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科学问题的解决往往依赖于科学技术的革新，而高新科技获取的数据要经过处理才可以变成通俗易懂的格式。图像数据化或可视化是越来越基本的要求。之前我给大家介绍过两个关于强大软件 Imaris 的使用教程。它的功能不仅仅限于将图片输出为更美观的形式，将图片信息提取输出为统计数据，甚至针对图片的不同区域进行数据分析。它还可以将多张图片一起输出成动图，方便大家像看电影一样观看系列数据，还可以将系列数图片的数据提取出来，直观反映电 ...

相信不少人都看过很火的人生爱情大剧「知否，知否，应是绿肥红瘦」吧，而有一个超级火的宝藏翻译软件也同样值得大家关注呢！小编试用过后发现，爆火确实有爆火的道理。作为科研人员的我们总少不了阅读大量文献，理解文献内容就成了科研生活常态，而我们平时复制 PDF 内容黏贴到网页翻译的时候可能会出现多余换行而导致翻译乱码，译文与中文阅读习惯不符的情况，翻译结果很差，需要手动删除换行。是不是这种场景很是熟悉呀～为了避免不必要的烦恼，一款 ...

6 个大洲，23 个国家，86 个城市，269 个污水处理厂，1200 个活性污泥样本，这项研究的取样工作规模之大前所未有。清华大学环境学院周集中教授团队于 2019 年 5 月在 Nature 子刊 Nature Microbiology（IF 14.3）上发表文章《Global diversity and biogeography of bacterial communities in wastewater treatment plants》。该研究通过对 1200 个活性污泥样品的 16S rDNA 序列分析，加深了 ...

剖腹产手术的广泛使用拯救了许多不适合阴道分娩的妈妈的生命，随着剖腹产手术的安全性的提高，剖腹产变成了越来越多女性的选择。顺产和剖腹产对婴儿康都有哪些影响一直是大家关注的问题，今天的这项研究就是从婴儿肠道菌群的角度来解答一二。2019 年 9 月 18 日，Nature 杂志上在线发表了题为《Stunted microbiota and opportunistic pathogen colonization in caesarean-section birth》 ...

欧洲肝病患者协会(ELPA) Hep-CORE咨询小组的专家为当今欧洲广泛的肝炎活动和前景提供了一个窗口。Hep-CORE PI的Jeffrey Lazarus一直在采访他们中的一些人，询问他们是如何开始研究病毒性肝炎的，这个领域是如何变化的，以及需要进行哪些新的研究。本系列的第九次访谈是与欧洲肝病患者协会(ELPA)主席Tatjana Reic进行的。你最初是如何感染病毒性肝炎的?今天，当我回首往事时，我觉得它一定是以某种方 ...

在这篇博客中，《重症监护杂志》的高级编辑Naoshi Takeyama博士讨论了免疫肿瘤学的知识如何应用于败血症和严重创伤的管理策略。近年来，包括程序性死亡(PD)-1和细胞毒性t淋巴细胞抗原(CTLA)-4在内的一些免疫检查点抑制剂作为抗癌药物出现在临床。针对PD-1和CTLA-4蛋白的抗体对晚期黑色素瘤、肺癌和其他癌症有效。有时辅助T细胞上的检查点抑制剂蛋白表达增加，抑制T细胞受体对恶性细胞表面肿瘤细胞抗原的识别。 ...

作为体内最重要的免疫细胞之一，T 细胞在机体抗病毒、抗肿瘤等方面发挥着重要的作用。特别是在免疫治疗高速发展（如 CAR-T）的今天，T 细胞相关的免疫疗法已成为治疗恶性肿瘤的新方法，并且取得了良好的效果。但是，患者本身的 T 细胞存在功能异常，而其他供体的 T 细胞又会产生免疫排斥反应，因此阻碍了该疗法的普及。目前，关于人体细胞来源的诱导型多能干细胞（iPSC）的研究逐日增多，因此通过诱导 iPSC 定向分化为 T 细胞将会成为用于治疗的重要细胞来源。长期以 ...

