结构基因组学

纳米技术的最终目的是使人类能够按照自己的意志操纵单个原子，在 0.1-100nm 空间尺度内制造具有特定功能的产品，实现生产方式的飞跃。纳米技术在临床中的应用是我们关注的焦点之一。然而，虽然纳米药物的研发如火如荼，但能真正上市的品种为数不多，而且几乎都集中在癌症治疗领域。造成这种情况的原因之一就是纳米技术可能会造成不确定的生物学后果。这篇文章将着重突出斑马鱼模型的特点和用途，希望此文能够对不熟悉斑马鱼的研究人员起到一 ...

题记科研之路，一入侯门深似海，从此悠哉是路人~实验之殇，雄关漫道真如铁，怎么老是撞到铁今天，老蔡就陪各位铁兄铁姐啃一块难啃的铁块-如何实现动物体内的基因转染？所谓基因转染，通俗一点说，主要指基因上下调（即 Gain of function OR loss of function）。基因工程小鼠-经典的动物体内基因干预模型最经典传统的动物体内基因干预，当属基因工程小鼠了。基因工程小鼠包括转基因小鼠，（TG mouse,transgenetic mouse ...

研究背景：基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测，探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义，这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据，其分析方法和思路都大同小异，这里分享一个多组实验设计的乳腺癌侵袭性研究芯片数据分析方法。实验设计：主要通过芯片数据筛选与乳腺癌侵袭性相关的基因和分子生物通路来 ...

dengjie19841217 各位高手们求助老板让我做地方病的基因组学，不知如何下手，拜托各路高手给我点思路吧:Is_dxding 同求，不知道怎么下手freecell 这个明天比较广泛。建议缩小范围。http://www.baigoogledu.com/s.php?hl=zh-CN&q=%B5%D8%B7%BD%B2%A1++AND+%BB%F9%D2%F2%D7%E9%D1%A7&n=2本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯 ...

细胞微管 请教老师，他指点说下一步应该做基因表达谱，这样才“心里有底”，好开展深入研究。但是我不明白，基因表达谱这类的组学研究在科研思路中，例如一个story从刚发现到完成loop的过程中，究竟处于什么样的地位？第二个问题，请教各位老师，基因表达谱的研究结果应该是哪些基因表达增加哪些降低吧？那么从这样的结果中进行信息分析、分类和建立进化树，这些对我来说比较抽象的概念又怎样提示下一步的研究方向呢？灰常感谢！细胞微管 抱歉，因 ...

伽利略 弄不太清，求教freecell 我个人认为，无论原核还是真核生物，启动子只是基因表达差异的因素之一。xiangchou812 不知楼主所说的启动子的活性是什么意思？启动子只是一段DNA序列，不是通常所说的蛋白因子等，其也有活性吗？我也是刚入门，不知启动子能否用活性一词来形容，大家可以讨论一下。向大家学习。伽利略 谢谢2楼，我同意你的看法，但是所看文献对结果的分析，是默认启动子活性没变，基因表达就没变，3楼 ，promoter a ...

huangwenshu wangjinxia198 http://genome.ucsc.edu/中Gene Sorterhttp://www.ensembl.org/index.htmlhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/中 search选基因for后填基因名查小鼠的基因可以进入http://www.informatics.jax.org/以上四个相互都有其他数据库的链接renfenglei 同意！huangwenshu 谢谢 ...

eleven1113 请问大家！http：//www.gene. ucl.ac.uk/nomenclature这是基因管理委员会的网址？但是打不开啊！比如一个基因叫做R335W它为什么是这样写啊？数字和字母分别代表什么啊？freecell 基因命名规则：White JA. Genomics, 1997, 45：468--4711 一般规则(1) 基因符号应为大写的拉丁字母或大写的拉丁字母和阿拉伯数字的组合。基因符号为了有使用的价值应尽可能地简洁, 而且不要试图 ...

CDNA第一条链的合成 （20微升体系）一、按以下顺序加样于500微升EP管中1. RNA 5 UL2. Oligo Dt 1 UL3. dNTP 1 UL (浓度10mM)4. DEPC水 5UL (为试剂盒中配套的水)共12UL混匀离心——70℃水浴5分钟——冰浴2分钟（片刻）二、继续按以下顺序加样1. 5×BUFFER 4 UL2. 0.1MDTT 2UL3. RNase Ouundefined 1UL混匀——37℃ 2分钟三、再加M-MLundefined 1 UL共20UL 混匀37 60分钟——70℃ 15分钟四、CDNA 合成完毕，4℃冰箱保存“”标识为反应酶，需 ...

“表观遗传学现在成为了肿瘤研究中的热点问题。我们现在已经很清楚肿瘤的形成都伴随着DNA甲基化和组蛋白的修饰异常。全基因组的低甲基化（hypomethylation），抑癌基因启动子CpG岛高度甲基化(hypermethylation)，众多关键基因的组蛋白密码被改变，以及组蛋白H4去已酰化和三甲基化，这些都是肿瘤细胞异常表观遗传谱的明显特征。、、、，我们有必要建立一个雄心勃勃的计划去认识肿瘤发生中DNA 甲基化和组 ...

