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【共享】dsDNA微阵列的原理

dsDNA 微阵列又叫蛋白质结合微阵列(Protein binding microarray, PBM), 由Bulyk等在1999 年首次提出。它的基本原理是在玻片上很小的面积内(约1 cm2)固定成千上万的dsDNA分子作为探针, 检测与大量DNA分子与DNA结合蛋白之间的相互作用。这种检测在原理上模拟的是DNA结合转录因子在体内与其DNA结合位点的相互作用。在基因组DNA中, 转录因子的DNA结合位点一般是一段很短(约5~20 bp)的序列, 如转 ...

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果蝇和线虫基因与人类基因相似度的比较

希望大家喜欢,多多支持。请求加分啊。果蝇和线虫基因与人类基因相似度的比较在目前基因序列已解开的三个动物物种中,人类与果蝇在演化上的亲源关系较近,与线虫较远。这项研究是由由美国宾州和日本科学家组成的小组共同进行,宾州演化生物学家S. Blair Hedges表示,他们比较了这三个物种的100个基因﹝这是目前相关研究中最大规模的一次﹞,得到了一个很明确的结果。这三个物种的基因体解读是个别进行的,都是具代表性的物种:人类是脊 ...

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【资源】RNA干扰

RNA干扰RNA干扰(RNA interference,缩写为RNAi)是指一种分子生物学上由双链RNA诱发的基因沉默现象,其机制是通过阻碍特定基因的翻译或转录来抑制基因表达。当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA时,该mRNA发生降解而导致基因表达沉默。RNAi在基因沉默(silent gene)方面具有高效性和简单性,所以是基因功能研究的重要工具。siRNA是一类长约21~25 个核苷酸的双链小RNA分子 ...

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【原创】启动子与转录因子/基因表达调控蛋白

生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗,不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达,表达产生的一些特殊蛋白(如转录因子、调控蛋白)反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点,涉及到生命活动的各个过程,也是各类信号通路研究无法绕过的部分。当面对某个基因表达调控研究时,第一个想到的研究对象是什么?没错,就是基因的启动子。通过启动子区域对基因表达 ...

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《Nature》:用RNAi攻击胆固醇

近几年来,RNAi技术已经成为分子生物学研究领域的一把利剑。最近,一项新的研究表明用RNA干扰技术靶向单个基因的RNA能够成功地降低小鼠的胆固醇水平。这些结果公布在2004年11月11日的Nature上。仅仅在数年前,研究人员发现除了细菌以外的所有生物体控制基因表达,部分依赖于一种叫做RNA干扰的机制。研究人员一直试图将这个机制用于人类疾病的治疗。这种方法的原理很简单,即创造出一个所谓的短干扰RNA(siR ...

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【原创】脱氧核酶研究进展

笔者正在从事应用脱氧核酶技术进行基因治疗实验研究,搜索论坛里对该技术讨论得不是很多,从目前形势看该技术具有广泛应用前景。于是就自己所了解的东西写出来供大家研究,同时也希望有兴趣者和我交流。脱氧核酶(deoxyribozyme/DNAzyme)是利用体外分子进化技术获得的一种具有催化功能的单链DNA片段,具有高效的催化活性和结构识别能力。自1994年Breaker首次发现脱氧核酶以来,迄今为止已发现了几十种脱 ...

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【转帖】Nat Methods: 2014年值得关注的技术

2014年首刊,《Nature Methods》杂志将2013年度技术(Method of the Year 2013)授予了单细胞测序(single-cell sequencing)。同时,杂志还介绍了2014年值得关注的技术,包括CRISPR和基因组编辑、原位测序、迷你胞内探针、单粒子低温电子显微镜等。单细胞测序近几年来,基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展,其成果有望为一些重要的医学问题提供新的解决方案。文章总结了201 ...

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【交流】全球首次系统性检测高血压病人血浆中microRNA

摘要:对于富含miRNA的样品,如大部分组织样品,TaqMan和miRCURY平台都很有可能产生好的结果。然而,在对低丰度miRNA样品(如血浆样品)进行图谱分析时,miRCURY平台的高灵敏度和线性似乎更胜一筹。首都医科大学附属北京朝阳医院心脏中心的研究人员于7月12日在国际心血管领域顶级杂志《循环》(Circulation)发表研究论文,文中首次利用芯片(Exiqon miRCURY LNA芯片)对高血压患者和健康人 ...

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【资源】一种被广泛用于实时定量 PCR 的绿色荧光 DNA 染料

EvaGreen qPCR 荧光染料一种被广泛用于实时定量 PCR 的绿色荧光 DNA 染料 EvaGreen®是一种用于实时定量 PCR(qPCR)的 DNA 结合染料。该染料的诸多优点使它远胜于 SYBR Green I。除了有相似的光谱特性,EvaGreen 有三个主要特点使它区别于 SYBR Green I。首先,EvaGreen 对 PCR 的抑制性远小于 SYBR Green I。因此,使用EvaGreen 进行的 qPCR 实验可以使用快速 PCR 步骤。同时,EvaGreen 在实验中可以使用较高的 ...

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【转帖】无创产前诊断:迎来行业看好的最佳时机

无创产前检测技术起始于香港科学家卢煜明在孕妇血液中发现婴儿DNA的突破性研究,具有羊膜穿刺诊断无法竞争的技术优势。由于其在诊断领域的巨大前景,Illumina公司不愿放弃这一利润丰厚的领域而拒绝罗氏67亿美元的收购,更有专家学者从技术和行业上看好无创产前检测。无创产前检测技术建立在香港科学家卢煜明于1997年发现的孕妇血液中包含胎儿DNA碎片的突破性研究上,研究发现,母亲血液中游离的基因片段约15%来自胎 ...

