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        手把手教你如何查找启动子?

        生物学霸

        13618
        和大家分享一下如何在新版 ensemb 查找启动子。

        首先,选择物种,输入基因名。

        手把手教你如何查找启动子?9z_small.jpg" style="width: 640px; height: 480px;"/>

        比如: 搜索小鼠 Ptgs2 后,点击红圈处。

        手把手教你如何查找启动子?

        点击红圈:

        手把手教你如何查找启动子?

        点击 exons:

        手把手教你如何查找启动子?

        5' upstream sequence 绿色部分为启动子所在位置,紫色部分是非编码区,黑色部分是编码区,蓝色区为内含子。但他所给的 5' upstream sequence 只有 50 bp,怎么办呢? 屏幕左边有个 configure this page,点击:

        手把手教你如何查找启动子?

        更改数字 save and close,即可看到你想要的结果:

        手把手教你如何查找启动子?

        Ensembl 除了可以用来克隆启动子,还可以很直接的了解一个基因多个转录本的转录起点、SNP、蛋白信息等等,还有很多有用的地方。

        文章作者:丁香园站友@ zhao22840718

        图片来源:丁香园论坛


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