DNA标记

dnazyme 每个领域都有独特的研究方法，理解其方法的优缺点特别关键，大家是否对甲基化组（甲基化谱）感兴趣？列举了一些能够通过PubMed搜到的代表性论文。Profiling DNA methylomes from microarray to genome-scale sequencing.生物芯片的方法。DNA methylome of familial breast cancer identifies distinct profiles defined by mutation ...

longyu2728 请问DNA单链的长度，eg,含30个碱基的DNA链的长度，是纳米级，还是埃级，如何计算，每个碱基大约多长呢？不胜感激！freecell one bp corresponds to circa 3.4 Å of length along the strand.longyu2728 freecell wrote:one bp corresponds to circa 3.4 Å of length along the strand.Thank you!本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前 ...

sunyong_97 ① 证明A对B具有具有调控（上调）作用。② 构建B全长及系列缺失载体，寻找顺式反应元件。③ EMSA实验确定与顺式反应元件相结合的转录因子。④ 若转录因子为已知蛋白，通过CHIP实验在体内验证转录因子与顺式反应元件相结合。⑤ 通过RNA干扰与过表达转录因子进一步验证其对B表达的影响。(实验至此可结束)⑥ 若转录因子为未知蛋白，上接步骤③，进行蛋白质谱分析、氨基酸测序、分子量分析等。吴佰霖 不错，挺合理的了不过，要在预测方面要把握好 ...

unicornshi 谁会看预测与基因调控相关miRNA分子的表，文献说根据评分结果，我看不懂怎么按评分看，谢谢大家了：）unicornshi 结果做出来了，我该选择几个相关的microRNA啊unicornshi 谢谢版主，帮我解答一下好么，谢谢拉：）minicenter 看起来与target scan里面的图类似，如果是target scan，评分的负值越大越好，自由能越高越好，由此看来，推荐楼主首选miR-145，其次是miR-42 ...

sunk33 各位有没有听说过在丙酮丁醇梭菌中有一种能够响应丁醇的启动子，就是在丁醇存在的情况下能够启动该启动子下游基因的转录谢谢zhujoker 其实你题目就是说的错的，哪有什么丁醇特异性启动子？而是你想问的是丁醇能激活什么样的特异性启动子，像这种实验你可以考虑做双向，在用不用丁醇处理的情况下看蛋白的表达情况，然后筛选。sunk33 谢谢版主指导可能说法上不严谨我想问得是在目前关于丙酮丁醇梭菌的研究中 是否存在某一个 ...

cypress1975 最近有个实验要做，但是不知道用哪种方法较好。实验目的：检测80个已知其序列的基因在肺癌细胞系的肿瘤干细胞和非肿瘤干细胞中的表达差异。用哪种方法比较可靠，而且省钱，大约需要多少经费和时间。下面这些方法那些可以用？有没有其他方法？1. 基因表达指纹（ gene expression fingerprinting， gEF.2．基因表达系统分析（ serial analysis of gene expression， sAGE）.3. cDNA3′端 ...

bingo816 芯片的结果，信息量很大，而且表达谱很复杂，哪位仁兄有没有什么关于分析基因芯片结果的好方法啊。 非常感谢！！！freecell http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19763933bingo816 非常感谢您，能不能 上传一下 文章Bioinformatics analysis of microarray data版主freecell留言:请移步到“新会员友情检索求助版”，求助文献。本文由丁香园论坛提供，想了 ...

fanjingol 请教一下各位前辈：关于JNK的抑制剂，我查阅了相关文献，只看到了SP600125(Calbiochem, San Diego, CA USA)这一种。请问有做过相关实验的前辈们，能否告知我JNK的抑制剂到底有几种？因为JNK蛋白激酶由3个基因编码,那么此抑制剂是否均抑制jnk 1和jnk 2以及JNK3，还是只针对某一个JNK基因编码的JNK蛋白激酶？换而言之，就是此种JNK抑制剂的特异性如何？请前辈们解答！谢谢了dre ...

lantianshi 我的目的基因的5‘端几个外显子转录但是不翻译，怎么解释呢？是因为被剪切掉了吗？目前为止还没人报道说有剪切型zjubell （如果排除你说的可变剪接。）因为被microRNA给沉默掉了，呵呵。miRNA是一类多细胞动物或植物基因组的前体mRNA内含子，miRNA独立转录单位或miRNA基因簇编码的19-25个核苷酸大小的内源性单链RNA，他们在转录后水平沉默特定基因从而对生物体基因表达起到精细调 ...

