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        【求助】如何预测一个TF可以调控哪些microRNA的表达?

        丁香园论坛

        1559
        已知一个microRNA,可以在ucsc上查找已知的TF结合位点,也可预测其潜在的TF结合位点。
        反过来,已知一个TF,如NFAT,怎样预测它可以调控哪些microRNA的表达?
        在此求助各位高手解答,多谢!
        我不小心发了两个帖子,在生物信息学里面发的那个似乎人气稍多一点儿
        http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=73&id=16632525&sty=1&tpg=1&age=0
        ChIP-on-ChIP or ChIP-seq to sceen,
        Y1H to confirm.
        bigbang_0_0 wrote:
        ChIP-on-ChIP or ChIP-seq to sceen,
        Y1H to confirm.

        谢谢!
        实验的方法固然稳定一些,但是我想看一个microRNA cluster受哪些TF的调控用,直接用这种方法做工作量大,花费高,不现实。
        我想软件预测出几个TF所调控的所有miR,然后再对比挑选出候选的TF,在用ChIP、luciferase等验证

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

        师兄微信号:shixiongcoming

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