• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购
        点赞
        收藏
        wx-share
        分享

        病毒滴度测定方法总结

        生物学霸

        90198
        自己做过不少实验,有些心得方法总结一下分享给大家。病毒滴度的测定常见方法有以下两种:

        稀释计数法

        滴度单位:TU/mL,指每毫升中含有的具有生物活性的病毒颗粒数。「TU」为「transducing units」的缩写,中文为「转导单位」,表示可以感染并进入到靶细胞中的病毒基因组数。

        第一天 细胞准备

        将生长状态良好的 293 T 细胞消化计数后稀释至 1×100 000/mL,加入 96 孔板,100 μL/孔,为每个病毒准备 10 个孔。放入 37℃,5% 二氧化碳培养箱中培养。

        第二天 加病毒

        在 EP 管中做 10 倍梯度稀释,连续 10 个稀释度。稀释方法如下:每种病毒准备 10 个 1.5 mL EP 管,每管加入 90 μL 培养液,往第一个管中加入 10 μL 病毒原液,混匀后,吸取 10 μL 加入第二个管混匀。依此类推,做十个稀释度(10—0.00000001)。

        吸取 96 孔板中原有的培养基,加入含稀释好的病毒液。并做好标记。

        第三天 追加培养液

        在每个孔再加入 100 μL 完全培养液,利于细胞的生长。

        第五天 观察结果并计算滴度

        在荧光显微镜下观察结果,并数出最后两个有荧光的荧光细胞克隆数。假设为 X 和 Y,则滴度(TU/mL)=(X+Y×10)×1000/2/X 孔的病毒液的含量(μL)。

        定量 PCR 法

        病毒感染 1 天前,取 6 孔板接种 HOS 细胞。每孔细胞为 5×100 000 个。

        接种细胞 24 小时后,取两个孔的细胞用血球计数板计数,确定感染时细胞的实际数目,记为 N。

        弃去其他培养板中的培养基,更换为含有 5 μg/mL polybrene 的新鲜培养基。将浓缩病毒用培养基稀释 200 倍,也就是取 1 μL 病毒加入到 199 μL 的培养基中。在 3 个培养孔中分别加入 0.5 μL,5 μL 和 50 μL 的稀释病毒。

        感染开始后 20 小时,除去培养上清,换为 500 μL 含 DNaseI 的新鲜培养基。在 37℃ 消化 15 分钟,这一步是要除去残余的质粒 DNA。然后换为 2 mL 正常的培养基,继续培养 48 小时。

        用 0.5 mL 0.25% 胰酶-EDTA 溶液消化细胞,在 37℃ 放置 1 分钟。用培养基吹洗下,离心收集细胞。按照 DNeasy 试剂盒的说明抽提基因组 DNA 。每个样品管中加入 200 μL 洗脱液洗下 DNA 。用 DNA 定量试剂盒定量(Bio-Rad)。基因组 DNA 可以稳定保存在 -20℃ 至少两个月。

        准备 PCR 所需的试剂和样品。为病毒序列检测引物配总管 Ⅰ:

        ●Forward primer(100 pmol/mL):0.1μL × n

        ●Reverse primer(100 pmol/mL):0.1μL × n

        ●Probe(100 pmol/mL):0.1μL × n

        ●水:19.7 μL × n

        n = number of reactions。例如:总反应数为 40,将 1 mL 2× TaqMan Universal PCR Master Mix,4 μL forward primer,4 μL reverse primer,4 μL probe 和 788 μL 水混和。震荡后放在冰上。

        ●2× TaqMan Master Mix:25 μL × n

        ●10×RNaseP primer/probe mix:2.5 μL × n

        ●水:17.5 μL × n

        n = number of reactions。例如:总反应数为 40,将 1 mL 2× TaqMan Universal PCR Master Mix,100 μL 10×RNaseP primer/probe mix 和 700 μL 水混和。震荡后放在冰上。

        在预冷的 96 孔 PCR 板上完成 PCR 体系建立。从总管 Ⅰ 中各取 45 μL 加入到 A-D 各行的孔中,从总管 Ⅱ 中各取 45 μL 加入到 E-G 各行的孔中。

        分别取 5 μL 质粒标准品和待测样品基因组 DNA 加入到 A-D 行中,每个样品重复 1 次。另留 1 个孔加入 5 μL 的水做为无模板对照(no-template control)。

        分别取 5 μL 基因组标准品和待测样品基因组 DNA 加入到 E-G 行中,每个样品重复 1 次。另留 1 个孔加入 5 μL 的水做为无模板对照(no-template control)。

        所使用定量 PCR 仪为 ABI PRISM 7000 定量系统。循环条件设定为:50℃ 2 分钟,95℃ 10 分钟,然后是 95℃ 15 秒,60℃ 1 分钟的 40 个循环。

        数据分析:测得的 DNA 样品中整合的慢病毒载体拷贝数用基因组数加以标定,得到每基因组整合的病毒拷贝数。

        滴度(integration units per mL,IU/mL)的计算公式如下:

        IU/mL= (C ×N× D×1000)/V

        其中:C = 平均每基因组整合的病毒拷贝数;N = 感染时细胞的数目(约为 1×100000)D = 病毒载体的稀释倍数 ;V = 加入的稀释病毒的体积数。

        作者:kinky

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序