RNA试验基础

gingerdaming 自己看的文章基本上都是miRNA调控靶基因，那么miRNA的表达在特定组织特定时间的增高或降低，应该也受表观遗传的调控，本人看这方面的东西比较少，我现在想专注一个miR的变化，其上游和下游都想关注。下游的在准备做了，上游调控miR的方法有哪位大虾有相关经验或者文献的？能不能分享一下，谢谢！freecell http://www.sciencedirect.com/science?_ob=Artic ...

gingerdaming 想做个关于miRNA的报告基因，打算请公司和成mimic miRNA转入细胞！请问各位高手，有哪个公司和成的这个比较好？需要自己做什么？新手上路，谢谢！zhujoker 这种问题你问一下公司就行了啊。需要你做什么啊？什么都不需要。如果说哪儿的好呢？到是可以问问大家合成过的。我推荐一个吧，就是dharmacon公司的，比较全面，也比较专业化。效果不错。gingerdaming 谢谢啦！clion007 我们有一 ...

xiaonongchang 最近MiRNA芯片检测已经结束，公司根据“The threshold value we used to screen Up and Down regulated miRNAs is Fold Change=1.3 and Fold Change2.0或1-fold in human ovarian cancer versus normal ovary”，是不是说达到1倍以上都可以定义为芯片意义上的差异？请高手指点。freecell This presentation may give you some ...

youxiaohan99 　你好，我想请教一个问题。我是做大鼠物种的，选择了在文献报道与这种疾病状态相关的几十种miRNA做real timePCR,可是看别人都是先用芯片筛选，然后用real timePCR验证，我这样会不会丢失很多数据，对后面要做的功能研究会不会有影响？我是否有必要做芯片？还有芯片的重复性好不好，一般要做几次重复？哪家公司的芯片做得比较好又实惠？因为real timePCR已经花了很多钱。谢谢！bob0408 变 ...

王12345 怎样预测microRNA的目标基因（目标蛋白），用什么方法？freecell http://scholar.google.com/scholar?q=microrna+target+prediction&hl=en&btnG=Searchtracy22 http://www.targetscan.org/vert_40/ ，非常经典的预测microRNA靶基因的网站hokman 现在的预测技术还不成熟，不同软件出来的结果相差很大 ...

allwish 请问有人去过这个miRNA的第一期培训班吗？不知道质量如何http://tong.dxy.cn/upload/2009/LAND/index.html坏才不遇 我也想知道 啊wshuangwei2005 这里有个他们上期举办的培训班，里边好像有些人报过名。或许可以询问下，吼吼。祝好运http://www.dxy.cn/bbs/thread/13837221kiki2009 贼贵的，期待所有资料！本文由丁香园论坛提供，想了解更多 ...

tigerbin 请教各位大侠：有没有研究microRNA与树突状细胞免疫功能方面的？现在microRNA的研究已经遍及肿瘤，免疫，心血管疾病，病毒等，如miR-155,有关它与免疫的研究，本人看的几篇文献主要是利用转基因技术敲除小鼠体内Bic基因（miR-155系BIC基因的表达产物，产生于活化的B细胞、T细胞、巨噬细胞、树突状细胞等），检测bic／miR-155-/-小鼠B,T,DC细胞分化，成熟，活化情况，及功能改变等。m ...

redhq 各位高人，如何对microRNA和NF－kB的关系展开相关研究呢？freecell Refer to this paper:http://ukpmc.ac.uk/articlerender.cgi?artid=960261yfmxd 谢谢版主,正在读这篇文献,希望以后能跟您多请教,谢谢!本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

cancerlab 怀疑我所研究的mRNA一段约300bp的序列上结合了一个RNA binding protein，但是无从下手，不知道有什么方法可以将这个蛋白鉴定出来？望高手指教。Fasta921 可采用RNA与蛋白质相互作用实验，比如：EMSA （electrophoretic mobility shift assay）cancerlab 谢谢！ 不过我目前困惑的问题是，那上面结合的可能是哪个蛋白。不知道有没有合适的高通量的筛选方法或者信息学 ...

xshdao 因课题需要开展microRNA表达载体构建，查了一些文献好像很少有带GFP报告基因的microRNA表达载体，如pCDNA3.1。请问是否有带GFP的表达载体可以用了表达microRNA？请各位高手发表高见！freecell google: microrna expression vector with gfpwanghm200810 有这样的载体，还有带抗性基因的载体。geneyouth 用pEGFP -C3载体 就可以， pri-miR ...

