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【共享】Micro RNA,从一窍不通到略知一二

  原来上学的时候,我们知道mRNA,tRNA和rRNA,当时只知道除了mRNA估计都不会考的,于是也就这么过来了。但做了科研才知道,原来还有MiRNA、SiRNA、LncRNA、PiwiRNA、CeRNA……当我看到看到这些的时候,我感觉整个人都不好了,感受到了科研所带来的深深的恶意……脑海里只有两个念头:“这TM是啥?”&“这TM又是啥?”  MicroRNA这几年挺火的,所以必须要知道一些相关的知识。  MicroRNA (miRNA) 是 ...

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【交流】亚基因组的定义

亚基因组的定义一,这是别人问我的两个问题的回答词:1.什么是亚基因组?我查到一些资料:披膜病毒科(Togavride)病毒,其下4个属,其中一个属是甲病毒属(Alphavirus),其Genome是单链(+)RNA,其单独即可引起完整的复制周期。而其Genome 3’末端后1/3编码数种病毒结构Propeins,含4100个核苷,这一区域也称为亚基因组mRNA(subenomic RNA),或称为26S mRNA,此区域编码病毒结构 ...

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【共享】Science:CRISPR热潮(中文翻译,附英文原文)

Science:CRISPR热潮科学家们有望利用一种细菌免疫机制开发出革命性的新型基因组编辑技术(genome-editingtechnique)。细菌虽然不会对我们真核生物产生太多的同情之心,但是它们也的确是会生病的。而且细菌得病也不是和我们人类毫无关系的,至少就会对乳制品业带来很大的影响,因为在生产酸奶和奶酪的过程中都会用到嗜热链球菌(Streptococcusthermophilus)这样一类细菌。嗜热 ...

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【共享】Nat methods:解析长链非编码RNA的新技术c-KLAN

尽管当前有多种方法可用于全面研究蛋白质编码基因的细胞内作用,然而用于系统研究与多种生物学信号通路有关的长链非编码RNAs (lncRNAs)的技术却十分有限。在这篇文章中,来自德国德累斯顿工业大学的研究人员开发了一种结合非编码RNAs敲除和定位分析的技术,称之为c-KLAN。利用这一技术对lncRNAs进行了功能鉴定和定位,并鉴别出了调控小鼠胚胎干细胞类型的转录物。在真核生物基因组中大量的蛋白质编码和非编码转 ...

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【交流】载体构建的心得

我以前做过比较多的载体构建,从来没遇到困难,因此想当然的认为这是太简单的事情,最近克隆一个基因就遇到了很多问题,花了1个月时间才成功,所以把我的经验和大家分享一下:我的目的基因是5kb左右的,因此刚开始用的是Takara的普通的premix exTaq,后来看说明说这个酶可以扩增3.7kb的产物,但Takara的网站上又说可以扩增10kb长度的产物,刚开始一直未成功,从PCR阶段就出问题了,没有目的片段,只有2kb ...

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Southern Blot Protocol

SOUTHERN BLOT PROTOCOLFollowing electrophoresis and staining of DNA, cut the agarose gel to size by removing the wells at the top of the gel (to prevent buffer transfer through the wells), and any blank or unrelated lanes that do not need to be transferred.UV treat for 5 minutes on the transilluminato ...

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【旧贴整理】启动子选择

1.启动子基础知识http://www.dxy.cn/bbs/thread/1930452http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/58370_0.html2.怎样找到启动子http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/176817_0.htmlhttp://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/176860_0.htmlht ...

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nature insight on RNAi

RNA InterferenceALEX ECCLESTON AND ANGELA K EGGLESTONSenior EditorsThe most familiar role for RNA is as a relatively passive intermediary in the translation of information from genes into proteins. But other functions for this versatile molecule have been emerging. This Insight ex ...

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【资源】DNA 纯化的问题及解决(很不错的)

DNA PurificationSibylle Herzer内容:What Criteria Could You Consider When Selecting aPurification Strategy? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168How Much Purity Does Your Application Require?. . . . . . . . 168How Much Nucleic Acid Can Be Produced from a GivenAmount of Starting Material? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 168Do You Require High Molecular Wei ...

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【交流】siRNA设计指南(经典之作,申请加分)

Using siRNA for gene silencing is a rapidly evolving tool in molecular biology. There are several methods for preparing siRNA, such as chemical synthesis, in vitro transcription, siRNA expression vectors, and PCR expression cassettes. Irrespective of which method one uses, the first step ...

