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RNA标记是将标记物（如放射性同位素、荧光素或酶）共价地连接到RNA，通过检测标记物，进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛，在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求： 1. 操作简单，灵敏度高 2. 不影响碱基配对的特异性 3. 不影响RNA活性 4. 对酶促反应活性无影响或影响不大 ...

1. RNA探针： RNA探针的长度以50-150碱基为佳，探针易进入细胞，杂交率高，杂交时间短。长500个碱基的探针杂交时间约需20个小时左右，如超过500个碱基的RNA探针则在杂交前用有限碱基水解法控制其长度。 （1）孵育时间t = Lf- Lo / K × Lo ×Lf （Lo=核酸探针原长度（kb），Lf=核酸探针水解后所需长度（kb），K是常数率= ...

某些标记探针必须经纯化后方可使用。这是因为在探针标记过程中，反应液中仍存在一些未被结合到探针中去的剩余dNTP等小分子。 为将掺入并结合到cDNA，cRNA和标记寡核苷酸与游离的标记寡核苷酸分开，常使用乙醇沉淀法或酚/氯仿抽提法进行纯化。 乙醇沉淀法的原理是：DNA可被乙醇沉淀，而未掺入DNA的dNTP则保留在上清液中，由此反复乙醇沉淀能将两者分开。 核酸溶液中去除蛋白质的酚/氯仿抽提法的 ...

在RNA原位杂交中，不仅要选择适当的探针，而且还要使探针得到有效的标记。探针标记法有酶反应法和化学反应法。 1. 酶反应法：用于RNA探针的酶反应法主要为末端标记法与体外转录法。末端标记法是将标记物导入线型DNA或RNA的5'端或3'端的一种标记法，末端标记适用于合成寡核苷酸探针的标记，用末端标记制备的探针一般携带的标记分子较少。 2. 体外转录法：体 ...

RNA探针是指带有标记的能与组织内相对应的核苷酸序列互补结合的一段单链cDNA或cRNA分子。根据在RNA杂交中所使用的探针依其来源可分为三种：即特异性cDNA，cRNA探针和人工合成寡核苷酸探针。 1. 单链cDNA探针： 由于cDNA中不存在内含子及其它高度重复序列，又克服了双链cDNA探针在杂交反应中两条链之间复性的缺点，从而提高了杂交反应的敏感性。但由于单链cDNA探针的制 ...

在RNA的杂交检测实验中，应用标记的RNA 探针将获得高灵敏度的杂交检测结果，与DNA 探针相比，检测灵敏度提高10-100倍。因为对于不同的杂交体类型来说，RNA-RNA杂交体的结合强度高于RNA-DNA和DNA-DNA杂交体。对于通过Northern blots检测低浓度mRNA，以及原位杂交的核酸定位检测等应用，RNA探针是一种理想选择。RNA探针同样也适用于Southern blots， ...

引物延伸分析（primer extension analysis）主要用于mRNA 5′端作图。poly（A）+RNA首先与过量5′端标记的且与靶RNA互补的单链寡核苷酸引物杂交，然后用反转录酶延伸这个引物。产生的cDNA与RNA模板互补且长度与引物5′端和RNA 5′端之间的距离相等。该法在mRNA 5′端作图方面具有下述优势：一旦引 ...

一、引物延伸分析（primer extension analysis） 引物延伸分析用于定量mRNA的量，测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端， 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域，随后用RNA作为模板，用反转录酶延伸引物得到cDNA，用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的长度为引物的标记的核苷酸 ...

引物延伸实验一些常见问题： 1. 什么是引物延伸实验？ 引物延伸实验用于定量mRNA的量，测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端， 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域， 随后用RNA作为模板，用反转录酶延伸引物得到cDNA，用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的长度为引物的标记的核苷酸到R ...

1. 加入适当体积的RNA（<12 μl）+探头（<3 μl）。 尝试5和10μg 的RNA加600或800页高辛标记的探针。 2. 包括2-3的酵母RNA样品/探针使用。 3. 加入20 μl SOLN。 A到所有涡管（FV =30 μl）和自旋向下。 4. 孵育90-95℃ ...

