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        RT-PCR实验步骤

        互联网

        12412

        一、组织抽提:

        1. 取组织块50-100㎎用液氮在研钵中研磨成粉末

        2. 移入玻璃匀浆器加入1ml Trizol 抽打匀浆

        3. 移入1.5ml新离心管用5 ml针头抽打

        4. 冰上孵育5分钟

        5. 离心12,000g 4℃ 5分钟 取上清液移入1.5ml新离心管

        6. 加0.2 ml氯仿,震荡,冰上孵育5分钟

        7. 离心<12,000g 4℃ 10分钟 取上层液相移入1.5ml新离心管

        8. 加0.5 ml异丙醇,震荡,冰上孵育5分钟

        9. 离心<12,000g 4℃ 5分钟 弃去上清液

        10. 加入1 ml 75%乙醇,震荡

        11. 离心<7,500g 4℃ 5分钟 弃去上清液

        12. 室温下使之变透明

        13. 加入DEPC处理水10μl --35μl 溶解RNA( 可保存在液氮或低温冰箱)

        14. 走RNA变性电泳观察18s,28s条带,分光光度计检测260/280吸光度比值,计算RNA浓度

        二、RT反应体系(第一步):约20分钟

        RNA 抽提物

        5μl

        Radome 引物

        2μl

        RNA sin

        0.5μl

        1. 65℃ 15分钟

        2. 立即放入冰浴


        RT反应体系(第二步):约2小时

        RNA sin

        0.5μl

        10mM  dNTP

        1μl

        5×RT  缓冲液

        4μl

        25mM  MgCl2

        4μl

        AMV  逆转录酶

        3μl

        1.       37℃ 1.5小时

        2.       94℃ 5-10分钟

        3.       反应物保存于-20℃或进行PCR

        三1、PCR反应体系:约4.5小时

        25mM  MgCl2

        2μl

        10×PCR 缓冲液

        5μl

        10mM  dNTP

        1μl

        上下游引物10pmol/μl

        2.5μl×2

        CDNA模板

        2.5μl

        ddH2O

        34μl

        Taq酶

        0.5μl

        轻质石蜡油

        50μl

        100μl

        1.       94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟 为第一个步1个循环

        2.       94℃ 45秒,55℃ 40秒,72℃ 1分钟 为第二步30个循环

        3.       72℃ 10分钟

        4.       取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳


        三2、PCR反应体系:约5小时

        25mM  MgCl2

        3μl

        10×PCR 缓冲液

        5μl

        10mM  dNTP

        1μl

        上下游引物10pmol/μl

        2.5μl×2

        CDNA模板

        5μl

        ddH2O

        30μl

        Taq酶

        1μl

        轻质石蜡油

        50μl

        100μl

        1.       94℃ 2分钟,55℃ 1分钟,72℃ 2分钟 为第一个步1个循环

        2.       94℃ 45秒,50℃ 40秒,72℃ 1分钟 为第二步40个循环

        3.       72℃ 10分钟

        4.       取出后4℃ 5分钟后-20℃保存或走电泳

        四、电泳:约1.25小时

        1.       配0.5×TBE电泳缓冲液300 ml

        2.       胶浓度1.7%(40ml 0.5×TBE加0.68g胶)

        3.       微波炉中火2分钟溶解胶

        4.       冷却至60℃加入溴乙锭2μl(10mg/ml的终浓度0.5μg/ml)

        5.       放入梳子,浇板,待凝固

        6.       加8μl PCR反应产物+2μl溴酚兰

        7.       电泳50-80V(每㎝ 5V)

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