RNA试验基础

callmeroger 问一个比较基础的问题，可能比较弱智检测差异为何要在蛋白和mRNA水平两个进行？据我个人理解，mRNA最终也是要翻译成蛋白的，那样的话从蛋白水平检测不是最直接的吗？mRNA水平是不是多余了？zhujoker 如果你上课的时候认真一点就知道了有一种叫转录后加工，所以在蛋白水平和mRNA水平表达不可能完全一致的。LoftyMan 因为不懂生物学的各类人群一直以为Gene决定一切，其他的都是臣服于Ge ...

feichangkexue 请问一下确定miRNAs属于一个miRNA家族的依据是什么？有没有相关阐述的文献？谢谢！吴佰霖 序列 的相似度？freecell microRNA family classification is based on the Rfam database (check the original paper on Rfam: http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/31/1/439 ). The basic idea behind fa ...

fgh2005 文章修回编辑问肿瘤标本miRNA表达情况，我该怎么回答，还是补做实验。谢谢！（我只做细胞系相关实验）侠骨仁医 我觉得有两个办法：1。最好的办法当然是去找一些肿瘤组织和正常组织，检测miRNA，这样是最理想的。2。如果实在弄不到标本，你就引用别人的文献，说明此miRNA在肿瘤标本中的表达情况，并且说明你的实验主要是focus在basic research上面的，这样别人应该可以理解。霍一刀hxs fgh2005 wro ...

shmicy2001 请问各位战友，小弟现在想做关于某个基因缺失后引起的基因转录和表达方面改变的研究，我只知道：1.研究基因转录水平改变是检测其mRNA，最常用的是RT-PCR及荧光RT-PCR等方法,请问这方面有什么注意事项没有呢？2.检测其蛋白质:用的最多的应该是Western Blot吧...但是因为我的标本只有患者的血液，假如真的存在因为基因缺失造成的相应功能蛋白表达改变（如降低等），不知道血液中的蛋白量的检测该如 ...

redsky 我在mirbase查到hsa-mir-34a的序列如下：hsa-mir-34a MI0000268GGCCAGCUGUGAGUGUUUCUUUGGCAGUGUCUUAGCUGGUUGUUGUGAGCAAUAGUAAGGAAGCAAUCAGCAAGUAUACUGCCCUAGAAGUGCUGCACGUUGUGGGGCCC我在ensemble查hsa-mir-34a序列及其上游(5'端）10bp序列变成如下 ...

liuying6477 想做mirna的抑制和过表达，请问1.过表达是否直接转ssc-let-7c MI0002445 stem-loopUGUGUGCAUCCGGGUUGAGGUAGUAGGUUGUAUGGUUUAGAGUUACACCGUGGGAGUUAACUGUACAACCUUCUAGCUUUCCUUGGAGCACACU2.抑制表达是否是上个stem-loop序列的反义还是ssc-let-7c MIMAT000215 ...

s78293 求教各位老师：A基因被RNA干扰之后，B基因表达亦下调，说明A和B关系如何？或能提示其他什么？freecell 理论上说明B的mRNA水平直接受A调控。侠骨仁医 我个人觉得只能说明B基因可能和A基因有相关性，但是只通过简单的检测不能说明两者是直接关系还是间接关系，有可能是A基因直接作用于B基因，当然也可能A基因是通过C，D，E。。。等间接作用于B基因。lbqlxy 新手不理解二楼说的直接调控的意思是社么1 A蛋白直接 ...

longytu NCBI上面查到了BAX的mRNA的几种序列，有αβγ三种类型。。。。为什么BAX基因序列相同，且都是人源的，mRNA为什么序列不同呢？？zjubell 大多数真核基因转录产生的mRNA前体是按一种方式剪接产生出一种mRNA，因而只产生一种蛋白质。但有些基因产生的mRNA前体可按不同的方式剪接，产生出两种或更多种mRNA，即可变剪接（alternative splicing）。人们发现，越是高等的动物，涉及mR ...

霍一刀hxs 各位高手：对于某一特定的RNA，通过何种方法判断其所在细胞内的位置？多谢。zoeru2007 原位杂交吧。。。sbch1532 霍一刀hxs wrote:各位高手：对于某一特定的RNA，通过何种方法判断其所在细胞内的位置？多谢。原位杂交可以霍一刀hxs 多谢zoeru2007和sbch1532的帮助。呵呵hyjtb 免疫荧光能看出来么？霍一刀hxs hyjtb wrote:免疫荧光能看出来么？试试此方法，谢谢。bigbang_0_0 hy ...

gzlaotouzi 我想知道，经过芯片或者其它手段确认了的，与某一类肿瘤或者某一特定疾病相关的所有差异表达有意义的microRNA群，我可以借助哪些手段得知？shilei5794749 http://www.mir2disease.org/ —— “search by disease name”路得自己走 shilei5794749 wrote:http://www.mir2disease.org/ —— “search by disease name”这个不错！shen ...

