前一阵子一直在做双酶切质粒重组,失败了很多次,不过很快改善了实验方法,用两周重组了 14 个质粒。现就自己的体会,结合丁香园战友的宝贵经验,谈一下质粒重组的一些个人经验。一、回收 PCR 产物在进行 PCR 扩增时候,给引物两端设计好酶切位点,一般说来,限制酶的选择非常重要,尽量选择粘端酶切和那些酶切效率高的限制酶,如 BamHI、HindIII,提前看好各公司的双切酶所用公用的 BUFFER,以及各酶在公用 BUFFER 里的效率。选好酶切位点后,在各 ...
和大家分享一下如何在新版 ensemb 查找启动子。首先,选择物种,输入基因名。比如: 搜索小鼠 Ptgs2 后,点击红圈处。点击红圈:点击 exons:5' upstream sequence 绿色部分为启动子所在位置,紫色部分是非编码区,黑色部分是编码区,蓝色区为内含子。但他所给的 5' upstream sequence 只有 50 bp,怎么办呢? 屏幕左边有个 configure this page,点击:更改数字 save and close,即可看到你想要的结果:Ensembl 除了可以用来克 ...
在互联网上,有很多软件可以解决分子生物实验人员在做实验中遇到的问题。本文提供了序列分析、实验设计阶段比较实用的软件。软件主要用于酶分析、引物设计、同源序列比较、质粒作图、结构域(motif)查找、RNA 二级结构预测、蛋白二级结构 分析、克隆策略图谱、三维结构显示等方面的内容。1. 综合性软件这类软件要求对本阶段上述的大部分功能均具备,但这类软件大多在专项分析上没有优势。推荐软件:Omiga 2.0优点:你所能想到的大部分对核酸蛋白 ...
这两年在美帝净做克隆实验了,专家不敢说,但是熟能生巧,确实积累了不少经验。我把经验写下来,希望大家少绕点弯路。1. 载体构建俗话说用欲善其事,必先利其器。我强烈建议大家在做构建之前先找好工具,这样起的效果事半功倍。这里说个笑话,我们系有个新 PHD 学生,是个印度女孩,很聪明很刻苦,她所在的实验室也很好,不过除了她之外包括老板在内都是生物物理背景的,以前一个生物 POSTDOC 在的时候还好,这个 POSTDOC 一走,整个实验室对分生就只有 ...
SCI 论文不好写,主要障碍在英语上,其实就像以前考四六级考研一样,撰写也是有规律可循,有模版可靠。Abstract越简单越好,字数控制在 150~250 words。具体怎么写呢?先简单描述一下课题的前沿背景,然后引出自己的实验(In this paper…. or Here, we…)主要陈述实验结果,可稍带提一下所用到的重要方法的名称,然后说明你的结果的意义 These data suggest….;最后总结拔高 In a word…. or In summary…..。举个栗子:Ac ...
俗话说,兵欲善其事,必先利其器。掌握一些好的软件,可以让你的科研工作达到事半功倍的效果。今天随我一起来看看分子生物学常用的一些软件,主要包括分子克隆、实验记录、文献管理。Primer Premier 5Premier 是由加拿大的 Premier 公司开发的专业用于 PCR 或测序引物以及杂交探针的设计和评估的软件。主要界面有序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites ...
陆陆续续地回到实验室,该重操旧业啦。生物学霸今年会给大家呈上更多最新技术及解读,带你装逼带你飞。今天带给大家的是冷泉港二月期刊推出的最新实验技术,一共有 五个,学起来。CRISPR–Cas9 技术构建转基因鼠Editing the Mouse Genome Using the CRISPR–Cas9 System先用细菌举例给你解释一下啥叫基因编辑,比如我想让细菌给我产一个蛋白,但是他不听话,所以我只好人工地敲掉一些基因,然后再额外给他一些基因, ...
