化学生物学实验技术

在所有RNA实验中，最关键的因素是分离得到全长的RNA。而实验失败的主要原因是核糖核酸酶（RNA酶）的污染。由于RNA酶广泛存在而稳定，一般反应不需要辅助因子。因而RNA制剂中只要存在少量的RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解，而所制备的RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果，所以RNA的制备与分析操作难度极大。 在实验中，一方面要严格控制外源性RNA酶的污染；另一方面 ...

阴离子交换剂与阳离子交换剂的装柱和层析过程基本相同。交联葡聚糖的预处理只需充分溶胀和平衡，不需要除去细粒碎片和酸碱处理。其他步骤也基本同离子交换纤维素。1．剂型的选择 根据蛋白质在所用缓冲液pH值下带电荷的种类选择，如pH高于蛋白质等电点，应选阴离子交换剂，反之应选阳离子交换剂。一般情况下，DEAE-纤维素用于分离酸性蛋白，而CM纤维素用于分离碱性蛋白质。 下面以DEAE-纤维素操作为例， ...

1，丙酮沉淀法；三氯醋酸沉淀法 试验要求的仪器简单，但是常常导致蛋白质变性。 2，免疫沉淀法：得有特异性抗体！ 3，硫酸铵沉淀法：利用高浓度盐将蛋白质析出（盐析） 选择硫酸按是因为：盐析有效性，pH范围广，溶解度高，溶液散热少，经济！ 4，（低温）有机溶剂沉淀法：强调低温（0-4度以下）是因为10度时蛋白会在有机溶剂中变性，可用乙醇，丙酮……注意：Mg2 离子，pH值 5，聚乙二醇沉淀法：使用PE ...

体外制备 1.化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高，定制周期长，特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高，为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了，比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于：已经找到最有效的siRNA的情况下，需要大量siRNA进行研究不适用于：筛选siRNA等长时间的研究，主要原因是价格因 ...

比较项目化学合成体外转录RNase III降解dsRNAsiRNA表达载体PCR表达框材料需求 21-mer RNAoligos(一对)29-mer DNA oligos(一对)转录模版 (200-1000bp，两侧带T7 启动子)55-60-mer DNA oligos(一对) ~50-mer DNA oligos(一对)全部制备/合成时间所需时间4天—2周24 小时 DNA oligo合成 ...

　　以蛋白质和结构与功能为基础，从分子水平上认识生命现象，已经成为现代生物学发展的主要方向，研究蛋白质，首先要得到高度纯化并具有生物活性的目的物质。蛋白质的制备工作涉及物理、化学和生物等各方面知识，但基本原理不外乎两方面。一是得用混合物中几个组分分配率的差别，把它们分配到可用机械方法分离的两个或几个物相中，如盐析，有机溶剂提取，层析和结晶等；二是将混合物置于单一物相中，通过物理力场的作用使各组分分 ...

　　大部分蛋白质都可溶于水、稀盐、稀酸或碱溶液，少数与脂类结合的蛋白质则溶于乙醇、丙酮、丁醇等有机溶剂中，因些，可采用不同溶剂提取分离和纯化蛋白质及酶。一、水溶液提取法　　稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂，通常用量是原材料体积的1-5倍，提取时需要均匀的搅拌，以利于蛋白质的溶解。提取的温度要视有效成份性质而定。一方面，多数蛋白质的溶解度随着温度的升高而增大 ...

一、直接法1．标本经固定后，PBS洗涤3×3分钟。2．加荧光素标记的抗体，湿盒内37℃孵育50分钟。3．PBS洗涤3×3分钟。4．0.1％伊文氏兰复染。5．PBS洗3次，蒸馏水洗2次，每次3分钟，以除去NaCl结晶。6．缓冲甘油封片，镜检。二、间接法1．标本固定后，PBS洗涤3×3分钟。2．滴加一抗，37℃ 40分钟或4℃过夜。3．PBS洗涤3×3分钟。4．滴加荧光标记二抗37℃ 40分钟。5．P ...

1．临用之前制备羟胺溶液，置冰上待用。2．将用氯化铯纯化的10μg质粒DNA加到含500μl羟胺溶液的微型离心管。3．在37℃下培养20小时。4．加入10μl的5mol/L NaCl、50μg 1mg/ml的牛血清蛋白（BSA）和1ml无水乙醇终止反应，置－70℃沉淀DNA10分钟。5．离心10分钟，小心弃去所有上清液，收集DNA。6．将DNA悬浮于100μl TE缓冲液（pH8）中，再加入10μ ...

运用随机引物扩增寻找多态性DNA片段可作为分子标记。这种方法即为RAPD(Random amplified polymorphic DNA ，随机扩增的多态性DNA)。尽管RAPD技术诞生的时间很短 但由于其独特的检测DNA多态性的方式以及快速、简便的特点使这个技术已渗透于基因组研究的各个方面。该RAPD技术建立于PCR技术基础上它是利用一系列(通常数百个)不同的随机排列碱基顺序的寡聚核苷酸单链( ...

