DNA标记

zgq8888 求助：我想做一个QPCR检测肝癌组织及正常组织的一个基因表达，我是用哪个做标准品建立标准曲线；另外关于人的内参NAPDH的引物序列，不同文献不同，我应该怎样选择。谢谢zjubell 你要做绝对定量还是相对定量？既然你提取用内参，那应该就是相对定量了所以不需要标准品做标准曲线。但你需要对你的两对引物进行扩增效率测试也是10倍稀释，就拿cDNA即可。如果两个梯度间的Ct值差异刚好是3.326,就非常好了，达 ...

zhangfen5667 因实验需要，想学习关于基因克隆和表观遗传学的基础知识及实验技术，该看什么书或是有什么好的建议吗？bigbang_0_0 分子克隆第三版adamsw 楼上正解，或者你也可以看看current protocol in molecular biology，这个的话不知道你们学校图书馆订了这个没有，是Wiley的，属于current protocol丛书系列，很全很详细。zhangfen5667 谢谢前辈们的指教！:)本文由丁香 ...

带刺蔷薇 各位大侠：我的芯片实验已做完，公司给了差异基因和PATHWAY,GO等分析结果。可我有一大堆的问题和困惑：1.因为公司用了两套软件（Beadstation,genespring）来分析我的结果，所以差异基因有两套，可差别很大，公司说选择和我想要的结果相近的那一套。2.可我怎样从筛选出的几千个差异基因中找到我想要的几个基因呢？查文献？人家已经研究过的我再重复做也没意义了呀！在数据库中找线索？合算序列数据库有好几 ...

fenglei_1 想知道一个基因的读法（JARID1B），希望了解的老师同学不吝赐教，先说声谢谢了freecell Jumonji, AT rich interactive domain 1Badamsw 全称的话就是按照楼上的那样，要是就想读的话，我觉得就按字面拼就可以，【dʒʌrid one B】，读着顺口差不多就行了。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixion ...

rendangli NF-KB与IL-8 promter区域可以结合，荧光素酶报告基因已经验证了，他们之间还有没有可能存在其他作用方式ylhuang0502 1. Co-IP to test they can physically associate/bind.2. If you can get positive data from #1 experiment, you may try NF-KB inhibitor to see if it can block the associate between NF-KB and IL-8.Good luck! ...

种瓜种豆3 如何描述一个基因在染色体的位置?比如说某基因位于8p12.23, 8q10.12等怎么正确理解这个意思?看了书,查了下,竟然查不到!请懂行的战友告诉下,谢谢版主freecell留言:求助问题时，尽量在标题把问题表述清楚。侠骨仁医 每条显带染色体根据ISCN规定的界标（landmark）分为若干个区（region），每个区又包括若干带（band）。界标包括染色体两臂的末端、着丝粒和某些明显恒定的带。两相邻界标之间为区。每 ...

fanxiaochou 请教：CONSTANS(CO）是什么？谢谢slytjiaofei CONSTANS是一个基因的名字，CO是它的缩写，建议自己先在baidu上搜搜，以下链接可参考以下！！！http://d.wanfangdata.com.cn/Periodical_fdxb200605021.aspxfanxiaochou CONSTANS是长日照途径上控制开花的基因，这个基因的具体信息查不到，想多了解一点。qzhaojing ...

yehuanlr 本人是新手，所以说得不专业的地方，敬请谅解！别人建立了cDNA文库，通过对文库的分析，分析了一些新的基因，在数据库中没有发现其同源序列，他只通过RT-PCR确定了这几个新基因在某些组织中转录，就此推断了该基因具有的可能功能。这些功能正好是我所想研究的，所以想研究这些基因。但是我所研究的鱼繁殖周期很长，全人工繁殖几乎还没有实现，而且没有卵子或精子给我做。请问各位前辈，具体我该怎么研究啊！！！敬请指导，十分 ...

biophysics hsa-mir-941-4MI0005766 在miRbase上没有相应的染色体位置什么原因？LBN chromosome: 20; Location: 20q13.33 See MIR941-4 in MapViewerbiophysics 谢谢，我已经得到了位置了，hsa-mir-941-4MI0005766206255084562550935+没想到miRbase也会犯这样的错误啊，呵呵本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意 ...

jing1209 HR includes gene conversion of the XhoI site without an associated crossover or deletion of one GFP copy by crossover or single-strand annealing.非常感谢！！！LoftyMan HR是不包括主动交换的相关基因交换或单GFP拷贝缺失，也是不包括单链变换的相关基因交换或单GFP拷贝缺失的XhoI区域基因变换jing1209 谢谢LoftyMan， ...