一般单次剂量的注射剂通过灭菌的方法即可达到无菌,而对于采用低温灭菌、滤过除菌或无菌操作法制备的注射剂或多剂量包装的注射剂,均应在处方中添加适宜的抑菌剂,以防止在制造、贮藏和使用过程中可能发生的微生物污染。抑菌剂具有抑制微生物细胞生长的能力,其过剂量也可能对人体有一定的安全性隐患,所以在注射剂处方中,抑菌剂的用量既要能抑制注射液中微生物的生长,又要求对人体无毒、无害。而对于加有抑菌剂的注射剂,仍要用适宜方法除菌, ...
著名俄国诗人 Paschkin 说过「灵感是在人们不断的工作中产生的」。因此,在你的科研活动之中,一定会产生许多的灵感,有些灵感信手拈来,有些灵感苦思而得,有些灵感受人启发。当你们抓住这些灵感并将它们付诸于实践之后,便有了许多精彩的发明和创新。一个小小的发明和创新为实验的顺利进行铺平了道路,我们收集了这些小发明,希望对你们有用。1. 病理实验dingle007:病理实验常需要专业人员看片,对炎症细胞浸润我做了个设想:即在同一组 ...
概述肠球菌属(Enterococcus)细菌域,厚壁门,芽孢杆菌纲,乳杆菌目,肠球菌科;在环境中广泛存在(土壤、水、植物、动物);人类胃肠道和女性的生殖道;不同种类的肠球菌的流行取决于宿主的不同,也受年龄、饮食和其他生理条件有关的因素影响。流行病学肠球菌是内源性和外源性医院感染的第三大病原菌(检出率仅次于金黄色葡萄球菌和大肠埃希氏菌)肠球菌所致院内感染绝大多数为尿路感染(有资料统计,在引起尿路感染的致病菌中,肠球菌感染 ...
大家对大肠杆菌应该很熟悉,它是分子生物学里最常见的工程菌。基因克隆、蛋白表达,这些就是在大肠杆菌中实现的,这和大肠杆菌的结构密切相关。大肠杆菌 K12大肠杆菌是一种革兰氏阴性菌,棒状,约 2.5 微米长。有鞭毛,它的基因组由 4 639 221 个碱基对组成,至少编码 4 000 个基因。扫描电镜下的 E.coliK12 菌株最早是 1921 年从疟疾患者的粪便中分离得到,一直作为纯种保藏在实验室里,已有 75 年。大肠杆菌 K12 容易生长,并且关于它的代谢研究很多,因此它经常被用作 ...
有这么一位大牛科学家,他在《 Nature》上发表了 180 篇论文, 在《Science》上发表了 53 篇论文。想不想认识一下这位大牛呢?他就是 Robert M MayRobert M May,1936 年 1 月生于澳大利亚,悉尼大学物理学博士。1972-1975 年进入美国普林斯顿高等研究院,开启生物科学领域研究。1975 年成为世界著名的生态学者。他为人类作出哪些贡献?1. 出版专著 《模型生态系统中的复杂性与稳定性》这本书于 1973 出版。在该著作中,他一反当时人们普遍的认识,提 ...
记得硕士刚毕业时,大部分人的共识是差劲的硕士生往往找到好工作。 如今硕士毕业近 5 年,重新刷新了认识。何为差劲的硕士生?首先,这里的差劲绝对没有贬低的意思。其次,差劲也不是真的差生,而是特指一类硕士生。他们还挺聪明,又有点能力,但心思没全用在科研上。硕士期间,大部分时间他们不是潜心科研,而是去大公司实习,或者参加各种活动,交友广泛。因为没有花太多心思科研,所以发表的论文一般或者导师交代的任务完成得不够完美。自然,导师对他们也不 ...
经常提质粒吗?熟练之后,提质粒乃至质粒构建都很简单。但如果真问起一些质粒的细节,可能很多人回答不了。不信随我看看。质粒组成要素一个合格的质粒含有以下组成部分:复制起始位点 Ori 即控制复制起始的位点。原核生物 DNA 分子中只有一个复制起始点。而真核生物 DNA 分子有多个复制起始位点。抗生素抗性基因 可以便于加以检测,如 Amp+ 、Kan+。多克隆位点 MCS 克隆携带外源基因片段P/E 启动子/增强子Terms 终止信号加 poly(A)信号 可以起到稳定 mRNA 作用如 ...
