【求助】MiRNA芯片threshold value如何确定？

最近MiRNA芯片检测已经结束，公司根据“The threshold value we used to screen Up and Down regulated miRNAs is Fold Change>=1.3 and Fold Change<=0.77”来确定差异表达microRNA。

在我印象中，以前mRNA芯片一般选择>2.0或<0.5，不知道micro芯片如何确定threshold value ？

之前读过一篇文献，其中有“list of deregulated miRNAs at >1-fold in human ovarian cancer versus normal ovary”，是不是说达到1倍以上都可以定义为芯片意义上的差异？

请高手指点。

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http://www.oceanridgebio.com/Miller_Keystone_2009.pdf

其实最主要的芯片只是一个参考，做芯片最主要的目的是便于筛选可能有意义的miRNA。其实你所谓的threshold value是针对你的芯片而言的。一般来说大于1.5倍可以列入有意义的值。有的文献设置的底线是1.3倍，而有的高达10倍。所以其实设置的值关键在于你的芯片的情况了。因为芯片只是方便可能有意义的筛选，为你的课题提供方便以及更深层次机制研究。因为我认为这些结果需要进一步在细胞水平的real-time上进一步证实，当然你是大批量的病人组织又另当别论了。但是大批量的话我想只要有重复性，1.3倍又何尝不可以呢？
个人观点，仅供参考！因为我只是针对所看文献泛泛而谈，具体值还需要结合你的芯片进一步分析！

miRNA芯片分析northern验证的选取标准一般为信号值>2000,log值〉0.58，p值<0.1

和你的具体数据有关，一般大家喜欢用大于2或者小于0.5，但是如果你的数据没有大于2或者小于0.5的，怎么办？呵呵当然放宽条件了。我做的一次，公司筛选时定在了1.4倍，就这个原因。如果差异大于2倍的太多，也许条件要再收紧一些。毕竟有500个差异的话（当然小鼠的一共也就这点），你也分析不过来啊！总要挑最明显的。所以一句话，标准是人定的