ariel_l 我想问下大家，有没有在做研究启动子活性的时候，在已报道的启动子比如CMV，SV40的下游加入自己的已被先前试验证明可有效启动外源基因转录的一个调控元件片段，结果反而外源基因的表达效率降低了的情况？（这个表达效率降低是和只有强启动子CMV/SV40，而没有自己的调控元件片段的情况对比的结果。）slytjiaofei 【标题】HRE／CMV启动子的克隆和缺氧调控活性的测定【作者】杨洁 杜德伟 李占亭 贾林涛 赵晶 许彦鸣 杨安钢 孙脊峰 ...

starwink 求助对基因芯片结果进行染色体富集和组织表达富集分析的软件，GOTM目前已不能进行以上两方面的分析starwink Gene Ontology Tree Machine在线分析数据库以前可以对多个基因进行组织表达和染色体分布的富集分析，现在不能用了，有其他的相关在线数据分析软件或平台吗？请指教，谢谢！！freecell Try...http://www.geneontology.org/GO.tools.microarra ...

liuwenbinahslyy 基因芯片数据分析时，比值大于2.0或者小于0.5被认为是有表达差异，为什么要相差两倍呢？这个比值与PCR或Western blot验证时的基因或蛋白表达差异是否是一致的(即是否也是相差两倍以上)？按理说PCR或Western blot检测表达差异根本不需要相差两倍以上，这还取决于重复实验的次数及数据的分布情况。zjubell liuwenbinahslyy wrote:基因芯片数据分析时，比值大于 ...

duanshengyu0223 请问大家一下stk15这个基因一般都是做的那些位点啊侠骨仁医 stk15应该就是Aurora Kinase，目前做的比较多的多态性是T91A F31I Phe31Ile，但是在不同肿瘤和STK15多态性的关联是不一样的，关键看你的研究目的。建议楼主自己好好复习文献，应该可以得到不少启发，附上两篇相关我文献。duanshengyu0223 嗯，谢谢了啊，因为最近在做这个基因关于结直肠癌方面的论文，所以 ...

zenth197 请问有做early polyadenylation的前辈或者熟悉这方面工作的前辈吗？可以否介绍下相关的研究方法？我现在对于设计特异的扩增目的基因early polyadenylation产物的引物感到很困惑，希望能得到大家的帮助。感激不尽！freecell http://scholar.google.com/scholar?as_q=%22early+polyadenylation%22&num=100&btnG= ...

biophysics 网上有无数多的转录因子结合位点预测工具，我想问的是这些预测的位点全部是基于染色体的正链吗？因为数据库是以正链为序列的。那如果一个基因转录的模板链如果是负链的话，那转录因子结合位点的预测不是错了？freecell 一般是根据mRNA序列来预测的。biophysics 谢谢，文献报道的全基因组转录因子位点预测如何做的呢？是要从细胞中提总mRNA，反转录测序再预测还是怎么做？全基因组的mRNA序列好象不 ...

galaxyzj 我有一个真核表达载体，包含一个Iba1启动子，来源于巨噬细胞的特异性基因Iba1，因此是个组织特异性的启动子，用来控制GFP的表达。启动子的结构见图1，其中加框部分是外显子序列。载体的结构见图2。载体的构建人说，这个载体的开放阅读框起始是Iba1基因自身的ATG，也就是图1里面Exon1内部加了下划红线ATG，GFP的起始密码ATG也是在一个读码框内。因此，这个载体最后表达GFP蛋白，并且N端融合 ...

ybcz1974 本人刚刚涉及分子生物学领域，可能说得很不转业，请勿见笑！最近想做一种非整数倍染色体病的研究，有几个问题想请教大家：1、如果这种疾病是由于某一条染色体多一条引起，除了基因（DNA）数量上的改变，会不会出现基因组的差异，例如出现新的基因？或者基因突变？2、通过患者与对照血清基因筛选是否有意义？有没有可能发现基因表达差异？如何进行基因筛选？3、每条染色体都表达数百种基因，通过何种方法可以找到某条染色体特异性 ...

coco0663 P53NM_000546.4Transcript Variant: This variant (1) is a dominant transcript and encodes isoform a.麻烦高手看下，这是野生型P53还是突变型P53？Transcript Variant是否突变型的意思，那么NM_000546.4 所转录的是否就是突变型的P53？谢谢侠骨仁医 Transcript Variant的意思是变异体的意思，应该不是突变的意思，看了一下，人类 ...

mnidr 我想做拟南芥基因和烟草基因的NORTHERN，想选择β-actin作为内参，请问，在拟南芥和烟草中β-actin的序列是一样的吗？如果在更远的物种里呢，比如动物？？？？freecell 脊椎动物中不同物种的β-actin基因氨基酸之间的序列同源性超过98%。其它种属不清楚，你可以在NCBI里面blast一下。sherwing2009 可以在NCBI中，blast一下，相似性应该很高detector350 有一定相似度， ...