Cot分析 Cot analysis
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2024
在两条具有互补碱基顺序的两个单链DNA 之间，根据重组为双链分子速度的分析来确定 DNA 碱基排列的复杂程度和排列折返频度，这种分析方法称为 Cot 分析。其反应速度与 DNA 的浓度成正比。若 DNA 样品中碱基顺序有重复，则重组速度就与重复频率成正比地增加。 1968 年 R.J.Britten 和 D.E.Kohne 按此原理，作为对含大量各种碱基重复序列的高等生物 DNA 结构分析的一种手段，提出了 Cot 分析。设 DNA 浓度为 C ，反应时间为 t ，速度常数为 K ， DNA 链的重组速度 v ，可用如下的二次函数表示，即： v=dC/dt=-KC 2 。设 DNA 的最初浓度为 C 0 ，进行积分就成为： C/C 0 =1/ （ 1 KC 0 t ），（ C 0 -C ） /C=KC 0 t ，即在一定时间后，形成双链 DNA 的量 C 0 -C 和残留的单链 DNA 的量 C 之比与 C 0 × t 成正比。将 C 0 × t 作为参数，就称为 Cot ，将 Cot 的对数作为横坐标， C/C 0 作为纵坐标的 Cot 曲线，对 DNA 样品中碱基顺序组成的分析，特别是对重复顺序的分析是很有成效的。
