ml。也可先分装10 ml无抗生素的液体LB培养基后,然后每 ...

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聚合酶链反应(PCR)技术体外扩增DNA

聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)是体外酶促合成特异 DNA 片段的一种技术。利用PCR技术可在数小时之内大量扩增目的基因或DNA 片段,从而免除基因重组和分子等一系列繁琐操作。由于这种方法操作简单、实用性强、灵敏度高并可自动化,因而在分子生物学、基因工程研究以及对遗传病、传染病和恶性肿瘤等基因诊断和研究中得到广泛应用。 PCR进行的基本条件是: (1)以 ...

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DNA methylation

DNA methylation is an epigenetic event that affects cell function by altering gene expression and refers to the covalent addition of a methyl groupcatalyzed by DNA methyltransferase (DNMT)to the 5-car ...

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细胞/组织中的DNA定量(Quantification of DNA in cell / tissue samples)

1.Safety precautions Hoechst 33258 is carcinogen and toxic.Use with adequate ventilation.Avoid contact with eyesskinclothing.Wash after handling.Keep container closed. 2.Rationale For biochemical qu ...

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Preparation of Salmon Sperm DNA

Denatured Salmon Sperm DNA is used in prehybridization and hybridization solutions to reduce background signal.The Salmon Sperm DNA (Sigma No.D-1626)is first "denatured" in large volumes and ...

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amplifiable dna from bones-Molecular Biology

does anyone have a reasonably successful protocol for isolating dna from bones---bones that are highly compromised in integrity---i.e.really bad shape? I've tried and am well seasoned in the tra ...

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Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)

Sugden labMcArdle Laboratory for Cancer ResearchUniversity of Wisconsin-Madison Medical School DNA /EMSA.pdf">http://mcardle.oncology.wisc.edu/sugden/Protocols/PDF files/Association of protein ...

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Standard hybridization technique

The standard solution typically used for both pre-hybridisation and hybridisation is based on that given in Maniatis et al.(1982)with both Denhart's solution and heterologous DNA being replaced by hep ...

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DNA Preparation from Adherent Cells

Section of Cancer GenomicsGenetics BranchNCI National Institutes of Health Reagents Chloroform Mallinckrodtcat.4440 EDTA0.5 M Ethanol100% Ethanol70% Isoamyl Alcohol Sigmacat.I-3643 Phenol Gibco BRLCat ...

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Procedure for GenEluteTM Plasmid Miniprep Kit(质粒小量提取)

Note All centrifugation speeds are given in units of g.Please refer to Table 1 for information on vonverting g -force to rpm.If centrifuges/rotors for the required g -forces are not availableuse the m ...

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DNA抽提指南(TRIZOL)

按照RNA 分离操作方案在完全移去水样层后,匀浆中的DNA 存在于中间层和苯酚层中也可以被分离出来。在沉淀和多次洗脱后,DNA 溶解在8 mM NaOH中。用TRIZOL试剂从组织和培养细胞中完全回收的DNA 可以用来做样品中DNA 含量的测定。同时抽提的基因组DNA 可以用于对Northern analysis的结果进行标准化,因为DNA 变异程度比总RNA 或组织重量要小。 实验所需但试剂未提 ...

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农杆菌感受态细胞的制备和转化子的验证

一.农杆菌感受态细胞的制备 (同大肠杆菌质粒DNA的提取),然后将其转化大肠杆菌,再提取大肠杆菌的质粒DNA进行酶切鉴定。 取-70℃保存的EHA105于含有50μg/ml链霉素平板划线,28℃培养2天。挑单菌落接种于5ml YM(0.5g/L KH2 PO4 10 g/L Mannitol2 g/L L-Glutamine0.2 g/L NaCL0.2 g/L MgSO4 0.3 g/L ...

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临床样品基因组DNA小量抽提标准操作规程(SOP)

目的: 1.从人或动物血液中抽提DNA 。 2.从体液,唾液,尿液中抽提DNA 。 3.从人体组织,切片和各种临床样品中抽提DNA 。 4.抽提出的DNA 可以用于PCR及相关诊断。 原理: 临床常常需要从各种生物组织或细胞中抽提基因组DNA ,用于病症的辅助性分析和诊断。样品根据试剂盒(SK1341试剂盒,上海生工)提供的方法进行处理,然后在特定的DCL Buffer中用Protenase K ...

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DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)

摘要: DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:整体水平的甲基化检测、基因特异位点甲基化的检测和新甲基化位点的寻找。本篇将主要介绍目前存在的大部分DNA 甲基化研究 ...

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分子杂交

对于大的基因组,DNA 酶切图谱凭肉眼是分辨不开的(EB 染色),因为大小不等的分子呈现弥散分布,只有借助灵敏的放射性同位素(或其他化学发光物质),将靶 DNA 在凝胶上(膜上)的带型通过特定的探针与之杂交,转换成 X 光片上直观的带型,才能进行相关分析。另外如果需要鉴定或寻找与已知 DNA 同源的 DNA 片段如:染色体步查、基因组文库的评价和利用、阳性克隆的分析鉴定、转基因拷贝数分析等也都需进 ...

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分子克隆常用技术

一、核酸的纯化 在分子克隆的所有操作中,最基本的操作是核酸的纯化。其关键步骤是去蛋白质,通常只要用酚/氯仿。氯仿抽提核酸的溶液即可。每当需要把克隆有某一些所用的酶灭活或去除以便进行下一步时,可进行这种抽提。然而,如要从细胞裂解液等复杂的分子混合物中纯化核酸,则要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白质后,再用有机溶剂抽提。这些广谱的蛋白酶包括链霉蛋白酶及蛋白酶K等,它们对多种天然蛋白均有活性,(1)用酚 ...

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重组质粒的抽提、鉴定与凝胶成像技术

一、目的 鉴定载体与目的基因是否已经成功连接成新的重组质粒。 二、原理 载体pUC18具有一个EcoRI 和HindIII的单酶切位点,含氨苄青霉素抗性基因。目的基因设计时分别在上、下游引物中加入了EcoRI 和HindIII单酶切位点,两者双酶切后,经连接酶连接,连接成功就形成了新的重组质粒。 在含50μg/ml Amp、40ml X-gal 储液和4μlIPTG 储液LB 固体平皿 ...

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