【求助】如何验证是否为环状RNA
丁香园论坛
6541
各位大侠，我现在想验证下我的RNA是否为环状RNA。请问有何高招？
我能想到的是用RNA酶进行消化，如果被消化了，那么就说明它不是环状的。
那么请问，我该选用哪种RNA酶呢？
我能想到的是用RNA酶进行消化，如果被消化了，那么就说明它不是环状的。
那么请问，我该选用哪种RNA酶呢？
这位大侠，你太牛了，两年前就开始研究环状RNA啦？我是最近刚开始接触的，我也想问这个问题，请问你现在有答案吗？如果有的话，请告之，万分感谢！
RNase R
楼上正解
nature上的文章正文中举例说的是环状RNA对RNaseR的耐受性大概在10倍，但是你看补充材料里面并不是所有的环状RNA对RNaseR的耐受性都很强，有些也会被消化，所以我觉得成环最重要的是测序结果证明头尾相连，再辅助RNaseR的数据（证明对RNaseR的耐受性），单独的RNaseR并不能确证和否认它的环形
还有个简单方法但是不普适 跑胶 环状的会有多种构象
vanasil
nature上的文章正文中举例说的是环状RNA对RNaseR的耐受性大概在10倍，但是你看补充材料里面并不是所有的环状RNA对RNaseR的耐受性都很强，有些也会被消化，所以我觉得成环最重要的是测序结果证明头尾相连，再辅助RNaseR的数据（证明对RNaseR的耐受性），单独的RNaseR并不能确证和否认它的环形
我觉得的可以控制酶的用量或者消化的时间，减少酶对环状RNA的影响
本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴
师兄微信号：shixiongcoming