2019 年 8 月 22 日，耶鲁大学教授 Sidi Chen 课题组在 Cell 杂志发表文章《Systematic Immunotherapy Target Discovery Using Genome-Scale In Vivo CRISPR Screens in CD8 T Cells》在肿瘤免疫治疗环境下对 CD8 T 细胞进行了基因组规模的 CRISPR 筛选。在重新确定了典型的免疫治疗靶点，如细胞程序性死亡蛋白 PD- 1 和 T 淋巴细胞免疫球蛋白和黏蛋白结构分子 TIM- 3 的同时，也筛选出了 Dhx37 等一批尚未在 T 细胞中鉴定过的基因 ...

近日，Nature 杂志在其官网封面独家报道了世界卫生组织（World Health Organization, WHO）在刚果民主共和国如何与子弹、政治和致命病毒作斗争。在刚果民主共和国东北部省份一个长期被遗弃的战区，对埃博拉病毒的研究正在这里取得进展。作为世界卫生组织（WHO）的总干事，Tedros Adhanom Ghebreyesus 博士的首要工作是要阻止埃博拉病毒的蔓延。此次疫情已经发展成为历史上第二大疫情。尽管有了新的埃博 ...

作为世界上最大的学术出版商，爱思唯尔每年接收数十万前沿科技论文，旗下拥有《柳叶刀》、《细胞》等高影响力期刊，是学术领域的最具权威的机构之一。图片来源：爱思唯尔官网截图同时爱思唯尔也是「臭名昭著」的学术期刊寡头，多年来「阅读和出版」两头通吃的收费模式饱受诟病：在期刊上发表论文需要付费审核，在平台上看别人已经发表的论文仍需要支付费用。年初，遭遇多国高校抵制并谈判无果之后，这家学术巨头近日似乎做出妥协。爱思唯尔和挪威高等教 ...

写论文是每一只科研狗的必修功课，今天小编想谈一个在论文中很容易被大家忽略的问题，那就是软件的引用问题。软件引用范例，图片来源于作者在论文中，不论是数据处理，还是图件制作，都少不了要用到一些科研或者商业软件。那么，该如何正确地描述和引用这些软件呢？这个时候，有些大佬们肯定报以微笑，觉得这个是个很傻的问题，直接引用软件的相关论文不就好咯？但是，并非所有的研究软件都有可以被论文作者引用的相关论文，有些软件开发者就一心研 ...

当我们得到一株菌株的全基因组序列后首先要做什么？基因组注释！那有什么方便又好用的注释神器吗？下面为大家介绍一款超好用的在线基因组注释神器 ——RAST，让大家随时随地都可以自己进行注释分析。RAST 网址为 rast.nmpdr.org，是基于 Subsystem 技术的一个针对细菌和古菌基因组的快速注释工具。它可以用来预测 ORF、rRNA、tRNA 以及相应的功能基因，并可以利用这些信息构建代谢网络。首先我们通过邮箱注册一个账号，登陆， ...

大白鲨可以杀死你，也可能救你一命。最近发表在BMC基因组学杂志上的一篇文章提供了人类几个世纪以来一直害怕的海怪的基因组学新见解，可能会让人们对一种更现代的恐惧——癌症——有了新的理解。Nickolas Marra博士和他的同事对板鳃亚纲(一种软骨类鱼类，如鲨鱼)和硬骨鱼(一种骨鳍类鱼类)的转录组分析的一项新研究揭示了进化免疫学及其对癌症发展影响的有趣新信息。这项研究的重点是七种特殊的鱼类:四种板鳃鱼(白鲨、短鳍鲭鱼、大 ...

在这篇博客中，Caitlin Connelly讨论了她最近发表在《基因组医学》上的关于预测免疫治疗反应和TMB作为潜在生物标志物的研究。免疫疗法改变了癌症治疗的格局，为一系列曾经被认为无法治愈的疾病提供了治疗，并延长了这些患者的生命。这些影响已经在越来越多的癌症类型中被观察到，包括黑色素瘤、非小细胞肺癌和膀胱癌，导致多个FDA批准。然而，严酷的现实是，大多数病人对这些新疗法没有反应，反应率在15-40%之间。加上高昂 ...