此法抽提的酵母蛋白适用于SDS凝胶电泳和Western印迹分析。1．从OD600＝2的细胞培养物中抽提酵母蛋白质。培养物的一种简单制备方法是将细胞接种到5ml YPD中，过夜培养后获得指数培养物（OD600＝0.5～2.0）。2．在水浴上把OD600＝2的细胞培养物转到含有2ml的50mmol/L Tris-HCl(pH7.5)、10mmol/L叠氮化钠溶液的13mm离心管中，用吊篮式医用离心机离 ...

1、脱蜡： 1）二甲苯脱蜡3次，每次5min； 2）100％酒精两次，每次2min； 3）移出酒精，斜置切片，标记末段向下，空气干燥。 2、蛋白酶处理: 1）每个染色缸40ml蛋白酶K消化溶液，配制方法如下：2×SSC 40ml倒人Facal管，在水浴槽中预热。将消化酶液加入管内，摇动直到酶溶解。 2） 37℃水浴槽中预热染色缸和蛋白酶K溶液。37℃孵 ...

　　1．组织处理　　（1）冷冻切片：厚10～20μm，贴于事先经清洁处理及涂有粘附剂的切片上。切片保存于-80℃，在应用于杂交实验前，使迅速回升到室温，干燥，固定于3%多聚甲醛-PBS溶液中，pH7.4。PBS漂洗5min×3，孵育在2×SSc 10min。　　（2）石蜡包埋切片：浸入二甲苯10min移除石蜡，以100%乙醇10min ×2，空气干燥10min，从高到低梯度乙醇（95%，80%，7 ...

1、使用地高辛标记的核酸探针进行石蜡切片的RNA原位杂交第一天 1） 二甲苯于37℃脱蜡2次，每次15分钟； 2） 无水乙醇浸泡2次，每次3分钟； 3） 95%乙醇浸泡2次，每次3分钟； 4） PBS清洗3分钟； 5） 2%焦碳酸二乙酯室温下浸泡10分钟； 6） PBS清洗10分钟； 7） 加入胃蛋白酶25ul/ml，37℃孵育15分钟； 8） PB ...

一、酵母DNA微量制备（40ml）1．在125ml三角瓶中用40ml YPD培养液在30℃条件下培养细胞达最大生长量（过夜）。2．将上述培养物移入螺盖离心管，用医用离心机或Sorvall SS－34转头以5000r/min离心5分钟，弃去上清液。3．将细胞悬浮在3ml的0.9mol/L山梨醇－0.1mol/L Na2EDTA(pH7.5)溶液中。4．加0.1ml的2.5mg/ml消解酶100T，置 ...

酶促生物素标记cRNA探针基本方法和放射性标记cRNA探针同，所不同的是探针浓度为2.5μg/μl。显示探针反应步骤如下。　　（1）用PBS冲洗粘附有切片的载片2×3min。根据情况也可用漂洗法。　　（2）将载片浸入0.3%H2O2在PBS或甲醇内30min以封闭内源性过氧化物酶。　　（3）PBS冲洗2×3min，用吸水纸拭干切片周围的水份，加入小鼠抗生物素血清1：100和PBS含正常羊血清（1： ...

　　1．组织前处理在组织制片中以冷冻切片（厚10～30μm）最佳。切片贴在预先清洁，高温处理并涂以粘附剂载玻片上，先在37℃预干燥4h，然后置于37℃烤箱中过夜。经过上述处理的切片如在-20℃可保存2～3周，在-70℃可保存数月之久，有报告可保存数年之久的。但仍以新鲜制片为好。如为石蜡包埋切片，应脱蜡经梯度酒精入水。一般不提倡浸入二甲苯溶液。但在细胞内mRNA含量高时应用二甲苯脱蜡后仍能显示。经水 ...

　　1．组织前处理　　（1）固定：组织以10%中性福尔马林液或Bouins液固定，常规石蜡包埋，切片厚4～6μm，粘附于涂有粘附剂的玻片上，入烤箱60～80℃6～8h，使切片更紧贴玻片。　　（2）脱蜡：二甲苯10min ×2，自100%乙醇，90%，70%，50%，30%各5min。入PBS（含5mmol/l MgCl2pH7.3～7.4）10min×2。入0.2n HCl 20min以进一步去除 ...

　　（1）细胞核的分离：将培养的细胞制成细胞混悬液，或以胰蛋白酶消化法于培养盖上收集培养细胞。应用MgSO4染色分离方法分离细胞核（Van den Engh et al 1986 在Traok和Van Den Engh 34章　）。细胞混悬液浓度为5×106/ml。利用RNA酶消化后，使核从细胞分离，细胞核混悬液浓度为4～5×106细胞核/ml。　　（2）细胞固定和酸的处理：在5ml试管内加冷的1 ...

　　（1）放射性碘源的选用：无载体的131I或125I均可用于碘化标记，但应尽量选用新鲜的、比放射强度高的、含还原剂量少的放射性碘源。碘源的比放射强度最好≥50～100mCi/ml，至少也要30mCi/ml，否则加入碘源的容量要增加，随着带入碘源中含有的还原剂（为放射性碘源运输保存所需加入）量也增加，这将会显著降低碘利用率及标记蛋白比放射强度。放置较久和放射性碘源，一方面因衰变致比放射强度降低，另 ...