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制备动物模型的基因修饰技术

摘要:动物模型是现代生命科学研究的重要工具,特别是基因工程小鼠和大鼠,在基因功能研究、人类生理病理机制研究及新药研发中起着不可替代的作用。近几年来,制备动物模型的基因修饰技术层出不穷,这不仅包括传统ES打靶、TALEN、CRISPR/Cas9,还有TetraOneTM 基因敲除新技术。本文将对这四种技术的原理、特点、缺陷、未来发展趋势作系统的介绍和对比,并辅以具体案例说明。自25年前小鼠胚胎干细胞(ESC)发现以来,科学 ...

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做病毒浓缩还在用超高速离心法,太 out 了!

慢病毒简介慢病毒(Lentivirus)载体是以人类免疫缺陷I型病毒为基础发展起来的基因治疗载体。区别一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。在转染遗传物质到细胞基因组中的工作中,重组慢病毒载体是一个强大和有效的工具,该载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达。在感染能力方面可有效地感染包括几乎所有的哺乳动物细胞、干细胞和原代培养的细胞,目前慢病毒系统已经被广泛应 ...

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讲统计第六课:秩和检验

秩和检验的背景秩和检验方法最早是由维尔克松提出,叫维尔克松两样本检验法。后来曼—惠特尼将其应用到两样本容量不等(n1 ≠ n2)的情况,因而又称为曼—惠特尼U检验。这种方法主要用于比较两个独立样本的差异。提出问题在实践中我们常常遇到以下一些资料,如需比较患者和正常人的血铁蛋白、血铅值、不同药物的溶解时间、实验鼠发癌后的生存日数、护理效果评分等,这类资料有如下特点:(1)资料的总体分布类型未知;(2)资料分布类型已知,但不符合正 ...

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著名化学家徐光宪院士——新科研创新 16 条

国家最高科技奖得主、著名化学家徐光宪院士多年探索科研如何创新,并通过讲座等形式传递给学生后辈徐光宪●知识创新都有前因后果,来龙去脉。故而勤奋学习,建立知识框架,积累深厚基础;加上追根到底,万事逼问为什么的好奇心,就是创新的源泉。前者是学,后者是问。学而不问则殆,问而不学则茫。学而问,问而思,思而行,行而果,这就是创新。●如果你梦想要做一个科学家,那么勤奋学习就是实现你的梦想之“舟”。但舟有快如宇航飞机,慢如蜗牛。所以勤奋必 ...

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统计第五课:Logistic 回归分析——被冷落的「皇妃」

Logistic 回归:实际上属于判别分析,因拥有很差的判别效率而不常用。1. 应用范围:① 适用于流行病学资料的危险因素分析② 实验室中药物的剂量-反应关系③ 临床试验评价④ 疾病的预后因素分析 2. Logistic 回归的分类:① 按因变量的资料类型分: 二分类 多分类其中二分较为常用② 按研究方法分: 条件 Logistic 回归 非条件 Logistic 回归两者针对的资料类型不一样,后者针对成组研究,前者针对配对或配伍研究。 3.Logistic 回归的应用条件是:① 独立性。各观测对象间是相 ...

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黑匣子与放大镜—蛋白微阵列技术和多肽微阵列技术面面观

抗体是机体免疫系统为清除“异己”而产生的保护性免疫球蛋白。抗体能特异性识别并结合于抗原蛋白的抗原决定簇(表位)上,并通过一系列手段达到清除抗原的作用。抗原抗体相互识别作用原理常常应用于各种免疫检测方法中,免疫微阵列技术是其中一种高通量的免疫检测分析技术。其原理十分简单,可类比于ELISA反应原理:在固体支撑材料表面将各种不同的探针(抗原蛋白或多肽)固定成阵列,与待测样品(血清、组织液等)中的抗体相互作用,然后借助标 ...

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康奈尔大学做笔记的方法 从此学习工作效率提高100%

一、5R笔记法5R笔记法,又叫做康乃笔记法,是用产生这种笔记法的大学校名命名的。这一方法几乎适用于一切讲授或阅读课,特别是对于听课笔记,5R笔记法应是最佳首选。这种方法是记与学,思考与运用相结合的有效方法。具体包括以下几个步骤:1.记录(Record)。在听讲或阅读过程中,在主栏(将笔记本的一页分为左大右小两部分,左侧为主栏,右侧为副栏)内尽量多记有意义的论据、概念等讲课内容。2.简化(Reduce)。下课以后,尽可能及早 ...