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【medical-news】【资讯翻译】晚期乳腺癌个体化治疗又获进展

认领翻译的战友请跟帖注明“认领本文翻译,48小时内未完成,请其他战友认领!”欢迎大家认领校对,校对质量优秀者享受加分,投票,并奖励 5 个丁当请根据自己专业背景选择认领,如使用翻译软件翻译,被发现者扣分1-2分经常认领而不能及时提供优质稿件者将被列入黑名单,取消认领资格,请大家注意!新近参与本次活动的会员请查看:http://news.dxy.cn/bbs/topic/21537141寻找最近的翻译贴请查看:http://sear ...

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请求大家帮助!RT-PCR引物设计

各位好!我是分子生物学实验的新手。我的课题的第一步是要用RT-PCR获得全长的cDNA(接到pMD-18上),我用如下引物的话是不是无法得到所要的目的序列?因为primer5.0的评分很差的。各位好朋友能否帮帮我?Genebank Accession Number :AF144325gene:1...1758cds: 100....17311 aggagaaaag ggcgctgggg ctcggcggga ggaagtgcta gagctctcga ct ...

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[分享]oligo退火的条件

Ambion公司的protocol:将合成的DNA(长度约55nt)溶解成1ug/ul,各取2ul,加46ul退火缓冲液(100mM乙酸钾,30mMHEPES-KOH pH7.4,2mM乙酸镁),90度30min,37度1h,然后可以用来联接,或贮存于-20度。我们实验室有人按此方法成功了,我正在做。其他的非RNAi专用的退火条件有:TaKaRa:1.用STE缓冲液(10mM Tris pH8.0,50mM NaCl, 1mM EDTA)溶解DNA ...

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《Nature》:RNAi的更多功能及该领域的最新进展

几十年来生物学上最重要的进展,也许是关于RNA分子能调节基因表达的发现。RNA 干涉(RNAi)是指双链RNA分子使基因表达沉寂的现象,是在线虫中发现的,在 1998年的一篇Nature论文中被公诸于众。此后,科学家们明白,RNAi还有其他形式,它既是一种了解基因功能的强大工具,又是很多生物的基因组所采用的一种在演化上来讲很古老的防卫方法。RNAi肯定有很多新用途,RNAi还可能具有一些仍然有待去发现的天然功能。在本期 ...

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【资料】pEGFP-N1质粒图谱及信息

pEGFP-N1质粒图谱及信息多克隆位点区Restriction Map and Multiple Cloning Site of pEGFP-N1. (Unique restriction sites are in color or bold.) The Not I site follows the EGFP stop codon. The Xba I site ~undefined) is methylated in the DNA provided by CLONTECH. If you wish to digest the vector with this enzyme, you will need to transf ...

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请高手支招!基因序列查寻!

最近想从cDNA文库中钓一个基因出来,但是在PUBMED上搜索,出现很多的序列。以前我也遇见过这样的情况,但是没怎么注意,只是找到自己想要得,但是今天一个同学和我说,他找的序列结果发现没注意仔细鉴别,可能是别的基因。那么就是说,用PUBMED搜索的结果里有的不是这个基因了。不知道应该怎么确定哪个基因序列是你要的??(?)另外,打开一个序列,里面除了序列以外有很多别的东西,有的能明白,有的不知道是什么,比如:(1)STS 95 ...

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【旧帖整理】转基因生物相关

转基因动物基本概念转基因老鼠的命名1转基因老鼠的命名2外源基因导入方式及检测flox/cre recombination system 转基因动物基因打靶与核移植结合生产乳腺反应器转基因动物BALB/C小鼠质粒转基因EGFP转基因小鼠的检测转基因检测失败的原因细胞转基因丁酸钠增强基因表达bFGF的问题1bFGF的问题2AAV转基因植物转基因植物基因组DNA Southern Blot农杆菌介导的水稻转基因程序载体马铃薯 ...

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【原创】制备高效感受态细菌方法

此方法是我在国外的一个实验室工作时所用的。简单、批量、转化效率高。Simple and Efficient Method (SEM) to Make Competent CellsPreparation of Frozen Competent of DH5α1) 250 ml TB solution10mM Pipes or 10 mM Hepes, 0.65g15 mM CaCl2, 0.55g250 mM KCl, 4.66undefined55 mM MnCl2, 2.47gAll the components except for MnCl2 were mixed and the ...

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【旧帖整理】我整理的部分分子生物学

资料太多,时间有限,只整理了这些,才知道分子生物学何其博大精深。第一次整理,经验不足。申请加分。;)分子生物学理论和书http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=64&id=1205089&sty=3&keywords=%B7%D6%D7%D3%C9%FA%CE%EF%D1%A7http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=105&id=552642&sty=3&keywords=%B7%D6%D ...

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