pl198242 请问shRNA表达载体在真核细胞中表达，一定要有真核表达的复制起始点么？ 如果只有PUC ori ，但是还有U6 启动子，是否就可以在真核细胞中表达shRNA了呢？ 这和f1 ori有什么关系么？ 由于对这方面了解很少，所以希望广大战友能予以帮助解答，谢谢！Fasta921 复制起点与启动子层面不同：PUC复制起点貌似原核复制起点啊，比如你转染前要获得大量的质粒，那么pUC origin 能保证该载体在大肠杆菌中的复制。U6启动子是确 ...

lily1314lk 本人需要自己构建质粒，遇到一个很头痛的问题，不知道如何利用blast对得到的shRNA进行同源性分析，有谁能指点一下，我做的基因是IKKα，有没有哪位同仁做过，可否提供shRNA靶点，谢谢freecell http://scholar.google.cn/scholar?q=IKK%CE%B1+shrna&hl=en&lr=&btnG=Searchzhaohu552211 进入到ncbi ，就可以了biowd 进入bl ...

huiguijimo 我想对培养的细胞进行RNA干扰，在干扰之前需要对细胞进行同步化吗？请各位高手指教Fasta921 干扰RNA是针对什么实验？细胞周期也许会涉及同步化吧！zhanglongfeng 只要不是研究细胞周期有影响的课题，就不需要。huiguijimo 想分别看一下干扰的那个基因对细胞周期和细胞凋亡及增殖情况的影响。需要同步化吗?Fasta921 huiguijimo wrote:想分别看一下干扰的那个基因对细胞周 ...

hzdlj 各位分子生物学大佬，本人目前才开始涉足miRNA，有诸多不懂之处，向各位请教。1，目前研究微生物miRNA多集中在病毒上，为什么真菌，细菌，支原体等研究较少，难道仅仅是因为基因组大小不同吗？2，查了下miRNA库，http://microrna.sanger.ac.uk/sequences/，似乎没有发现有关于真菌和某些细菌miRNA。请问：有没有这方面的生物信息学软件，根据微生物的基因组，预测其可能产生的miR ...

shuijingcrystyl 快答辩了，不知道E2F 的英文全称，因为所做指标与其有密切关系，求助转录因子 E2F 英文全称？freecell http://en.wikipedia.org/wiki/E2Fshuijingcrystyl 谢谢版主，授之以渔:I本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

sulicon 我想题目没说清楚。。。是这样的，我们做了一个方法，现在要检测这个方法的好坏，需要知道特定的miRNA的上调或者下调。我们希望能找到一些比较经典对某个miRNA调控的例子。经典的意思是：1. 这个调控比较可靠，大家公认。比如某个TF会激活某个miRNA的表达。2. 这个调控涉及的分子比较重要。比如上面例子里面的TF是P53。因为做的比较偏方法，要找具体的例子还一下子没有谱了，麻烦大家给点建议。谢谢！吴佰霖 鉴定调控mi ...

verycool 请问大家,用带GFP的逆转录病毒感染细胞后,如何检测GFP插入到细胞染色体的具体位置.我想知道的是如何确定其前或后的基因是什么?谢谢!小薇宝宝 这可是比较麻烦了，检测拷贝数可以用SOUTHERN BLOTING检测位置需要用图位克隆，用MARKER逐渐逼近然后确定位置lmnsmu 我认为检测其在染色体的具体位置，需要用原位杂交，常用的是FISH，但是大可不必检测其的染色体定位，检测GFP知道它在细胞内有无 ...

freedegree hsa-miR-625　和hsa-miR-62undefinedhsa-mir-532-5p 和hsa-miR-532-3phsa-mir-34a 和　hsa-mir-34b　　（同源？？）hsa-let-7a-2 和　hsa-let-7a-1　　（分布不同？？）晕了，赐教啊zhujoker hsa-miR-625　和hsa-miR-62undefined这2个第一个你应该清楚吧，hsa-miR-62undefined表示和前面那个互补的miRNA，于是就用了一个号标记。hsa-mir-532-5p 和hsa ...

quweiquwei 为便于学习和以后写作，建议xdjm们总结一下microRNA的大事，格式可以这样：1。1993年，Lee等人首先在秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)体内发现了长度为22 nt的非编码小RNA——lin-4,而lin-4 RNA便是现在所熟知的miRNA文献：Lee R C, Feinbaum R L, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with ant ...

wywdxfsh 请问有没有什么网站可以分析microRNA在物种间的保守性？谢谢哈freecell see: www.scichina.com:8082/sciC/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=411501wywdxfsh freecell同学 你介绍的这篇文章写得真好 让我对课题原有的思路产生了新的想法 谢谢！myskite 看不到啊！liqiangs freecell wr ...