太阳星辰 谈到癌基因修饰时，是指那些甲基化、磷酸化？还是指用某种基因去修饰癌细胞？我对这个概念不太清楚，请各位老师赐教！太阳星辰 帮帮忙，老师要求查文献写综述，可我查了一下午好像也没弄明白。开始理解的是表观遗传学，后来感觉又觉得不对。我检索时应该用什么关键词呢？zhujoker 其实癌基因很多，你老板这样跟你说是不负责任的，不过在很大程度上也是为了锻炼你。让你尽可能的搜索更多的文献来充实你。而癌基因的修饰也是可以从不同层面来 ...

qingshi 比如c57和balb/c这两种小鼠，一种是黑色一种是白色，除了控制他的毛发的基因不同外，他们的主要组织相容性抗原是不同的。那除了这种类似的管家基因外，诱导表达的基因，比如说vegf tnf－a il-10 这类的基因相应的基因组序列（包括启动子区域）有什么不同么？ncbi数据库只有c57小鼠的基因组，我如何寻找balb/c的基因组序列？？？？很困惑。。。ps：为了博得关注，有点标题党的味道。。。抱歉。。。zjubell 他们基因 ...

挥汗如雨 真核生物修饰或调节基因与目标基因的位置关系如何？最近在真核生物线虫中发现一个类毒素基因簇，并应有反向PCR获得了这个基因簇的旁侧序列，在其旁侧序列中存在大量调控基因（如RNA结合蛋白基因、DNA结合蛋白基因等）和修饰基因（如甲基化基因，转运基因等）。这些调控和修饰基因在多种原核生物（如蓝细菌、放线菌等）的毒素或抗生素基因簇中被发现和报道，报道认为这些基因是基因簇的一部分，对该毒素或抗生素的合成起到调控或修 ...

bahai 大家好，最近开始课题，有一想法，不知道是否可行，说来请大家给指点迷津，先行谢过各位！比如，我想研究某一肿瘤，最近对一个病人的肿瘤细胞进行培养后，进行染色体核型分析发现：随即取的所有细胞的核型完全一致，而且，染色体缺失发生的地方都在相同染色体的相同部位。由此可见，至少在来自该病人的肿瘤组织经培养后的这些细胞应该是来自同一个克隆群的。于是检索，对此肿瘤染色体核型研究的论文寥寥可数，而且都是在早年，此类研究仅仅报 ...

张明建 假基因是没有功能的基因，要说应该不能表达才是，可为什么有的文献说某某假基因的表达可以影响某某疾病呐？比如，在Pubmeb上看到假基因pseudogene的表达可以影响前列腺癌的发病pseudogene与processed pseudogene是一回事吗zhujoker 能否把文章发上来大家一起看啊？因为你这样说没有证据战友们无从下手啊。理论上来说，pseudogene与processed pseudogene是 ...

xhxhk 染色体 2q33 什么意思？是第几条的什么位点？zhujoker 2号染色体长臂33区glliutjmu 2号染色体长臂3区3带中间没有.,呵呵。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

藤崽 请教各位，有没有什么方法检测细胞染色体的完整性，比如说我对一群细胞处理后，我有没有方法检测他们的染色体完整性！最好是分子生物学的方法。lmnsmu 没有特别好的方法，我们只是进行电泳，结果是一个条带，并且比较清晰且分子量较大，提示提取的DNA完整性较好；如果一个样品出现许多带，提示有断裂等发生，完整性不好。藤崽 谢谢 Imnsmu！是这样的，我热处理细胞（70度5分钟），细胞应该死亡，（我觉得应该死亡了，是不是？）但是我想觉得它 ...

wings_008 如题，如果我用一种干预方式使A基因的表达水平上调或下调，那其的受体B，也会随着相应上调或下调吗？B是A的唯一受体望赐教！freecell 个人意见：不会。A上调或者下调，只能说明结合B的A多了或者少了。一个基因的表达是和其上游事件相关的。zjubell freecell wrote:个人意见：不会。A上调或者下调，只能说明结合B的A多了或者少了。一个基因的表达是和其上游事件相关的。我的观点是不一定：就如你所说， ...

every366 什么是歧化基因？多谢！iscience 王琳芳《医学分子生物学原理》上面说到了这个概念。具体怎样的，不记得了。小舟儿 iscience wrote:王琳芳《医学分子生物学原理》上面说到了这个概念。具体怎样的，不记得了。依据王琳芳《医学分子生物学原理》：歧化基因即为假基因！本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

丁一凡 近来看到关于重叠基因的资料，但是我看到很多资料有两种：1. 重叠基因都是存在于病毒等简单的生物的基因组中，而像高等的生物等复杂生物基因组中不含有重叠基因2.哺乳动物中的重叠基因(比较基因组)信息来源：生物中国人　更新时间：2004-6-20 17:26:00人的基因组有32亿左右碱基，但却只有约3万5千个编码蛋白的基因。按道理来说，每个基因应该可以“分到”比较多的长度，但是，令人不解的是，在哺乳动物基因组中存在大量的重叠基因（ ...

学习着 启动子上可以有多个不同的非经典的TATA-box吗？thomasz TATA有一个就够了。如果有多个TATA，就会有多个TFIID的结合位点，就会在多处装配出RNA合成机器。对于一个启动子来说，就算有多个TATAAA序列，同一时间也只有一个起作用吧。一个基因可以对应多个启动子，搜索一下关键词alternative promoter。启动子上可以有别的转录起始元件，比如Inr，DPE等等。学习着 在同一时间确实应该只有一 ...