RNA试验基础

leng724 如题：相应的人工合成物或mimics选择哪个作为发挥miRNA作用去转染比较好，这两个有什么区别。谢谢各位~~霍一刀hxs 现在做转染一般选择用mimics，即模拟剂。这个问题真没想过，估计人工合成物不能代表细胞中真正miRNA的表达情况吧。吴佰霖 人工合成物即文献mimics，序列应该与相应miRNA一致maomao030119 我觉的人工合成物与mimics应该都与目的基因序列一致吧dearest626 我 ...

霍一刀hxs miRNA靶基因相关预测网站中经常出现“7mer-m8”，其中“mer”表示什么意思？多谢高手指教。freecell The "-mer" suffix refers to the number of bases (monomer, 7-mer, oligomer, polymer...).霍一刀hxs 多谢版主freecell的指教，多谢。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixio ...

minicenter 已知一个microRNA，可以在ucsc上查找已知的TF结合位点，也可预测其潜在的TF结合位点。反过来，已知一个TF，如NFAT，怎样预测它可以调控哪些microRNA的表达？在此求助各位高手解答，多谢！minicenter 我不小心发了两个帖子，在生物信息学里面发的那个似乎人气稍多一点儿http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=73&id=16632525&sty=1&tpg= ...

biophysics 搜了一下论坛，未果，我想问一下，使用荧光素酶如何检测某基因为miRNA的靶基因？大概是什么样的步骤呢？才接触，也不了解xuezhishui http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=16590646&sty=1&tpg=1&age=0biophysics 谢谢！您发的帖子我看到了，您的意思是现在常用的方法就是您帖子上写的吗？我看有的文献说看转了片段的荧光素酶载体的活性，如 ...

loyalty 如题。准备做有关肿瘤细胞信号转导机制的研究。疾病模型中A对B的作用。对象：人的肿瘤细胞系。思路：某处理因素作用下,A升高，检测B的升高。A knockdown， B无改变。A knockdown cell 转入携带有外源基因的表达载体，检测B升高。问题1： 因为没有查到与该研究相关的直接相关文献，无法参考，但是我认为信号转导途径的研究大致应该如此。然而，关于Knockdown的方法，如选择RNA干扰，操作方便。但是，在后面的步骤中 ...

redsky 我想验证一个microRNA可以抑制某个基因，并且这个基因又反过来调控这个microRNA ，请问通过什么实验手段才能验证呢？bigbang_0_0 敲除？？？？bigbang_0_0 过表达？？？redsky 我想问一下大家，首先这种情况可能发生吗？buyqcn 这种调控机制属于反馈抑制或反馈激活回路/loop，非常常见。具体研究方法可以参考一下最经典的p53和mdm2反馈抑制回路，有很多这方面的文献。bigbang_0_0 re ...

shaoyibo 请问大侠看篇文献说为检查一调控基因与被调控基因的MRNA水平及二者的关系，先做RT-PCR，后将上述基因重组质粒，最后荧光定量PCR分析，1、RT-PCR可能是用将基因钓出来用于构建质粒用的吗？2、重组后原核表达而不直接RT-PCR后进行表达分析是为什么？freecell 不知道是我老了，还是现在的语文都这么晦涩难懂，还是现在的研究生表述能力下降。我怎么看不懂你的问题呢？1、该文见于何处？ 何不写信给作者询问 ...

wz王 想请教一下在microRNA实验中u6还是u6b做内参比较合适？谢谢～看过一些文献用的u6b，但试剂公司推荐u6～zhujoker 看你是做的什么了？因为说实话，现在miRNA还没有一个比较合适的内参，但是你可以自己试一下到底那个好，也不用在乎那多的1000多了。wz王 我做表达丰度差异，之前一直用u6b做内参，这次定试剂时听试剂公司说u6b逐渐要被淘汰，他们推荐u6，我查了下abi公司（Endogenous Cont ...

wu_g_f microRNA后带有星号和不带有星号的代表什么意思，例如miR-200a与miR-20undefined。请赐教！zhujoker 你可以上Sanger网站去查，在一定程度上指的是他们是互补序列而已，没有其他的意思。wu_g_f 谢谢版主ghost8469 没有星号代表的是成熟MICROrna的主要产物When the relative abundancies clearly indicate which is the predominantly express ...