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曹雪涛课题组发表新型miRNA靶点鉴定方法

miRNA已被证实与多种癌症的发生发展有关。某些特殊miRNA缺陷会导致其靶mRNA失去控制。目前,寻找miRNA靶点主要通过软件预测,但目前流行的预测算法所得到的结果中存在大量假阳性,或者无法获得有用的靶mRNA,这些结果会给后续验证实验造成很多麻烦。6月10日发布的Cancer Research,报道了第二军医大学、浙江大学医学院及中国医学科学院研究人员共同研发的一种名为miRIP(miRNA in vivo prec ...

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统计第四课:正态分布检验是怎么回事

居中 {text-align: center;}居中 {text-align: center;}什么是正态分布?正态分布是在统计分析最广泛应用的一类分布,自然界、社会、科研、生活、生产中的很多现象都被发现近似地服从正态分布,它无处不在,让你在纷繁芜杂的数据背后看到隐隐的秩序。主要指变量的频数或频率呈中间最多,两端逐渐对称地减少,表现为钟形的一种概率分布,具体的数学公式就不再提了。为什么要进行正态分布检验?假设检验可分为正态分布检验、正 ...

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阿尔茨海默症患者脑切片 检测老年斑神经原纤维变化

前言阿尔茨海默症(AD)是痴呆症的代表性疾病,病理学特征表现为伴随神经细胞脱落的大脑皮质萎缩,还有出现老年斑(以淀粉样蛋白β肽(Aβ)为主要成分)和神经原纤维变化(以过磷酸化tau蛋白为主要成分)。这两种病理图像是由于蛋白质聚合而成的β折叠平行重叠成交叉β折叠结构,即形成“淀粉样蛋白结构”而成。为了进行研究,人们研发出能特异性、选择性地结合Aβ或者tau蛋白形成的β折叠结构的低分子化合物,而这些化合物还需要具有血脑 ...

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统计第三课:卡方检验——挽救参数检验的一颗稻草

到底什么是卡方检验?卡方检验就是卡方分布为基础的一种检验方法,主要用于分类变量,根据样本数据推断总体的分布与期望分布是否有显著差异,或推断两个分类变量是否相关或相互独立。其原假设为:观察频数与期望频数没有差别。凡是可以应用比率进行检验的资料,都可以用卡方检验。要注意的是,卡方检验受样本量的影响很大,同样两个变量,不同的样本量,可能得出不同的结论。解决这个问题的办法是对卡方值进行修正,最常用的是列联系数。对较大样本 ...

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Western blot 实验过程与经验分享

一、蛋白样品的制备与定量(提取好的蛋白是成功的一半)(1)提细胞蛋白① 消化或刮下细胞至1.5的EP管中,标记,10000r离心2min,PBS洗2-3遍。② 尽量吸去EP管中PBS,加适量RIPA裂解液(RIPA裂解液+蛋白酶、磷酸酶、PMSF三联装)。③ 冰上裂解30min~1h,开4°离心机。④ 4°离心11000r,20min。⑤ 取上清,测蛋白浓度,加蛋白上清的四分之一体积5x上样loading buffer,煮沸(95℃加热5min),分装。(2) ...

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师兄精选:免疫组化攻略集锦(二)

蓝色 {color: #00F;}接上一期 师兄精选:免疫组化菜鸟攻略(一),本期我们再聊聊免疫组化(我比较随性,想到哪写到哪)首先,先介绍下免疫组化一般操作流程:1. 石蜡切片脱蜡和水化后,用PBS(PH7.4)冲洗三次,每次5分钟。2. 根据每一种抗体的要求,对组织抗原进行相应的修复。修复方式:我采用压力锅进行抗原修复,取一定量的修复液于压力锅中,加热至沸腾,将脱蜡水化后的组织切片置于不锈钢或耐高温塑料切片架上,放入已沸腾的缓冲液中,盖 上锅盖 ...

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大数据时代如何高效筛选目标药物?

