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【原创】碱性非变性电泳配方

我的工作经验,与大家分享!碱性非变性电泳 工作液配制40%胶贮液(Acr:Bis=29:1)4×分离胶Buf(1.5 M Tris-HCl,pH 8.8):18.2 g Trisbase 溶于80ml 水,用浓HCl调pH 8.8,加水定容到100ml,4℃ 贮存4×堆积胶Buf(0.5 M Tris-HCl,pH 6.8):6 g Trisbase 溶于80ml 水,用浓HCl调pH 6.8,加水定容到100ml,4℃ 贮存10×电泳Buf(pH8.8 Tris-Gly):30.3 g Trisbase, 144 g 甘氨酸,加水定容到 ...

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[建议]发现一个重大问题:两个版本的tricine-sds-page存在很大的差异(差错)??

我看了论坛里的很多关于tricine-sds-page帖子,发现了一个很大的问题:“英文版”和“中文版”在电泳buffer的配制上存在很大的矛盾。“中文版“ 的阴,阳极buffer的pH分别是 8.25 和8.9而”英文版"的配方的pH刚好相反。 请问到底哪个版本是对的。下面是我引用的中文的版本:1,电极缓冲液要重新配制了。tricine-sds-page与一般的sds-page不同,它含有阴,阳两极缓冲液,在配制的时候pH值要注意了,不要 ...

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【资源】Proteomics Journals

http://www.swissproteomicsociety.org/links.htmlApplied Genomics and Proteomics - Open Mind Journals Briefings in Functional Genomics and Proteomics - Oxford University PressClinical Proteomics - Humana PressComparative and Functional Genomics - Wiley Current ...

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western blotting操作手册

Running Protein GelsSolutions10X Running Buffer (0.25 M Tris, 1.92 M glycine, 1% SDS)121 g Tris577 g glycine40 g SDSddh20 to 4 L (check pH at 1:10 dilution (pH=~8.8)).5X Sample Buffer (0.3125 M Tris pH 6.8, 10% SDS, 50% glycerol, 0.005% bromophenol blue, 25% 2-mercaptoethanol)1.56 ml 2M Tris pH 6.81 g SDS5 ml glycero ...

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请教质谱高人啊,这结果怎么分析啊

我的蛋白样品到上海基康公司去作简单质谱分析,利用的叫maldi-tof技术(激光解吸电离-飞行时间),可以分析样品的肽指纹图谱,他们还通过源后衰变(post souce decay,PSD)来获得一级结构数据。我得到了结果,但我实在不太懂怎么分析。看了本站的一些讨论,还是有点稀里糊涂。因为我的样品是个未知蛋白,所以我不知道哪个匹配结果可信,可信度也没什么概念。像下面这个,55的得分,27%的覆盖相似性,说明得了多少问题呢?(附件 ...

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【资源】全面归类网址:毕赤酵母表达各种来源蛋白(细菌,真菌,植物,人类等)

Heterologous Proteins Expressed in Pichia pastoris来自:http://faculty.kgi.edu/cregg/Pichia2004.htm有以下几部分组成:Protein CommentsMode, amount,signal sequenceReferences and Links分别分物种来源如下:BacteriaAlpha galactosidaseS453Bacillus licheniform ...

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【资源】蛋白质结构生物学书籍分享

Protein and Peptide Analysis by Mass SpectrometryPublisher: Humana PressNumber Of Pages: 360Publication Date: 1996-08-19Sales Rank: 1545476ISBN / ASIN: 0896033457EAN: 9780896033450Binding: HardcoverManufacturer: Humana PressStudio: Humana PressAverage Rat ...

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【资源】酶学类电子书

1.Computer Modeling of Chemical Reactions in Enzymes and Solutions (Wiley Professional)Author: Arieh WarshelPublisher: Wiley-IntersciencePublication Date: 1997-03-01Number Of Pages: 256This practical reference explores computer modeling of enzyme reations-- ...

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【共享】几个非常有用的数据库

珠蛋白基因数据库这是美国宾夕法尼亚大学创办的珠蛋白基因数据库网站。该网站主要提供研究与血红蛋白形成基因序列的数据与工具,其中包括天然存在的人血红蛋白突变体及其效应的信息,调节beta样珠蛋白基因的相关实验数据,以及用来作...http://globin.cse.psu.edu/三A类蛋白超家族数据库这是三A类蛋白超家族数据库的网站。三A类蛋白超家族是指:与不同细胞活性相联系的ATP酶,是较早的进化发明,也是当今科学 ...

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【资源】大规模蛋白质相互作用研究方法进展

摘 要:随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘,蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果蝇、线虫以及人类蛋白的大规模相互作用图谱的相继完成,不仅对系统研究细胞内各种生命活动有着重要意义,也标志着蛋白质相互作用研究方法的不断发展和完善。本文综述了当前大规模研究蛋白质相互作用的技术方法并进行了比较分析。每种技术都有其各自的优缺点,在实验中要根据不同的要求 ...