一、体外转录 在无菌1.5 ml 微型离心管中，结合以下内容： 4 ul 5倍转录缓冲液 2 ul 0.1 M DTT 4 ul 2.5 MM NTP（A，C，G） 0.8 ul RNA酶抑制剂（25 U/ul）RNA酶抑制剂（Promega）中 100 UM冷UTP 1 ul/ug UL线性DNA模板 5 ul10 UCI / UL P32 UTP（800Ci/mmol ...

一、操作步骤 1. 在0.5 mL Eppendorf管中混合以下： 10-20 ug 酵母RNA 10ul杂交组合 加水，使终体积25 ul 40ul矿物油 在100度加热反应2分钟，转移到55度过夜（12-16小时）杂交（的准确温度将取决于寡核苷酸的长度和组成）。 2. 培养过夜后，旋管和1.5 ml 离心 ...

一、材料准备 4μL5X T4激酶缓冲液 5 μl ATP（7000次/毫摩尔） 10 μl 水+寡核苷酸（200毫微克） 1μlT4激酶 1. 37摄氏度1小时 2. 热失活，在75℃下10分钟。 3. 加入1μl糖原（20毫克/毫升），2μl4M乙 ...

简介： RNA酶保护试验(RNase Protection Assay，RPA)是通过液相杂交的方式用反义RNA探针与样品杂交，以检测RNA表达的技术。 1. 原理：双链RNA（杂交的）能够抵抗RNA酶的降解。 2. 应用：检测RNA表达 3. 与Northern杂交和RT-PCR比较，RPA有以下几个优点： （1） ...

一、RNA酶A的小鼠细胞治疗介绍 RNA酶A透其次是免疫细胞治疗是一种方法，它允许显示的本地化涉及到细胞的蛋白质的RNA酶敏感的结构。这项技术是高度依赖所使用的RNA酶A的质量在我们的实验室中，我们用RNA酶A的小鼠细胞治疗表明，异染色质蛋白1（HP1）在臂间异染色质蛋白的富集取决于存在一种RNA成分。 二、材料与试剂 CSK缓冲液：（在-20°C贮存 ...

核糖核酸酶保护实验（Ribonuclease protection assay，RPA）是近十年发展起来的一种全新的mRNA定量分析方法。其基本原理是将标记的特异RNA探针（32P或生物素）与待测的RNA样品液相杂交，标记的特异RNA探针按碱基互补的原则与目的基因特异性结合，形成双链RNA;未结合的单链RNA经RNA酶A或RNA酶T1消化形成寡核糖核酸，而待测目的基因与特异RNA探针结合后形成双 ...

一、RNA酶保护试验（RPA） RNA酶保护试验（（RNase Protection Assay，RPA）即糖核酸酶保护实验（Ribonuclease protection assay，RPA）是近十年发展起来的一种全新的mRNA定量分析方法。本文主要介绍了核糖核酸酶保护分析实验的从试剂准备到、操作步骤以及实验结果全部的操作流程，供大家分享。 二、材料准备及操作步骤 ...

RNA的免疫共沉淀分离及检测 非编码RNA的发现使得RNA领域再次成为了生命科学研究关注的焦点。因为RNA是一种不稳定的生物大分子，绝大多数的RNA都需要与特定的RNA结合蛋白质结合形成RNA/蛋白复合物才能稳定存在于细胞中；不仅如此，RNA与RNA结合蛋白之间的动态关联贯穿和伴随了RNA的转录合成、加工和修饰、胞内运输和定位、功能发挥及降解的整个生命循环。鉴于此，利用RNA结合蛋 ...

一、文献 1. Chen H.H. J. Lebon and A.D. Riggs Analysis of RNA structure and RNA-protein interactions in mammalian cells by use of terminal transferase-dependent PCR. Methods Mol Biol 2008. 488: p. 319-41 ...

1. miRNA是什么？具有什么作用？ 答：microRNAs（miRNA）是一种内源性非编码小分子RNA，一般具有18到25个核苷酸，其序列在进化上高度保守，通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。 miRNA是越来越受关注的转录后调控网络（post-transcriptional control）中重要的调控因子。首先，miRNA结合到核糖核蛋白（Ribonucleoprotein ...