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        【求助】western blot 老做不出来

        丁香园论坛

        6728
        家请帮帮忙吧!
        我从 MDCK 细胞上抽提胞浆蛋白和核蛋白,胞浆蛋白浓度在 0.5-1.5 mg/ml 之间,核蛋白在 1.0-2.5 mg/ml 之间,然后我各用了 10ug 蛋白上样量来做 Western bolt 检测 IkB 类因子和 P65 因子,蛋白大小在 40KD 到 65KD 之间,用的是半干转 50mA,90 min, 转 0.22UmPVDF 膜后把胶拿去染色,没残留有目的条带区域蛋白,说明蛋白已经转印在膜上了,但是做了很多次了都没有曝光出条带来,用的是 supersignal ECL 试剂盒曝光的。
         
        之前怀疑所配试剂有问题,但是把所有试剂都重新配过了,还是一样的结果!实在找不出什么原因了。现在想会不会是上样量太低了?
        请帮帮忙,实验已经进行了半年了,可是一点进展都没有,心里焦急死了!谢谢回复!
        1,你的上样量肯定是够的,这个没问题。
        2,建议你下次用 0.45um 的 PDVF 膜,我的经验是,大孔径的膜比小孔径的膜更容易出条带。(不知道具体原因)
        3,半干转膜时间 1 hr 足以,不过 1.5 hr 也不是不行,这个不是主要原因。
        4,建议换一种 ECL 试剂盒曝光,例如下次再做曝光时可以先借用别人的其它型号的 ECL 试剂盒试一下,如果出来了则说明是 ECL 试剂盒的问题。
         
        就我个人认为,高度怀疑是 2 或者 4 中的某一步出了问题。
        谢谢了,学习了,我试试看能不能做出来
        改进建议:
        1、上样量加大到 30-50ug
        2、延长曝光时间

        首选1
        问一下,
        1 胶是如何配的?
        2 内参有没有跑出来?
        3 膜有没有用丽春红染色看看是否转膜成功?
        4 上样量是否足够?
        5 抗体的浓度如何配制的?
        6 换一下装膜的方法试试
        doctormy wrote:
        改进建议:
        1、上样量加大到 30-50ug
        2、延长曝光时间

        首选1


        他的浓度是 0.5-1.5mg/ml, 如果想加 30ug 就得上样 60ul-20ul,不知道有没有能上 60ul 的样
        先用 actin 之类的跑一次 WB, 如果能出来条带, 那么抗体的问题要重点考虑
         
        如果也不出来条带, 那么再考虑操作 protocol 上的问题.
        chuckdouble wrote:
        他的浓度是 0.5-1.5 mg/ml, 如果想加 30ug 就得上样 60ul-20ul, 不知道有没有能上 60ul 的样
         
         
        难道他还会不知道得重新提蛋白吗?!
        chuckdouble 战友,科研思维活跃一些好吗?!
        doctormy wrote:
        难道他还会不知道得重新提蛋白吗?!
        chuckdouble战友,科研思维活跃一些好吗?!


        呵呵, 不知道这位战友有没有自己动手养过细胞,想 cytosolic 和 nuclei 分离开,而且还要满足 30-50 的蛋白量的话,要多大的碟子上养多少数量级密度的细胞吗?

        而且他这个是细胞株还好一点,如果是原代的其他细胞的话, 要杀多少动物啊. 呵呵, 而且重新提蛋白意味着很有可能要重新造模,先不提时间和金钱, 伦理委员会将如何,呵呵
        chuckdouble wrote:
        呵呵, 不知道这位战友有没有自己动手养过细胞,想 cytosolic 和 nuclei 分离开,而且还要满足 30-50 的蛋白量的话,要多大的碟子上养多少数量级密度的细胞吗?

        而且他这个是细胞株还好一点,如果是原代的其他细胞的话, 要杀多少动物啊. 呵呵, 而且重新提蛋白意味着很有可能要重新造模,先不提时间和金钱, 伦理委员会将如何,呵呵


        没有实践就没有发言权!
         
        我曾做过四个肝癌细胞系的胞浆、胞核蛋白蛋白分离提取,通常体积小一点的细胞(如 hepG2),按两个 25 ml 的培养瓶长满 80% 左右的细胞为一组(总过约 undefined106),即便用国产的试剂盒,胞核蛋白浓度也没有下过 3.0(总量约 30ul),提蛋白的最终蛋白浓度是和很多因素(提取效率、裂解液的比例、蛋白酶抑制剂的使用等等)有关的,不单单取决于细胞数量的多少,这点亲自提过蛋白的人都会知道的。
         
        楼主的细胞为常用于病毒学研究的犬肾细胞系,其比 hepG2 略大一些,你往原代上扯什么呢?即便原代细胞就提不到 3.0 吗,呵呵,以偏概全。还有,不至于提个蛋白就把伦理委员会找来的,放心好了,:D:D,否则我身边的哥们每天得接待一两回啊!:D 还有,原代细胞数量的多少并不与动物数量成统一比例的,是要看组织来源的,这一点应该不难懂的。
         
        chuckdouble wrote:
        他的浓度是 0.5-1.5 mg/ml, 如果想加 30ug 就得上样 60ul-20ul, 不知道有没有能上 60ul 的样
         
         
        即便楼主有 60μl 的蛋白样,我想他也不会有把它们一次全加上去的想法,因为他知道他做的是 western blot,因为他肯定见过、肯定知道 western 的电泳槽是什么样子,浓缩胶上样的孔道多大、多深!:D
        换个人做一下。以我多年的经验,这属于 RP 问题……
        为什么不用丽春红把 PVDF 膜染下看看有没有转上,而去染胶呢?胶上没有蛋白不一定说明膜上一定有啊。半干法转一般都是按照膜面积来算电流的,50mA 转 90 min 是否可能转过了呢?
        我觉得 0.22 的膜就是特别不好用,我之前做一个 30 多 KD 的蛋白一直用 0.22 的膜很难做出来,后来换成 0.45 的就好多了。。强烈建议你用 0.45 的。我们实验室有做 10 几 KD 的蛋白,都用 0.45 的膜都能做出来
        lihuaibiao wrote:
        为什么不用丽春红把 PVDF 膜染下看看有没有转上,而去染胶呢?胶上没有蛋白不一定说明膜上一定有啊。半干法转一般都是按照膜面积来算电流的,50mA 转 90min 是否可能转过了呢?


        同意!先确定膜上有蛋白再讨论吧
        我觉得有这么几点需注意:
        1.用丽春红把 PVDF 膜染下看看有没有转上
        2.抗体是否结合上目的蛋白,最好用进口的抗体
        3..曝光的时间应该问题不是很大,可以稍微延长半分钟或一分钟
        1.蛋白上样量可能小了点,30-50ug 差不多,可以将蛋白样品浓缩一下;
        2.有没可能是显影液的问题,我一同学做了半年都没做出来,后面才发现是显影液出了问题,建议试试;

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

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        【求助】western blot 老做不出来

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