【求助】如何通过基因多态性位点预测可以与该SNP点结合的microRNA呢
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想问问，有没有一些预测网站。通过某些基因3'UTR区的rs位点预测出与该点相结合的microRNA呢？谢谢
目前好像没有这样的网站，所以你只有先确定靶基因然后与其结合的microRNA位点是否存在多态，而且一般要求SNP位于microRNA的种子序列中最好。
谢谢你，我是已经靶基因（通过文献查到的）不是通过软件预测的。但是我怎么知道他和microRNA结合的区域呢在哪里，更不知道结合区域是否存在SNP点，不好意思，我比较菜鸟，请指教
俊桃桃 wrote:
谢谢你，我是已经靶基因（通过文献查到的）不是通过软件预测的。但是我怎么知道他和microRNA结合的区域呢在哪里，更不知道结合区域是否存在SNP点，不好意思，我比较菜鸟，请指教
既然你已经明确要研究的靶基因了，那么你可以将这个靶基因名称放到microRNA预测软件中预测可能与之结合的microRNA，然后你再到PubMed数据库中查看该靶基因的3-UTR中是否含有SNP位点，如果说你预测到的microRNA与靶基因结合的区域内恰好有SNP，你就可以研究了。还有就是，软件预测的时候是会标记出于UTR什么位置结合的。
lide658 wrote:
既然你已经明确要研究的靶基因了，那么你可以将这个靶基因名称放到microRNA预测软件中预测可能与之结合的microRNA，然后你再到PubMed数据库中查看该靶基因的3-UTR中是否含有SNP位点，如果说你预测到的microRNA与靶基因结合的区域内恰好有SNP，你就可以研究了。还有就是，软件预测的时候是会标记出于UTR什么位置结合的。
谢谢，哦，我就是不知道结合UTR位置区，和靶基因3-UTR中SNP点如何看，如何看他们有什么重叠的，以前没接触过，不知道怎么弄，想和你交流下
俊桃桃 wrote:
谢谢，哦，我就是不知道结合UTR位置区，和靶基因3-UTR中SNP点如何看，如何看他们有什么重叠的，以前没接触过，不知道怎么弄，想和你交流下
那你需要现弄清楚怎么查SNP和UTR了。
lide658 wrote:
那你需要现弄清楚怎么查SNP和UTR了。
这个我会
俊桃桃 wrote:
这个我会
那你也应该知道说的啊。呵呵
lide658 wrote:
那你也应该知道说的啊。呵呵
好，再研究下
lide658 wrote:
那你也应该知道说的啊。呵呵
能私下探讨下么
snpinfo可以做，输入rs可以知道有那些miRNA结合
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