我是一个身高 180,长得不怎么帅,身材有一些微胖,还曾 3 次被女朋友劈腿的科研单身狗。问我为什么会走上科研的道路?我只能说,当我上高中的时候,我是冲着当年流传甚广的「至理名言」:「二十一世纪是生物的时代」,才走上了生物医学的道路。那时,幻想着采用各种具有科幻色彩的技术手段,来改变自己和世人的命运。结果读了研究生和博士的时候,才发现,科研道路并没有想象中的那般美好。但此时,我也再无路可退。上研究生那会儿,由于刚进实验室,对实验一窍 ...
经常会有战友在版面上问:高敏 C 反应蛋白和常规 C 反应蛋白的区别,也有很多战友作出了较为科学的解释。但是总体来看,很多解释虽然正确,但过于「学术化」,用词太专业,导致很多战友难以理解。另一方面,我认识的很多临床医生,包括部分心内科的医生,都常常把这两个概念搞混,有时甚至让人哭笑不得。为便于大家理解这两个概念,我特地开个帖子,力争通过通俗易懂的语言来谈谈自己的看法。我不是生化专业的,只是看过一些高敏 C 反应蛋白的文献,所谈及的内容有不妥 ...
「菌落总数」是评价食品卫生质量的重要指标,其检测工作在某种程度上具有相当的不可比性,这就要求检测人员要严格执行科学的操作程序。国家标准GB/T4789.2 中只是简要提到了检测程序,对实际操作过程中容易出现的问题未作详细说明。本人通过实践及多次对比试验,现就检测中容易出现的问题,作一阐述。样品的制备和稀释倍数的选择对于冰冻的样品,在接种前要放到0~4℃的冰箱中解冻。固体样品要用灭菌刀或镊子从不同部位采取试验材料并混合 ...
1 设备与材料1.1 低温冰箱:-70℃1.2 高压灭菌器。1.3 多孔玻璃珠(或素烧瓷珠):直径2~3 mm。1.4 商业化细胞冻存管(可选)。2 操作步骤2.1 将直径为2-3 mm 的瓷珠分装到小螺旋帽瓶中(每瓶最多装30 粒)制成冷冻管,高压灭菌。2.2 标记冷冻管。2.3 在无菌状态下打开冷冻管。2.4 在所保藏菌种的最适营养条件下将细胞培养至稳定期或成熟期,进行纯度检查后,将菌株新鲜培养物加入到培养基中制成混悬液,无菌操作将混悬液转入到冷冻管中。2.5 封好冷冻管并颠倒四至五 ...
菌种活化:干粉标准菌株 标准贮备菌株 工作菌株;1.1 金黄色葡萄球菌、大肠埃希氏菌、铜绿假单胞菌、枯草芽孢杆菌标准菌株:挑取部分干粉溶解于0.9% 无菌氯化钠溶液中,划线接种于营养琼脂平板上,36℃±1℃ 培养18-24 小时。并观察菌落形态。a. 金黄色葡萄球菌:菌落凸起,圆形,不透明;b. 大肠埃希氏菌:菌落稍凸,圆形,湿润,乳白色;c. 铜绿假单胞菌:菌落扁平,圆形,边缘不整齐,光滑湿润,可产生蓝绿或黄绿色素;d. 枯草芽孢杆菌: 表面粗糙不透明,镜检菌体有芽孢。1.2 白色 ...
尿液的主要是由血液通过滤过、重吸收以及排泄后,最终产生的代谢产物。由于尿液的排出对于人体的水、酸碱以及电解质平衡均具有重要的价值,且与血液循环、器官功能、组织稳定性具有密不可分的联系,因此通过对尿液的量、性质、组成进行分析,能够有效诊断疾病。泌尿系统疾病通过尿常规检验即可准确诊断,并为医师选择适宜的治疗方法提供参考价值。传统的尿液检验方法主要可分为肉眼检查、显微镜检查以及化学检查 3 种。而随着科技的发展,尿液化学分析仪 ...