...
...
...
MATERIALS: 2-glass plates 1 sharks -tooth comb and spacers Whatman 3 mm paper 30 or 40% acrylamide-bis (19:1) 10X TBE urea 10% ammonium persulfate TEM ...
...
...
测定DNA的核苷酸序列是分析基因结构与功能关系的前提。从小片段重叠法到加减法、双脱氧链终止法、化学降解法、自动测序,DNA测序技术发展很快。目前在实验室手工测序常用Sanger双脱氧链终止法。Sanger法就是使用DNA聚合酶和双脱氧链终止物测定DNA核苷酸序列的方法。它要求使用一种单链的DNA模板或经变性的双链DNA模板和一种恰当的DNA合成引物。其基本原理是DNA聚合酶利用单链的DNA模板,合 ...
DGGE,CGGE及TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计.对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂, 高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁移的速度就会改变.Tm值 全要取决于DNA的碱基组成,序列中出现单碱基替换时,Tm亦发生 ...
大片段DNA的测序: 通过鸟枪法 (Shot Gun Sequencing) 测序 鸟枪法测序的操作方法 1. 用限制酶切下目的片段的大片段Insert DNA 并用Agarose凝胶电泳进行回收。 2. 对回收的大片段DNA用物理方法 (如超声波等) 进行切断处理,然后用T4 DNA Polymerase对小片段 DNA进行末端平滑化。 3. 进行Agarose电泳,切胶回收1 kbp ~ 2 ...
DNA测序样品用什么溶液溶解比较好? 答:溶解DNA测序样品时用灭菌蒸馏水溶解最好。DNA的测序反应也是Taq酶的聚合反应需要一个最佳的 酶反应条件.如果DNA用缓冲液溶解后在进行了测序反应时DNA溶液中的缓冲液组份会影响测序反应的体 系条件造成Taq酶的聚合性能下降。 有很多客户在溶解DNA测序样品时使用TE Buffer。的确,TE Buffer能增加DNA样品保存期间的稳定性, 但TE Bu ...
...
在分子生物学研究中基因克隆和分子杂交的探针制备等操作常需分离与已知DNA序列邻近的未知序列,TAIL-PCR又叫热不对称交错PCR,能够较好地解决上述难题。该技术通过3个嵌套的特异性引物分别和简并引物组合进行连续的PCR循环,利用不同的退火温度选择性地扩增目标片段,所获得的片段可以直接用做探针标记和测序模板。 TAIL-PCR技术简单易行,反应高效灵敏,产物的特异性高,重复性好,能够在较短的时间内 ...
PCR反应的最大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头痛的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。 一、污染原因 (一)标本间交叉污染:标本污染主要有收集标本的容器被污染,或标本放置时,由于密封不严溢于容器外,或容器外粘有标本而造成相互间交叉污染;标本核酸模板在提 取过程中,由于吸样枪污染导致标本间污染;有些微生物标本尤其是病毒可随气溶胶 或形成气溶胶而扩散,导致彼此间的污染。 ...
聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction PCR)是80年代中期发展起来的体外核酸扩增技术。它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究 的目的基因或某一DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的DNA供分析研 究和检测鉴定。过去几天几星期才能做到的事情,用 ...
下游应用为基因筛选、测序、突变检测和分子诊断等等的用户,对PCR保真性要求很高。 降低PCR扩增的错误率可以通过使用各种具有高保真性的DNA聚合酶来实现。 DNA聚合酶的保真度用错误率来表示,包括碱基错配率、PCR产物突变百分数等。 在目前已发现的所有耐高温DNA 聚合酶中,Pfu酶的出错率最低,保真度最高(见附表)。 除对酶进行选择,研究者也可通过优化反应条件来进一步减少PCR突变率,包 ...
引物 引物设计:引物长度适当,18-24mers,并保证序列独特性,以降低序列在非目的片段中存在的可能性,但长度大于24核苷的引物并不意味着有更高的特异性,较长的序列可能会与错误配对序列杂交,反而降低特 ...
Primers: i) Oligonucleotide primers are generally supplied as "so many OD units/ml" - but what does this mean in terms of mg/ml or mmol/ml etc? Given: a primer is Y nucleotides (nt) long; ...
Nucleotides: Stocks of nucleotides for PCR (or other procedure) are NEARLY ALWAYS dNTPs (deoxynucleotides) and concentrations is almost always given in EACH dNTP: that is the given concentration is E ...