siRNA制备实验

baoyuanfei siRNA沉默基因时间短， 48小时后能测蛋白表达情况吗？freecell 一般24~72H内检测蛋白表达情况。baoyuanfei 嗯，看文献都是48h测蛋白，但是每个基因表达为蛋白的时间应该是不一样的，不知现在有没有好的方法测出这种时间？威斯腾 主要侧什么时间sszfbj 没问题zenghong808 一般都是48-72h检测的本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可 ...

zhang666fengg 急需Src siRNA干扰Src过程以及Src与NEDD4-1在胶质瘤信号转导方面的相关图片，谢谢doctormy Src siRNA干扰过程：Small interfering siRNA duplexes for Src was obtained from Dharmacon (Lafayette, CO). A scrambled sequence was used as a negative control. Transfection of siRNAswas performed ...

在设计siRNA时，人们总是关心如何地提高siRNA的效率，实际上我认为研究为什么siRNA没有效率也是一个很有意义的问题，它可以从反面给人们以启发。在思考这个问题的同时，我查到一篇文献，说是单链RNA也是可以激发RNAi途径的，这对我很新鲜，因为一直把dsRNA引发RNAi当作经典范式。文章认为，单链RNA和双链RNA都是只有一条链同RISC (rna induced silencing complex)相结合，所以其机理 ...

1. 影响基因阻断水平（Gene Knockdown Level）的因素在RNAi实验中，有许多因素影响目的基因表达的降低程度（例如:基因阻断），包括：•　转染效率•　目的基因转录效率•　蛋白稳定性•　选择特殊Stealth™RNA或者siRNA序列的效率　•　选择哺乳动物细胞系的生长特征当设计转染和RNAi实验时，需要考虑这些因素。如果需要更多的信息帮助您成功的进行RNAi实验，查阅标题为“Seven Steps Toward RNAi Success”的文献。随同 ...

siRNA构建siRNA 质粒载体的构建RNA 小片段可以通过化学合成或质粒载体转录获得。质粒载体的构建是将长约70bp的含有特定茎环以及终止信号的DNA分子插入到特定载体中，该DNA分子可以 在细胞中转录为含有特定发夹结构的RNA双链分子。这些发夹RNA分子在细胞中被切割为19-23nt的双链RNA小片段，从而起到抑制特定基因表达的作用。siRNA 质粒载体的优点与化学合成siRNA相比，siRNA 质粒载体有以下优点：1. ...

Using siRNA for gene silencing is a rapidly evolving tool in molecular biology. There are several methods for preparing siRNA, such as chemical synthesis, in vitro transcription, siRNA expression vectors, and PCR expression cassettes. Irrespective of which method one uses, the first step ...

原文见：http://www.ebiotrade.com/newsf/2003-12/B20031219174450.htmRNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”，但越来越多的证据清楚的表明，RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA干扰（RNA interference）的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识，更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具，因 ...

http://www.uniklinikum-giessen.de/bio/rnai.html这一页提供了许多RNAi公司的链接，值得加分呀！RNAi Drug Discovery CompaniesAlnylam Pharmaceuticals RNAi drug developmentBenitec RNAi stable gene silencing in transgenic miceCenix BioScience RNAi for genome-wide screening ...

在siRNA序列设计时，将潜在的序列用BLAST进行同源序列搜索时，出来的结果好象总是存在和其它编码序列同源的序列，郁闷！是不是可以只看E值？还是只看score？这个问题好菜！ 我的目的序列是Human P-glycoprotein (MDR1）中的一个片断，请问出现以下的结果如何判断这个目的序列与其它编码序列不是同源的序列？下面是BLAST的结果： Score ESequences producing significant alignm ...

Version 1.5 of siRNA DNA Designer has been released. The following features have been added.1) BLAST Engine:A BLAST Engine is now included with siRNA DNA Designer 1.5 which permits desktop analysis for potential off-target hits.The Blast engine performs a search for off-target hits using the s ...

http://www.ambion.com/techlib/tb/tb_502.htmlPublished siRNA Target SequencesApril 2003 - The significant increase in the rate of publication of siRNA target sequences has made it difficult to maintain a comprehensive list of these sequences. Therefore, we will no longer be upda ...

1. 对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列为了找到潜在靶位点，扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析，去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能，siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设计。美国著名RNA产品公司Ambion提供网上在线设计工具，帮助您更快地完成这项工作。网址为：www.ambion.com/tec ...

第一作者之一的宋尔卫(Erwei Song)是我们熟知的，他是中山大学附二院的医生，现在哈佛大学医学院血液研究中心Judy Lieberman教授组进行博士后研究。他曾发表用尾静脉快速大剂量法向小鼠体内输注siRNA成功实现耐受抗Fas单抗诱导的暴发性肝坏死。http://www.nature.com/nbt/journal/v23/n6/abs/nbt1101.html;jsessionid=EFF86FD58B3B573 ...

下载方法：登陆 www.56.com注册邮箱后登陆在【共享资源beta】里输入 gtett123 即可Table of Contents1. Ribozyme- and siRNA-Mediated mRNA Degradaion: A General Introduction2. Combination of Chemical and Enzymatic RNA Synthesis3. Determination of Kinetic Parameters for Hammerhead and Hairpin Ribo ...

大量实验表明，针对同一靶基因的不同siRNA序列具有不同的沉默效率，为了能够运用RNAi技术更有效地沉默靶基因，需要在RNAi的第一步，也是其成功与否的关键环节―siRNA序列的设计方面进行更多的改进。本文将在以下几个方面探讨siRNA序列设计方面的最新研究进展，作为应用RNAi技术时的参考。RNAi最终要通过siRNA片段与靶基因结合并使之降解，因此，确保高度同源于靶基因而绝无与其他基因同源的siRNA序 ...

siRNA Design1. Select siRNA 19-mersFirst, look around in the literature if any siRNA for your gene has been already made or have a look at siRNA Database (small though)There is a growing numbers of tools for selection of siRNA 19-mers based on a provided cDNA sequence. We use siRNA Selection Program devo ...

复旦大学生化与分子生物学实验室黄伟达所率研究小组在Biochemical Journal的九月刊上报道了如题论文。哪位大侠能下载到全文，请在DXY里共享一下，以便大家交流学习。文摘如下：http://www.biochemj.org/bj/390/bj3900675.htmBiochem. J. (2005) 390 (675–679) (Printed in Great Britain)High doses of siRNAs induce eri-1 and adar-1 gene e ...

Ambion and Applied Biosystems have joined forces to provide a complete convenient, solution for performing gene silencing experiments and validating the results by real-time RT-PCR. Ambion's Silencer™ Validated and Silencer Pre-designed siRNAs eliminate the guesswork--and t ...

siRNA DatabaseSearchable database of Silencer™ Validated and Pre-designed siRNAs to 34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database have been designed for maximum potency and specificity using a well-tested, proprietary algorithm. And silencing results are guaran ...

miRNA 是一类22 碱基左右的非编码RNA，能够被整合到沉默复合体（RISC）中，使碱基互补的目标mRNA 沉默或降解，以实现其调控作用，与生物正常的生长发育以及各种疾病如癌症和心血管疾病等的发生都有着密切的关系。单细胞miRNA表达解决方案 启因生物独家引进美国NanoString公司的多基因表达 计数系统nCounter assay system，它仅需100 ng的RNA即可对逾八百个特异的mRNA转录子进行准确的定量；它无 需酶 ...