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        请帮忙看一下这几个引物。

        丁香园论坛

        1776
        TGFβ1 上、下游引物序列为: 5'-GGACTACTACGCCAAAGAAG-3 ’
        5’-TCAAAAGACAGCCACTCAGG-3’长度为294 bp

        TGF-[beta]1 - CGTGGAAATCAATGGGATCAG
        GGCCATGAGGAGCAGGAA

        TGF-[beta]1 - forward primer: 5'-ACCTGCAAGACCATCGACATG-3';
        reverse primer: 5'-CGAGCCTTAGTTTGGACAGGAT-3';

        TGF-[beta]1 sense primer: 5′-CTTCAGCTCCACAGAGAAGAACTGC-3′
        antisense primer: 5′-CACGATCATGTTGGACAACTGCTCC-3′
        ----
        collagen type I-- CCAGCGGTGGTTATGACTTCA
        TGCTGGCTCAGGCTCTTGA

        collagen type I-- forward primer: 5' -GAGCGGAGAGTACTGGATCGA-3';
        reverse primer: 5'-CTGACCTGTCTCCATGTTGCA-3';
        ------
        Ccollagen type III--- GCGGCTTTTCACCATATTACG
        CGTTAACAGACTTGAGTGAAGACATGA

        collagen type III----forward primer: 5'-TGCCATTGCTGGAGTTGGA-3';
        reverse primer: 5'-GAAGACATGATCTCCTCAGTGTTGA-3';
        -----
        rGlut4----GGCCATCTTCTTCTGTGGTG
        ACGATGGCCAATTGGTTGAG

        rGLUT4-----AGCCAGCCTACGCCACCATA
        GGACCCATAGCATCCGCAAC
        以上引物是在文献上查到的。我用 primer 5.0验证TGF-[beta]1 、rGLUT4有很多“FOUND”,而验证collagen type I、Ccollagen type III却不吻合,是不是基因库错了?还是引物设计不好?这种引物能不能行扩增?不知问题出在哪里?
        我用的是
        NO: Z78279
        norvegicus mRNA for collagen alpha1 type I

        NO:AJ005395
        Rattus norvegicus mRNA for collagen alpha 1 type III.

        NO: X14771
        Rat mRNA for insulin-regulatable glucose transport (IRGT)

        如果直接用primer 5.0 SEARCH 引物,能否直接用于RT-PCR,上下游引物是否一定要bp、 Tm数值相等才是最好?如果两个Tm数值不等,如何决定退火温度?产物的 Tm有什么用(意义)?
        因为刚开始学习,很多不懂。还请各位前辈指点。谢谢!
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