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【求助】microRNA粗筛

gzlaotouzi 我想知道,经过芯片或者其它手段确认了的,与某一类肿瘤或者某一特定疾病相关的所有差异表达有意义的microRNA群,我可以借助哪些手段得知?shilei5794749 http://www.mir2disease.org/ —— “search by disease name”路得自己走 shilei5794749 wrote:http://www.mir2disease.org/ —— “search by disease name”这个不错!shen ...

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【求助】已经知道某个基因序列的一部分,如何得知其全长基因序列?

霍一刀hxs 各位高手,已经知道某个基因序列的一部分,如何得知其全长基因序列?首先,该序列只有mRNA序列可知。有没有专业的网站,可以根据一段cDNA序列,预测一下它的UTR区的序列?多谢。freecell RACE霍一刀hxs 谢谢freecell.霍一刀hxs BLAT Search Genome呵呵zjubell 看你是什么物种了,如果完全是未知物种,那建议全基因组测序好了,如果是细菌的基因组,整个测下来也就1万块钱左右。拿到序列后 ...

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做STAT3及pSTAT3的WB如何提蛋白?

Rachel1123 求助各位高手,RIPA裂解液提取的蛋白可以用于做STAT3的wb吗?还是需要专门提取核蛋白?多谢!顺便再问一句,stat3在胃癌细胞SGC7901中是否高表达?wangfanyun RIPA裂解液可以做stat3的WB。不需要专门提取核蛋白!zfyyzz00 一般来说,stat是转录因子,只有磷酸化的stat才有活性,它通过形成二聚体的形式进入细胞核内,和相关靶基因结合,启动靶基因转录,因此一般情况下 ...

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【求助】求问DNA单链的长度,

longyu2728 请问DNA单链的长度,eg,含30个碱基的DNA链的长度,是纳米级,还是埃级,如何计算,每个碱基大约多长呢?不胜感激!freecell one bp corresponds to circa 3.4 Å of length along the strand.longyu2728 freecell wrote:one bp corresponds to circa 3.4 Å of length along the strand.Thank you!本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前 ...

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【求助】体内转染哪个方法更好

brainpower 对大鼠进行体内转染,Muramatsu等报道在材料一致的情况下,电穿孔法的基因导入和表达效率明显高于其它方法,且适用于多种组织的操作。可是现在又不提倡电穿孔法了。因为实验经费的问题,我又不能去将一些转染方法进行对比。求助体内转染哪个方法转染效率更高?freecell 体外转染取决于细胞系,体内转染取决于组织和转染分子,不能一概论之。brainpower 谢谢你的解答。我是想转染到大鼠的腓肠肌上。那么 ...

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【求助】如何获得未知miRNA的表达情况呢

Y03013 请问XDJM,如何获得未知miRNA 的表的情况呢freecell 现在比较流行的做法是进行deep sequencing。权威的miRNA公共数据库Sanger miRBase已升级至最新的13.0版,发布的microRNA序列信息已接近10000条。由于越来越多的miRNA正在被发现,miRBase数据库每隔4~5个月就会发布新的数据版本。尽管如此,我们仍然对大量的物种miRNA信息一无所知,它们的重要生物学 ...

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【讨论】miRNA功能蛋白研究

太峰之巅 目前,对小RNA的研究进展的相当迅速,小RNA的功能蛋白如Ago,Dicer等也有相当的研究。就对小RNA新的功能作用蛋白大研究方法,高手进来畅聊。版主freecell留言:你所知道的有哪些方法?只有先提出自己的见解,才能抛砖引玉,引来更多的讨论。freecell see this post:http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=16504126&sty=1&tpg=1&age=0太峰 ...

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【求助】mRNA的表达量是升高的,能否说明那它的蛋白质的表达量也是升高的呢?

深空明月 大侠同志们:请教一下PCR检测出mRNA的表达量是升高的,能否说明那它的蛋白质的表达量也是升高的呢?如果蛋白质量是升高的,那它的机理是什么样的?如果不一定是升高的,其缘由又是什么样的啊?还有一个问题:受体分子在细胞中是有限的,当受体处于饱和状态时,受体mRNA的表达量会是什么情况呢?关于分子机制这方面的我不是很明白,请赐教。急freecell mRNA表达量升高,不一定会说明蛋白质表达量升高。这是因为在翻译过 ...

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【求助】诱导凋亡后细胞如何收集与处理

einstan001 最近本人正在做缺氧复氧诱导细胞凋亡实验,实验对象为贴壁细胞,诱导完凋亡后须收集细胞提RNA和蛋白并检测一些凋亡相关酶的活性与表达,在缺氧复氧后出现大量漂浮变圆的细胞,由于我采用采用胰酶消化的方法收集细胞后提RNA和蛋白,由于消化前需将原培基倾倒掉并用PBS洗涤细胞,因此这些漂起来变圆的细胞大量丢失,请问这些漂浮变圆的细胞我需要收集吗?这些细胞的丢失对我的实验结果影响大吗?谢谢hggjoy 需 ...

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【求助】换一种动物模型算不算创新?

jchent 有意研究wnt信号通路,但是生手不知如何下手。看到一篇文献做的是鸟的wnt相关基因表达,我想换一种动物模型,比如将鸟换成小鼠,将来可以比较二者的不同。不确定这是否可算作是科研创新?意义大吗?非常感谢!!qingguyouquan 我认为不算科研创新,是跟在别人后面走而已。不过也可以了,如果结果好的话毕业时没问题的。严格意义上的创新基本上是别人没怎么做或者没怎么涉及的,而你从另一个角度独辟蹊径,取得了一定成果 ...

