PCR引物设计

为克隆EGFP(模板为pEGFP-N2),我设计了一对引物:P1: 5' AGCTCAAGCTTCGAATTCTGCAGTC 3' 有酶切位点EcoR I.(GAATTC)P2: 5' CTCGGATCCTACAAATGTGGTATGG 3' 有酶切位点BamH I(GGATTC)用primer5.0 设计,rating 为79分,但两个引物都有Dimer,且P1 中Dimer的自由能高达-11.2,共有四条-10---- -11.2的Dimer.各位给看看吧,谢谢.这样的引物能扩增 ...

分子生物学软件　　目前，有很多软件可以解决分子生物学研究人员从立项到最后写论文的实际问题。但由于软件的数目太多，而且各个软件开发环境、运行平台和操作方法都各不相同——即使功能的某些方面是相似的，这就给使用者造成了许多的不便。赛百盛公司信息部在对相同作用的各类软件进行比较后，推荐一些最实用软件给从事生物研究的工作人员。　　 一、实验准备阶段 这时一般要查一些与实验相关的文献,以便对自己所要做的课题的最新的进展有一个基本的了解，从 ...

引物设计软件 Primer 3标签: Primer 引物设计 2009-04-21 23:43实验室里做Q-PCR都使用这个软件，本来想整理一下如何使用，发现网上有了，就拷贝一下和大家共享。Primer 3 在线引物设计攻略（来自百奥知识网http://www.bioknow.cn/html/pages/747/paper_65747.htm）2008-10-20内容快照：开始之前：其实非常简单，不需要你下载任何软件，但是你得有一台电脑能上网。当然，最重要的 ...

PCR引物银行是目前国际上最大的引物数据库，里面有超过18万种引物序列，它的引物序列能用于一般 的PCR，也能用于定量PCR，你只要输入基因针对的ID号（可以通过NCBI查询），这样就能得出引物序列。甚至你也可输入基因的名称，或蛋白质的名称，或者对应的Locallink都可以查到。目前引物主要针对人和小鼠的，今后将拓展到其它物种，如大鼠等。它的引物成功率达到99%，我想大家应该放心使用了吧。这个文章来源于一篇华人的文 ...

PCR技术简介　前言一滴残留在裙子上的精液使得美国总统Bill Clinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerase chain reaction)--聚合酶链式反应具有的特色之一。这也是分子生物医学令人震撼的一例。何谓PCR简单的说，PCR就是利用DNA聚合酶对特定基因做体外或试管内 (In V ...

在网上找的有关引物设计的材料.虽然自己没有这些软件,也不会用,但想推荐给能用得上的战友.引物设计的原则引物设计有3 条基本原则：首先引物与模板的序列要紧密互补，其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构，再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配)。具体实现这3 条基本原则需要考虑到诸多因素，如引物长度（primer length），产物长度（product length），序列Tm 值(melting temperat ...

Book DescriptionIn the past decade, molecular biology has been transformed from the art of cloning a single gene to a statistical science measuring and calculating properties of entire genomes. New high-throughput methods have been developed for genome sequencing and studying the ce ...

要进行RT-PCR的序列就是 Oryctolagus cuniculus glucocorticoid receptor1 atggactcca aagaatcatt aagtcccccg ggtagagagg aggtccccag cagtgtgctc61 aggccggcgg agcgcgggaa tgtgatggac ttgtacaaaa ccctaagggg aggagctcct121 gtgagggtgc ctgcatcttc tccctcactg gctcctgc ...

本人刚进实验室，目前在做实验前的准备工作，在引物设计遇到一些困难，希望各位战友能帮帮忙！我的序列如下，为双链RNA病毒，准备做克隆表达。1 gttaaaaatc tatagagatg gacactatcg ccgcaagagc actcactgtg atgcgagcat61 gtgctacgct tcaagaggca agaattgtgt tggaagccaa tgtgatggaa attttgggga121 tagctatcaa taggtacaat ggac ...

这份资料以言简意赅的幻灯形式展示了PCR从引物设计到反应条件的优化应注意的问题，相信对您的实验有指导意义。极力推荐！http://www.biotechlab.nwu.edu/pe/包括以下内容：Introduction - PCR PrimerComponentsPrimer DesignPrimer Design - IPrimer Design - IIMelting Temperature, TmTm Calculations, Nearest Neighbor A ...

各位站友：我于2002年开始进行一系列的SNP，人细胞因子RT-PCR检测和核因子-kappa B的EMSA检测，积累了一些资料和引物，目前仍在继续进行该类的研究。如有需要者可与我联系，我将随时赠送给真正需要者，并在赠送前都进行验证以确保引物能P出东东来。我的EMAIL：yubaojun1219@sohu.com以下是我的研究结果和资料。请大家批评指正。基因组DNA的提取：静脉全血2ml加0.5ml ACD(柠檬酸22.8 mM ...