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【交流】exosome文献交流

RNA 分泌体可以通过召回RNA聚合酶II促进转录终止Nat Struct Mol Biol. 2014 Sep 21. doi: 10.1038/nsmb.2893. The RNA exosome promotes transcription termination of backtracked RNA polymerase II.Lemay JF1, Larochelle M1, Marguerat S2, Atkinson S3, B?hler J3, Bachand F4Author information

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【交流】我的一些质粒,菌种,欢迎大家找我交换

BL21BL21(DE3)BL21 Plyss(DE3)BL21Condon Plus (DE3)BL21-AI(DE3)BL21-Trxb(DE3)BL21 gold Plyss(DE3)AD494(DE3)TB1(DE3)C41(DE3)C43(DE3)Rosetta(DE3)Rosetta2(DE3) PlyssOrigami B (DE3)Rosetta-gami-B(DE3)Rosetta-gami-B Plyss(DE3)DH5αTop10Top10F' ...

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【公告】创英生物TaqMan-MGB双标记荧光探针合成 --VIP 客户专属

创英生物TaqMan-MGB双标记荧光探针合成--VIP 客户专属TaqMan-MGB 探针与传统的TaqMan-TAMRA探针比较具有以下优势:1. 提高TM值— 平均15bases可提高18℃,这样可以使探针的长度缩短,尤其对AT含量高的序列设计有很大的帮助,并且提高配对与非配对模板间的TM值差异。2. 提高信噪比— 由于在探针的3’端的淬灭基团为不发光的荧光基团,并且与报告基因在空间的位置更接近,实验结果更精确,分辨率更高。3. 更简化实验— ...

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【原创】两步法高分辨溶解曲线(HRM)SNP分型

HRM 是SNP分型的手段之一,其特点为分型费用比较低廉,特别是应用小片段法,鄙人初次应用小片段法对10个SNP成功分型,现将实验的步骤分享,希望能给有需要的同道一点经验,同时希望能多交流,谢谢~~~两步法HRM不同于一般的HRM法在于PCR和HRM分开做,顾名思义:第一步:PCR,最好用预混的PCR试剂,我用的是宝生物的PCR Premix TaqTM,便宜又好用。第二步:HRM,将P好的产物分别加上LC Green及高低温内标, ...

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【资源】如何选择质粒

一、一个合格质粒的组成要素复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。抗生素抗性基因 可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段P/E 启动子/增强子Terms 终止信号加poly(A)信号 可以起到稳定mRNA作用二、如何阅读质粒图谱第一步:首先看Ori的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒)第二步:再看筛选标记,如抗性,决 ...

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自于形 智于心:还在用肉眼判读荧光片吗

间接免疫荧光法(IIFT)作为自身抗体检测中最经典的方法,被广泛应用的同时,却因自动化程度低下,给广大医务工作者增加了繁重的工作负担。记得曾经听到一家大型三甲医院检验科老师一句玩笑式的抱怨:“我感觉我眼睛都要被每天那么多荧光片给看绿了。”虽然这只是一句玩笑话,可作为在自免领域行业内诸如欧蒙医学诊断这样的有识之士们,却在为解决这个问题不懈努力。如今在业内逐渐兴起的荧光判读自动化趋势中,最具代表性的EUROPatt ...

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统计第七课:SPSS之两独立样本非参数检验(U检验)

接上一回【秩和检验】,这回师兄就来讲讲【秩和检验】是怎么实际操作的一、概述Mann-Whitney U 检验是用得最广泛的两独立样本秩和检验方法。简单的说,该检验是与独立样本 t 检验相对应的方法,当正态分布、方差齐性等不能达到 t 检验的要求时,可以使用该检验。其假设基础是:若两个样本有差异,则他们的中心位置将不同。二、问题为了研究某项犯罪的季节性差异,警察记录了 10 年来春季和夏季的犯罪数量,请问该项犯罪在春季和夏季有无差异。下面使用 Mann- ...

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制备动物模型的基因修饰技术

摘要:动物模型是现代生命科学研究的重要工具,特别是基因工程小鼠和大鼠,在基因功能研究、人类生理病理机制研究及新药研发中起着不可替代的作用。近几年来,制备动物模型的基因修饰技术层出不穷,这不仅包括传统ES打靶、TALEN、CRISPR/Cas9,还有TetraOneTM 基因敲除新技术。我们将对这四种技术的原理、特点、缺陷、未来发展趋势作系统的介绍和对比,供您的科研选择参考。1、传统ES打靶基因敲除:技术成熟、修饰准确、效 ...

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制备动物模型的基因修饰技术

摘要:动物模型是现代生命科学研究的重要工具,特别是基因工程小鼠和大鼠,在基因功能研究、人类生理病理机制研究及新药研发中起着不可替代的作用。近几年来,制备动物模型的基因修饰技术层出不穷,这不仅包括传统ES打靶、TALEN、CRISPR/Cas9,还有TetraOneTM 基因敲除新技术。本文将对这四种技术的原理、特点、缺陷、未来发展趋势作系统的介绍和对比,并辅以具体案例说明。自25年前小鼠胚胎干细胞(ESC)发现以来,科学 ...

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做病毒浓缩还在用超高速离心法,太 out 了!

慢病毒简介慢病毒(Lentivirus)载体是以人类免疫缺陷I型病毒为基础发展起来的基因治疗载体。区别一般的逆转录病毒载体,它对分裂细胞和非分裂细胞均具有感染能力。在转染遗传物质到细胞基因组中的工作中,重组慢病毒载体是一个强大和有效的工具,该载体可以将外源基因有效地整合到宿主染色体上,从而达到持久性表达。在感染能力方面可有效地感染包括几乎所有的哺乳动物细胞、干细胞和原代培养的细胞,目前慢病毒系统已经被广泛应 ...

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