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        【共享】大量质粒抽提 给像我一样在穷实验室工作的新手

        丁香园论坛

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        质粒DNA的大量提取和纯化
          在制作酶谱、测定序列、制备探针等实验中需要高纯度、高浓度的质粒DNA,为此需要大量提取质粒DNA。大量提取的质粒DNA一般需进一步纯化,常用柱层析法和氯化绝梯度离心法。
        (一)、碱法
          1、取培养至对数生长后期的含质粒的细菌培养液400ml,4℃下5000转离心15分钟,弃上清,将离心管倒置使上清液全部流尽。
        2、称重一般为3-4g.
          2、将细菌沉淀物重新悬浮于4ml/1g溶液I中,充分悬浮菌体细胞。(该步骤很重要,悬浮不充分直接影响到细菌的裂解效果,可用研棒研磨,振荡器充分震荡。然后移入80ml离心管中。)
          5、加入8ml/1g新配制的溶液II, 盖紧瓶盖,缓缓地颠倒离心管数次,以充分混匀内容物,冰浴3分钟。(时间不能太长,震荡不能太剧烈,否则基因组DNA会断裂)
          6、加6ml/1g用冰预冷的溶液III, 摇动离心管数次以混匀内容物,冰上放置10分钟,此时应形成白色絮状沉淀。
          7、4℃下12000转离心30分钟。(应该重复1---2次,直到溶液澄清,过滤无杂质。这步是成功的关键)
          8、加等体积异丙醇,室温静置10分钟, 4℃下12000转离心30分钟.
        9、加70%乙醇1――2ml进行漂洗.4℃下12000转离心10分钟.
        10、用尽量少的TE溶液溶解沉淀,加4微升RNA酶在55――65℃水浴中消化30分钟.
        11、加等体积13%PEG8000充分混匀后静置10分钟.在4℃下12000转离心30分钟.
        12、加3mlTE溶液溶解沉淀,并移入7ml 离心管中.
          13、加入等体积的饱和酚,1:1饱和酚/氯仿混合液, 氯仿,振荡混匀,进行抽提,4℃下12000g离心10分钟。
          14、取上层液加等体积无水乙醇,静置10分钟,4℃下12000g离心30分钟。
          15、沉淀用数ml 70%乙醇洗涤,4℃下12000g离心5分钟。
          16、沉淀干燥后,溶于1mlTE或水中。
        17、电泳鉴定,定量.
          [注意] 1. 提取过程中应尽量保持低温。
           2. 加入溶液II和溶液III后操作应混和,切忌剧烈振荡。
        3. 操作应该注意枪头污染.
             4. 电泳的条带和marker条带不一致,这是因为抽提的质粒不是直线状态.可能在相应bp数marker条带的前面.酶切后鉴定就会一致.
          
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