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【求助】Fn实验中用的Fn是什么型号的?哪家公司的比较好

cathrynyy 请问各位大侠:我想做Fn铺板的细胞粘附实验,可是查了半天,发现有好多种,究竟用哪种型号的?哪家公司又便宜,又好用呢?谢谢!freecell Fn=纤维连接蛋白 ?究竟哪种好用,取决于所在实验室条件。同样的东西,在不同的实验室有不同的结果。一般用这个: Fibronectin, bovine plasma (Sigma, cat. no. F1141)cathrynyy 谢谢!可是我做的是人的肿瘤细胞,得用人源的吧?bovine plasma可以么 ...

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【求助】SIN18-pRLL-hEFIap-EGFP-WRPE

gtwyx 慢病毒包装质粒SIN18-pRLL-hEFIap-EGFP-WRPE,求图谱。gtwyx-fd@163.com希望得到各位战友的帮助!freecell Write to author for it.http://www.nature.com/mt/journal/v3/n1/abs/mt200115a.htmlgtwyx 谢谢楼上的战友。我想知道国内有没有用这种三质粒系统的~~~本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷 ...

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【求助】求助:关于miRNA检测与锁核酸(LNA)技术

huangaiyou 看了一篇文章,说是用锁核酸技术大大提高了northern blot检测miRNA表达水平的灵敏度。请问各位站友,这个锁核酸技术用在northern blot上,如何检测的?也是用放射性同位素吗?似乎这个锁核酸只是增加了稳定性,跟最后的检测没什么关系吧?我现在想用northern blot验证预测的miRNA,又不能用同位素标记,请问有什么可以替代的吗?我曾经看到帖子说miRNA的检测要求灵敏度高,不用放 ...

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【求助】查一蛋白在不同器官组织的表达,用什么网站?

myskite 查一蛋白在不同器官组织的表达,用什么网站?slytjiaofei 看看这个是不是有帮助!!!http://bioinfo.wilmer.jhu.edu/tiger/ydh790214 请问有小鼠的组织特异性表达查询工具吗?多谢!本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号:shixiongcoming

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【求助】测序结果分析:应该对比的序列是看max score 最大的那个序列,还是max ident最接近的序列

shaoyibo 请问BLAST测序结果后,应该对比的序列是看max score 最大的那个序列,还是max ident最接近的序列?有人说是max score 最大的那个序列,可是我发现有好几个同样分值的,到底该如何看测序结果?请大侠指教,十万火急,多谢了lmnsmu 我认为首先看max score最大的序列,同样分值的好几个,说明你blast的序列可能是个保守序列,在同一类或家族的基因均有。你可以点blast的条形图,从上到下详细去了解。 ...

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【求助】请教一个单词的翻译:counterregulatory

oluckyo 出现在一篇文献的摘要中。按照文献内容,FXR配体加强了PPARgamma配体的作用。但作者总结时说:A FXR-PPARcascade exerts counterregulatory effects in HSCs activation.我理解counterregulatory的意思是相对的作用,反作用。那不是与文章意思矛盾了么?chenlinjie686 反调节oluckyo 反调节是什么意思?本文由丁香园论坛提供,想了解更多 ...

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【求助】构建载体时,何谓正向插入与反向插入

dxyqxl 麻烦问大家一下,构建载体时,何谓正向插入与反向插入啊,两者有何区别,跑胶以后的片段长度应该是一样的吧?谢谢各位啊!slytjiaofei 载体总的大小一样,但经过酶切后产生的片段长度有区别,不然怎么鉴定是正向还是反向,有的载体只有方向正确了才能进行下一步的转染表达,建议还是多看点相关的文章!阿呆硕士 一般的克隆型载体,其方向性就不是特别重要了,它关键的是目的片段的一个载体,最典型的没有方向性的就是T-A连接了。 ...

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【求助】miRbase数据是怎么回事?

freedegree release 14和release 13整个数据全变了,同一条miRNA,基因组中的位置变了,是什么原因?是基因组数据还是miRNA数据的变了?举一个例子:ID Chromosome Start End Strand releasehsa-let-7a-1 9 95978060 95978139 + 13.0hsa-let-7a-1 9 96938239 96938318 + 14.0zhujoker 楼主真是细心,但是你关心他们的位置有什么作用?我个人认为应该是 ...

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【求助】请问 加载控制是么,为什么要选用肌动蛋白?谢谢

shidingwen 请问 加载控制是么,为什么要选用肌动蛋白?谢谢freecell 请给出“加载控制”的英文说法。shidingwen 英文是这样表达的β-actin mRNA was used as a loading controlfreecell 晕。这里的意思就是将β-actin mRNA作为对照(或者内参)。loading是“上样,加样”的意思。β-Actin中文名叫做β-肌动蛋白,是横纹肌肌纤维中的一种主要蛋白质成分,也是肌肉细丝及细胞骨架微丝的主要成分 ...

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【求助】请问pkc各亚型抑制剂有哪些

abbyalgernon 请问pkc各亚型抑制剂有哪些daixi421 我也想知道,希望博学人士给予帮助,谢谢ylhuang0502 下面网址堪称是关于PKC抑制剂的史上最全的网站,下翻至“Isozyme-Specific Protein Kinase C Inhibitors”即为著名的Calbiochem销售的PKC各亚型(多达10种亚型)抑制剂。http://www.pkclab.org/PKC/PKCbiology/PKCbiolo ...

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