罗特分析 Rot analysis

　　系从 RNA与 DNA（单链）间的杂种双链分子的形成速度，来分析某一细胞或组织中的 RNA，是由基因组 DNA哪一部分转录来的一种方法。与分析单链 DNA间形成双链分子的速度的 COt分析相对应，而将这个 RNA－ DNA间的分析称为 ROt分析（ RNA－ COt之意）。一般使用放射性同位素标记的 DNA在 RNA过剩的条件下进行结合反应（ RNA drivenhybridization）。因 RNA过剩而 DNA浓度（ D）非常低，所以 DNA－ DNA的结合可以忽略， RNA的开始浓度（ R₀ ）在反应进行时几乎无变化，所以单链 DNA的变化速度可用 dD／ dt=— kROD来

级反应。以 D／ D₀ 为纵轴， Rot（ = R₀ t1 罗特）为横轴而绘成的曲线称为罗特曲线。一般在 DNA双链中可转录为 RNA的只是单链。所以 D₀ 中只有一半与 RN－ A结合。将 D₀ 之半值再缩至 1／ 2时 R₀ t值的定义为 R₀ t1／ 2，而 R₀ t1 ／ 2＝ 1n² ／ k。将 DNA浓度中会合的比例加以修正，则 R₀ t1／ 2= 0． 51n² ／ k。因在同样条件下 DNA－ DNA和 DNA－ RNA的结合速度常数大致相等，所以应用 DNA的碱基排列的复杂度（ G）与 Cotl／ 2的关系 G=kCotl／ 2，可求出 RNA分子群的碱基排列的复杂度（ sequence complexity）。另外，从 RNA－ DNA结合反应达到饱和水平时，形成杂种分子的 DNA比例，可求出基因组有多大部分被转录。为了求出 RNA从 DNA的哪一排列级为转录来的，应用在 DNA过剩条件下的杂种分子形成（ DNA driven hybridization）速度分析法。