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【原创】Blast 基础知识扫盲(来自百度文库)

NCBI 的 BLast 最好生物核酸的数据库 NCBI 是在 NIH 的国立医学图书馆(NLM)的一个分支。NLM 是因 为它在创立和维护生物信息学数据库方面的经验被选择的, 而且这可 以建立一个内部的关于计算分子生物学的研究计划。NCBI 的任务是 发展新的信息学技术来帮助对那些控制健康和疾病的基本分子和遗 传过程的理解。 BLAST 是一个 NCBI 开发的序列相似搜索程序,还可作为鉴别 基因和遗传特点的手段。BLAST 能够在小于 15 秒的时间内对整个 DNA 数据库执行序列搜索。NCBI 提 ...

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请关注-纳米生物技术

纳米生物技术  活的细胞是造化所赐的天然纳米技术。如今人工纳米技术将为这种天然纳米技术提供辅助。纳米技术好像无处不在,然而,它的全部就是一种基于纳米尺度的技术,由于大分子就是纳米尺度,许多批评者认为它只是一个有趣的化学名词。最先用纳米一词的人是Eric Drexler,当时他是麻省理工大学的一名工程师,并且雄心勃勃。在他1986年写作出版的一本专著中,他极力证明:将来有一天可能会构建具有自我复制功能的纳米机器,这种机器 ...

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【转帖】蛋白质组学-常见问题

HPLC 篇1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法样品量不足:解决办法为增加样品量样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器检测器衰减太多:调整衰减即可。检测器时间常数太大:解决办法为降低时间参数检测器池窗污染:解决办法为清洗池窗。检测池中有气泡:解决办法为排气。记录仪测压范围不当:调整电压范围即可。流动相流量不合适:调整流速即可。检测器与记录仪超 ...

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【转帖】Protein Lounge数据库简介

Protein Lounge数据库Protein Lounge是系统生物学领域中的领先者。为了帮助生命科学工作者更好的理解系统生物学的复杂性,Protein Lounge已经开发了多个基于互联网的数据库和生物工具软件。系统生物学关注探索细胞间网络以及蛋白质相互作用(包括信号传导,细胞存活和细胞凋亡的机制)其目的是为了更好的发展和鉴别对不同疾病的药物选择。在后基因组时代,基因和蛋白质数据的组织是生命科学工作者最关注的问 ...

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【转载】包涵体表达的蛋白的复性

摘要 综述了包涵体形成、包涵体分离和溶解、包涵体折叠复性的方法、复性产率低下的主要因素以及通过分子伴侣、低分子量添加物等的应用而提高了蛋白质复性产率。关键词 包涵体 蛋白质 复性Abstract Strategies for decreasing the formation of inclusion bodies, isolation and resolution of inclusion bodies, refolding of inclusion body proteins and the cause of ...

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【资源】自由基与衰老关系的研究进展

自由基与衰老关系的研究进展随着老龄人口的比率越来越高,阐明衰老的机制,延缓衰老,提高老年生活质量成为日益迫切的要求。自由基在衰老的发生发展中具有重要作用,是衰老机制的研究热点,许多学者对此进行了系统深入的研究,并取得了阶段性进展,本文就此作一综述。1 衰 老1.1衰老的概述:衰老是指生物体发育成熟后,随着年龄的增长,机体在形态、结构、功能方面出现的种种不利变化,如皮肤变薄起皱、色素形成、器官老化、智力下降等,衰老是一种正常的 ...

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Zerg入门级文献推荐

题目:Protein Identification by Mass Spectrometry: Issues to be Considered出处:MCP Papers in Press. Published on November 6, 2003 as Manuscript R300012-MCP200主要观点、创新点及学术、技术意义:• 文章指出在大量运用蛋白质组技术鉴定蛋白的同时,要探究该技术的可靠性和显著性,急需制定一个运用该技术的规范标准。但由于蛋白质组技术路线和数据处理的多样性 ...

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[转帖] 电泳技术的基本原理和分类

电泳法,是指带电荷的供试品(蛋白质、核苷酸等)在惰性支持介质(如纸、醋酸纤维素、琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶等)中,于电场的作用下,向其对应的电极方向按各自的速度进行泳动,使组分分离成狭窄的区带,用适宜的检测方法记录其电泳区带图谱或计算其百分含量的方法。电泳技术的基本原理和分类  在电场中,推动带电质点运动的力(F)等于质点所带净电荷量(Q)与电场强度(E)的乘积。F=QE质点的前移同样要受到阻力(F)的影响,对于一个球形质点,服 ...

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【建议】western blot步骤

1.完成western blot实验步骤:一、蛋白样品的提取:1.弃去旧培养基,用PBS清洗2次2.加入胰酶消化,待细胞消化完成后,加入少量培养基终止消化反应3.吸取细胞至离心管中,尽可能完全收集,离心,2500rpm,5min4.弃上清,加1ml PBS清洗,将其移入EP管中,再次离心,2500rpm(13000rpm也可),5min,将残液吸取完全(-80℃冰箱内放置过夜,也可长期保存)5.向每个EP管中加入适量IP裂解液(蛋白酶 ...

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中国蛋白质组学第二届学术大会

中国蛋白质组学第二届学术大会为了迎接第三届国际蛋白质组学大会10月25-28日在我国北京召开,也为了促进我国蛋白质组学研究的向纵深发展,中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(筹)和中国人类蛋白质组组织(CHUPO)(筹)会同中国科学院大连化学物理研究所于2004年8月10-12日在辽宁省大连市联合主办中国蛋白质组学第二届学术大会。一、会议安排:  学术大会设有大会报告和分会报告二种形式、大会将邀请有关院士、 ...

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