1。引物二聚体形成的原理：http://www.dxy.cn/bbs/thread/5251134http://www.dxy.cn/bbs/thread/52543942。怎样区分引物二聚体http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/553209_0.html3。引物二聚体在什么情况下需要注意http://www.dxy.cn/bbs/actions/archive/post/553338_0.h ...

因为是Qpcr引物，为了提高准确性，就缩短了产物长度，大概都在100-150bp左右。供高手讨论，共同提高。目的基因一（CDS区）：gacattgtctaaaagccaagatgacagactgagaggcctgagcccttgttctggcattctcccaggaagatgcagtaaaggggttgacccaatatactgcagagaatttcatccagttccctcctccatcctgatccca ...

谈谈PCR引物设计1．简介寡聚核苷酸引物的选择，通常是整个扩增反应成功的关键。所选的引物序列将决定PCR产物的大小、位置、以及扩增区域的Tm值这个和扩增物产量有关的重要物理参数。好的引物设计可以避免背景和非特异产物的产生，甚至在RNA-PCR中也能识别cDNA或基因组模板。引物设计也极大的影响扩增产量：若使用设计粗糙的引物，产物将很少甚至没有；而使用正确设计的引物得到的产物量可接近于反应指数期的产量理论值。当然 ...

对于作PCR的来说，最难的莫过于设计引物了，理论现在已经很多了，但是真正实践起来是要付出一定的心智的，记得曾经看到某一位主任说他设计了上千对引物，从没有失手的时候，真是让我佩服得五体投地。最近看了一下OLIGO6.0的使用说明，英文的，感觉有很多地方还是讲得不很明白，比如 Nested primers design 及 multiplex PCR Primer design.下面我先来讲讲普通的利用OLIGO 设计引物的方法吧：1 从文件菜单打开模 ...

PCR 引物设计及软件使用技巧张新宇，朱有康，高燕宁（中国协和医科大学中国医学科学院肿瘤研究所，北京100021）摘要：本文旨在介绍使用软件设计PCR 引物的技巧。在PCR 引物设计原则的基础上，详细介绍了两种常用引物设计软件的基本使用方法，并对其各自的优缺点进行了比较。一般性引物自动搜索可采用“Premier Primer 5”软件，而引物的评价分析则可采用“Oligo 6”软件。关键词：PCR；引物设计中图分类号：Q524 文献标识码： 文章编 ...

免费引物设计软件Neoprimer引物设计之我心得最近听同学介绍了一款引物设计的软件——Neoprimer软件，融合引物设计的两个基本功能，即引物自动搜索和分析功能，并且使用方便，与Premier Primer相比有过之而无不及。现将我的心得讲述一下：打开序列后就能显示序列和限制性内切酶位点，然后在分析栏可以根据你的需要设计并搜索引物。如果没有特殊要求，建议使用默认设置。可以用于搜索PCR引物，测序引物或杂交探针（ ...

以下是所有的看家基因的列表，大家在设计引物时，可以直接采用这些基因的序列，本表来自于Trends in Gentics上一篇文献，内容全面，所有的看家基因均标注了基因银行号（Genbank），可以直接到pubmed中查询得出。引物设计可以推荐用primer 5，也可以直接与fbzhang@hotmail.com联系，请注明：引物设计服务， 同时提供您所需要的引物的基因银行编号或全部序列。List of housekeeping genes de ...

光度计测量的转换:双链DNA (ds DNA)：A260 = OD260 = 1 相当于50 µg/ml溶液单链DNA(ss DNA)：A260 = OD260 = 1相当于33 µg/ml溶液RNA：A260 = OD260 = 1相当于40 µg/ml溶液参考文献：Freifelder, D., Physical Biochemistry: Applications to Biochemistry & Molecular Biology, W.H. Freeman and Company, CA, 1982, p. 494-536.核酸分子量计算方程式：吸光度 ...

PCR 引物设计及软件使用技巧！自从1985 年Karny Mullis 发明了聚合酶链式反应以来，PCR 技术已成为分子生物学研究中使用最多、最广泛的手段之一，而引物设计是PCR 技术中至关重要的一环。使用不合适的PCR 引物容易导致实验失败：表现为扩增出目的带之外的多条带（如形成引物二聚体带），不出带或出带很弱，等等。现在PCR 引物设计大都通过计算机软件进行。可以直接提交模板序列到特定网页，得到设计好的引物，也可以在本地计算机上运行引物 ...