摘要:高内涵成像分析技术是目前针对自动化、智能化、高质量的科研需求,应运研发的一种新的检测平台。与传统的细胞生物学检测方法读板仪和流式细胞仪相比,高内涵成像分析系统提供了与高分辨率显微成像具有同等分辨率,且集自动化、智能化与海量数据为一体的崭新技术平台。高内涵成像分析技术已在国际药物研发工业中应用于肿瘤、免疫疾病、心血管疾病、神经疾病、肥胖症等的机理研究,涵盖了细胞增殖、细胞凋亡、信号通路、神经生长、血管生成、细胞 ...

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ELISA 实验注意事项知多少

优质的试剂,良好的仪器和正确的操作是保证ELISA检测结果准确可靠的必要条件。ELISA的操作因固相载体的形成不同而有所差异,国内医学检验一般均用板式。本文将叙述板式ELISA各个操作步骤的注意要点(珠式、管式及磁性球ELSIA,国外试剂均与特殊仪器配合应用,两者均有详细的使用说明,须严格遵照规程操作)。标本的采取和保存通常我们可用于ELISA检测的样本是有多种类型的,如血清、血浆、尿液、细胞培养上清或组织匀浆 ...

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几种常用冰型制冰机的使用和维护保养

什么是制冰机?制冰机是一种将水通过蒸发器由制冷系统制冷剂冷却后生成冰的制 冷机械设备。根据蒸发器和生成过程方式原理不同,生成的冰的形状也不同,人们一般根据冰形状将制冰机分,有雪花冰、方冰、颗粒冰(圆柱形、方块形、月 型)、圆冰、板冰等。今天我们就随上海巴玖技术人员来一起来了解一下主要的几种常用冰型制冰机的使用和维护保养。 一、雪花制冰机雪花制冰机使用方法:1.雪花制冰机取下外包装,并从出储冰箱内取出随机所附文件袋及进水管、排水管 ...

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常用细胞凋亡检测方法集锦

细胞凋亡的形态学检测1 光学显微镜和倒置显微镜(1) 未染色细胞:凋亡细胞的体积变小、变形,细胞膜完整但出现发泡现象,细胞凋亡晚期可见凋亡小体.贴壁细胞出现皱缩、变圆、脱落.(2) 染色细胞:常用姬姆萨染色、瑞氏染色等.凋亡细胞的染色质浓缩、边缘化,核膜裂解、染色质分割成块状和凋亡小体等典型的凋亡形态..查看原文磷脂酰丝氨酸外翻分析(Annexin V法)磷脂酰丝氨酸(Phosphatidylserine, PS)正常位于细胞膜的内侧,但在细 ...

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常用细胞凋亡检测方法(六)

凋亡相关蛋白TFAR19蛋白的表达和细胞定位分析TFAR19(PDCD5)是由本研究室在国际上首先报导的一个拥有自己知识产权的人类新基因,前期的功能研究表明,它是促进细胞凋亡的增强剂.利用荧光素(FITC)标记的TFAR19单克隆抗体为探针,对细胞凋亡过程中TFAR19蛋白的表达水平及定位研究发现,凋亡早期TFAR19表达水平增高并出现快速核转位现象,伴随着细胞核形态学的变化,持续较长时间,在凋亡小体中仍然可 ...

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新型促凝血RNAi疗法为血友病治疗带来曙光

RNAi(RNA interference)技术自诞生之日,就表现出巨大的疾病治疗应用潜力,每年全球多家巨型药企都会投入巨额资金进行RNAi治疗药物研发,Alnylam就是其中之一。最新一期Nature Medicine中报道了该公司与费城儿童医院关于血友病的RNAi疗法最新研究进展。在血液中,抗凝血因子和促凝血因子会组成一个凝血系统,通过控制血浆中凝血酶的水平,平衡失血控制与血栓形成之间的关系。凝血酶是凝血级联反 ...

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统计SPSS 统计基础教程第二篇:怎样认识 Non-positive 试验

在上一博认识完 α 和 β 后,我们继续深入探讨一下 β 。。。在很多情况下,我们会经常遇到临床试验的结果是Non-positivie(P0.05),此时你会怎么解释呢?有的同学比较干脆,看到p0.05,就立马认为两种药无差别,更有甚者,如果对照组是安慰剂的话,那这个药就被判定为无效,彻底over了。当然这些同学未免有点武断了,其实大多数情况下,这是由于under-powered造成的,下边就给大家举个例子看看吧。。。咱保护人家的知识产权,先说明 ...

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