大鹏鸟 最近在学习miRNA方面的知识请问各位我在网站上可以查到miRNA预测的靶基因，但是怎么能比较方便地知道这些靶基因的主要作用呢，因为每个miRNA好像都有非常多的靶基因。谢谢zhujoker 不是在每个软件前面都有相应的链接吗？你打开链接就有相应的介绍的啊。你集中你的目标在相应的信号通路或者功能基础，可减少很多麻烦的。大鹏鸟 软件？您说的是什么软件呢？本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及 ...

张明建 请问什么叫unannotated transcript和unannotated miRNA,哪位高人可以回答这个问题啊lmnsmu 非注释转录本和非注释miRNA，我的理解是转录本（或miRNA）目前功能定位等信息不清楚，故称unannotated。张明建 谢谢楼上朋友啊本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

laide123 本人初学者：想请教一下大家，一条mRNA的所有序列（除5端的G,和3端的ployA外）是不是都将翻译成蛋白质，mRNA中是否也存在着与DNA 序列一样的调控MRNA翻译的序列。雪中梅 mRNA中当然存在调控mRNA翻译的序列，一条mRNA中的序列只有从ATG（起始密码子）开始到终止密码子之间的序列（也称开放读框，ORF，open reading frame）才翻译成蛋白，除此之外的其他部分都有可能对mRNA的翻译 ...

myskite 怎样找出某基因上的所有miR?zhujoker 在 http://www.ensembl.org/index.html 网站上找到你自己的基因，然后看在相应的区域的miRNA情况即可。本讨论版以前也有这个介绍，注意自己多搜索。biophysics 不明白为什么要找呢?这种有关系吗本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

wulab22 如题:帽子的糖环与核糖核酸链之间是-p-p-p-连接，而核糖核酸链之间的糖环之间是-p-连接，合成酶能识别-p-p-p-吗，能够以帽子结构为模板，在第一链cDNA的3'末端合成c吗？谢谢！wangxiaotong999@163.comdnazyme 5’-RACE技术的意义：可以精确定位转录起始位点。但是定位转录起始位点又有什么意义呢？以RNA聚合酶Ⅱ为例，启动子区一般位于转录起始位点上游200-300bp的范围内， ...

tianjinny 各位大侠，你们好！我现在有一问题需要请教各位,我目前研究的是 miR-451（微小RNA-451），由于目前研究此RNA的文献很少，本人未查到其在人肿瘤细胞中的靶点，不知这样的网站网址是什么。还有一问题，就是癌基因AKT1 、C-MYC与miR-451的靶序列有无互补序列，具体结果是怎样的？盼回复！！谢谢！！freecell 自己看看文献吧，怎么会很少呢。http://scholar.google.com/scholar ...

cameron 有什么功能吗?谢谢!!!freecell Miscellaneous RNA：是一类庞杂的小RNA分子。# Miscellaneous Small RNA: serves a variety of functions, including some enzyme-like catalysis; many are involved in processing RNA after it is formed; the remaining 2% of RNundefined Recent evidence suggests that some of these sm ...

redsky 我想咨询一下XDJM，如果想要看某个microRNA在某个细胞系或组织中的表达水平高低，有没有这样的数据库呢？就是基于文献总结的数据库，或有什么其它方法可知道？iscience MicroRNA.org (http://www.microrna.org) is a comprehensive resource of microRNA target predictions and expression profiles.竹叶青秦 http://www.mirz. ...

girl19860627 在很多教材或资料中，写到端粒的功能是都说“能补偿滞后链5'末端在消除RNA引物后造成的空缺”，那么在前导连复制中5'端也需要RNA引物，它也会被切除，不也会留下空缺嘛，那这种情况怎么解决啊？版主freecell留言:提问的时候，要在标题说清楚问题。iscience 前导连复制中5'端RNA引物切除后，在原核生物中由DNA聚合酶I来补齐。dll20088002 书上说是由端粒酶参与解决的，该酶可提供R ...

jiangxiaozi76 Highly specific gene silencing by artificial microRNAs in Arabidopsis。p1123页中，Figure2.B图中，箭头上方的分数表示什么呢？:)zhujoker Because ARGONAUTE (AGO) proteins cleave targets invariably opposite of positions 10 and 11 of the small RNA (Kasschau et al., 2003), the 5’ ends of ...

haidi1214 请教：能否利用RNA干扰沉默某一基因（如P53）的启动子进行沉默？这一想法可行吗？急盼回复！非常感谢！freecell Why not?See review below.The gene-silencing process of RNA interference (RNAi) involves the manufacture of short, double-stranded RNA molecules by an enzyme called DICER, which cleaves RNA dupl ...