这是根据我写的一个PPT摘录的，希望能有朋友讨论这方面的问题。并拓宽这个领域，讨论epigenetics更广泛的问题。毕竟epigenetics是现在动物功能基因组研究的主流和一个重要方向。1. 印迹基因的概念及重要意义概念:基因组印迹是特指来源于亲本的等位基因进行不对称后成修饰后而导致的单等位基因表达的现象。这种在生物进化中形成的、有规律而又受控的基因失活是机体中基因表达调节的一种重要方式。2. 研究印迹基因的重 ...

第一节 基因和基因组一、基因(gene)是合成一种功能蛋白或RNA分子所必须的全部DNA序列．一个典型的真核基因包括①编码序列—外显子(exon)②插入外显子之间的非编码序列—内合子(intron)③5'-端和3'-端非翻译区(UTR)④调控序列(可位于上述三种序列中)绝大多数真核基因是断裂基因(split-gene)，外显子不连续。二、基因组(genome)一特定生物体的整套(单倍体)遗传物质的总和，基因组的大小用全部DNA的碱基 ...

基因组学研究概述段民孝（北京市农林科学院玉米研究中心）摘 要 本文对基因组学及相关学科的概念和研究内容做了概述。21世纪是生物时代和信息时代，基因组研究由结构基因组研究转向功能基因组研究，蛋白质组学成为研究重点。基因组学研究和信息学结合产生生物信息学成为今后各个产业的支撑点。关键词 基因组学；结构基因组学；功能基因组学；蛋白质组学；生物信息学Progress on the genomics studyAbstract The content of t ...

版主，能否给我加分？第二章 从基因到基因组我们可以从多个层次来考虑基因和基因组图谱的绘制工作：一张连续的遗传图谱可以根据遗传重组频率来确定突变之间的距离（或是突变发生的位置）。它是通过对显形突变观察来确定的。因为根据遗传图上多点叠加所计算出来的遗传频率会有所偏差，而不能正确的表达基因特性。一张连续图谱也可以通过测定基因组DNA之间的重组来构造。这些断点会因为限制性内切酶的作用而产生不同的序列变化。因为这些变异 ...

随着人类基因组（测序）计划（Human genome project）的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展，越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定，基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而,怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题。为此，建立新型杂交和测序方法以对大量的遗传信息进行高效、快速的检测、分析就显得格外重要了。基因芯片（又称DNA芯片、生物芯片）技术就是 ...

基因组信息学陈润生(中科院生物物理研究所，北京100101)当前人类基因组研究已进入了“功能基因组”阶段，即将发挥出巨大的社会效益与经济效益。科学家相信生物信息学将在这一研究中起着越来越关键的作用。生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头，在获得了蛋白质编码区的信息之后进行蛋白质空间结构模拟和预测，然后依据特定蛋白质的功能进行必要的药物设计。因此基因组信息学、蛋白质的结构模拟以及药物设计就构成了生物信息 ...

大肠杆菌的基因型野生的大肠杆菌具有大约4,700 kbp的DNA分子，上面有约2,800个基因。当这些基因中有突然变异发生时，基因产物随之变化，并且有可能给大肠杆菌带来可以观察到的变化。这种能够观察到的特征叫做大肠杆菌的表现型 (Phenotype)，而把基因的构成叫做大肠杆菌的基因型 (Genotype)。通常情况下，基因工程中使用的大肠杆菌的基因型只有在基因发生变异、表现型发生变化时才被表示。但是需要特别指出时, 则在野生 ...

亚基因组的定义一，这是别人问我的两个问题的回答词：1.什么是亚基因组？我查到一些资料：披膜病毒科（Togavride）病毒，其下4个属，其中一个属是甲病毒属（Alphavirus）,其Genome是单链（+）RNA,其单独即可引起完整的复制周期。而其Genome 3’末端后1/3编码数种病毒结构Propeins,含4100个核苷,这一区域也称为亚基因组mRNA(subenomic RNA),或称为26S mRNA,此区域编码病毒结构 ...

基因组学相关软件列表1、基因组组装分析：phred, phd2fasta, phrap, consed, arachne, RePS　　2、功能注释：glimmer, genewise, genscan, fgenesh, BGF, tRNAscan-SE, MicroRNA, sim4, InterproScan, GO, WEGO, Promoter 2.0, Disembl　　3、重复序列：Repeatmasker, ReAS　　4、比较基因组：cross_match, blastall, blastz, blat, Fasta, CA ...

“常见重大疾病全基因组关联分析和药物基因组学研究”重点项目课题申报指南科技部 日期: 2009-03-10关于发布“十一五”国家高技术研究发展计划(863计划)生物和医药技术领域“常见重大疾病全基因组关联分析和药物基因组学研究”重点项目课题申报指南的通知各有关单位：全基因组关联分析和药物基因组学已经成为国际上新的研究热点，对于预防、治疗常见重大疾病具有重要战略意义。根据863 计划“十一五”发展纲要，国家决定实施“常见重大疾病 ...