前言：本篇讲的是 SCI 论文的 abstract 写作问题，为什么写的只是 SCI 论文呢？因为除了 SCI 论文，我也没有写过其他类型的英文科技论文了，无法提供相关的个人经验。解剖 abstract 的目的，是为了获取写作其的套路。所谓「abstract 写作套路」是指精心策划的撰写 abstract 的方式方法，使用该方式方法的作者，往往已经对该方式方法熟练掌握，并且形成条件反射，逻辑上倾向于惯性使用这种文不加点的方法应对各种 SCI 论文的 abstract 撰写，心理 ...

黑色素瘤是恶性程度非常高、发病率增长最迅速的肿瘤之一。我国每年有大约 2 万新增的黑色素瘤确诊病例，而且近年来发病人群逐渐呈现年轻化态势。根据英国癌症协会的统计数据，只有大约 55% 的晚期黑色素瘤患者能够存活 1 年以上。医生一般建议黑色素瘤患者避免太阳曝晒。由于晒太阳可以补充维生素 D，这导致黑色素瘤患者体内的维生素 D 含量比常人偏低。尽管先前有研究表明，较低的维生素 D 血清浓度与较大的原位性黑色素肿瘤、较差的黑色素瘤预后效果存在关联性，但是其 ...

36 年前，是我国高等教育界值得铭记的重要一年。那年，新中国首批 18 位博士生在人民大会堂被授予博士学位，18 位有志学术的青年满含热泪地从国家领导人手中接过印有金色国徽的紫红色博士学位证书36 年前，那一批博士们俯首甘为孺子牛，为祖国现代化建设作出杰出贡献；36 年后，当代的博士们又是怎样的精神面貌呢？鲁迅先生说过：「我一向是相信进化论的，总以为将来必胜于过去，青年必胜于老人。」1. 保持自我风格便是时尚女博士：基础款为牛仔裤＋T 恤＋运动鞋， ...

生物学，是二十一世纪的朝阳产业，二十一世纪就是生物的世纪 —— 生物制药将解决癌症等威胁人类健康的重大疾病，生物技术能够引领人们进入新时代……可是，又有那么多人说生物是「万年坑专业」「劝退专业」？作为一只生物汪，笔者在生物专业从本科到博士毕业，摸爬滚打十年。如果你问生物专业值不值得选，笔者要以十年的经历告诉你真相...且听笔者慢慢道来。劝退一人学生物，胜发 7 篇 CNS？！生化环材，四大天坑专业，生物位居首位。在各大论坛活跃着一批生物劝退博 ...

今年6月，第五届癌症免疫治疗月将患者、护理人员、倡导组织、卫生保健专业人员和行业合作伙伴团结在一起，他们的共同目标是提高对癌症免疫治疗拯救生命潜力的认识。免疫疗法通常被称为生物疗法，顾名思义，就是利用免疫系统的某些部分来抗击癌症等疾病的疗法。癌症特异性免疫治疗，也称为免疫肿瘤学，是免疫治疗研究的最大领域之一。免疫疗法的类型根据所涉及的免疫治疗的具体类型，它可以启动免疫系统对癌症的反应，增强已经活跃的免疫系统活动 ...

Nature 子刊揭示运动可通过影响造血干祖细胞的活性来抑制外周炎症细胞的生成原创： 小Nature 丁香学术 今天当前，尽管心血管疾病的疗法发展迅速，但在全球范围内，动脉粥样硬化及其并发症患者的数量却在持续上升。其中，生活方式的改变，包括不健康的饮食，低体力活动和肥胖等是导致了这一全球流行病的重要原因。虽然当前的治疗策略改善颇多，但仍有很大一部分动脉粥样硬化患者发展为心肌梗塞、中风、心力衰竭或肢体缺血等症状，严重威胁患者的 ...