Y03013 请问XDJM，如何获得未知miRNA 的表的情况呢freecell 现在比较流行的做法是进行deep sequencing。权威的miRNA公共数据库Sanger miRBase已升级至最新的13.0版，发布的microRNA序列信息已接近10000条。由于越来越多的miRNA正在被发现，miRBase数据库每隔4~5个月就会发布新的数据版本。尽管如此，我们仍然对大量的物种miRNA信息一无所知，它们的重要生物学 ...

深空明月 大侠同志们：请教一下PCR检测出mRNA的表达量是升高的，能否说明那它的蛋白质的表达量也是升高的呢？如果蛋白质量是升高的，那它的机理是什么样的？如果不一定是升高的，其缘由又是什么样的啊？还有一个问题：受体分子在细胞中是有限的，当受体处于饱和状态时，受体mRNA的表达量会是什么情况呢？关于分子机制这方面的我不是很明白，请赐教。急freecell mRNA表达量升高，不一定会说明蛋白质表达量升高。这是因为在翻译过 ...

太峰之巅 目前，对小RNA的研究进展的相当迅速，小RNA的功能蛋白如Ago，Dicer等也有相当的研究。就对小RNA新的功能作用蛋白大研究方法，高手进来畅聊。版主freecell留言:你所知道的有哪些方法？只有先提出自己的见解，才能抛砖引玉，引来更多的讨论。freecell see this post:http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=154&id=16504126&sty=1&tpg=1&age=0太峰 ...

huangaiyou 看了一篇文章，说是用锁核酸技术大大提高了northern blot检测miRNA表达水平的灵敏度。请问各位站友，这个锁核酸技术用在northern blot上，如何检测的？也是用放射性同位素吗？似乎这个锁核酸只是增加了稳定性，跟最后的检测没什么关系吧？我现在想用northern blot验证预测的miRNA，又不能用同位素标记，请问有什么可以替代的吗？我曾经看到帖子说miRNA的检测要求灵敏度高，不用放 ...

freedegree release 14和release 13整个数据全变了，同一条miRNA，基因组中的位置变了，是什么原因？是基因组数据还是miRNA数据的变了？举一个例子：ID Chromosome Start End Strand releasehsa-let-7a-1 9 95978060 95978139 + 13.0hsa-let-7a-1 9 96938239 96938318 + 14.0zhujoker 楼主真是细心，但是你关心他们的位置有什么作用？我个人认为应该是 ...

shidingwen 请问 加载控制是么，为什么要选用肌动蛋白？谢谢freecell 请给出“加载控制”的英文说法。shidingwen 英文是这样表达的β-actin mRNA was used as a loading controlfreecell 晕。这里的意思就是将β-actin mRNA作为对照（或者内参）。loading是“上样，加样”的意思。β-Actin中文名叫做β-肌动蛋白，是横纹肌肌纤维中的一种主要蛋白质成分，也是肌肉细丝及细胞骨架微丝的主要成分 ...

xiaoxiaoyu0329 查了很多资料都没有查出来，请您赐教，谢谢bigbang_0_0 帮顶：）jiajin 叫5'UTR，5'非翻译区song333 5' Un-Translated Regionpro2004 5'UTRxiaoxiaoyu0329 好的 谢谢各位的回复bigbang_0_0 不客气。zhuhoushun KAZARK吧吴佰霖 我想称为 转录非翻译区 更确切UTR的含义比较含糊，也可以指5'promoter 调控不转录的序列，也可以指转录了 但不翻译的 ...

syn2767 各位师兄，小弟做miRNA 的microdowm，但realtime检测antisence转染后，miRNA的表达并没用下调，问试剂公司的人说 antisence不能下调目的miRNA的表达，只有上调的质粒才能影响miRNA的表达，是这样吗，多谢！！slytjiaofei 我个人认为公司说的不太准确。利用反义核酸或siRNA抑制microRNA表达是一个很成熟的技术，当然效果如何取决于当初反义核酸或siRN ...

霍一刀hxs 不同的miRNAs可以靶定同一个基因，或同一位点或不同位点，那么，他们之间存在竞争性结合吗？弱弱地问一下，各位大侠。song333 possible, but the possibility is really low.each miRNA has its own target sequences, that mostly can be considered as sequence-specific targeting.maomao030119 应该会吧，个人观点本文由丁香园论坛提供， ...

andyzhoucang 本人想预测某一microRNA的靶标，通过targetscan，pictar 以及microrna这三个网站，每个网站预测出来靶标都有200多个，我想把其中共有的找出来，一定要一个一个对过去吗？有没现成的网站或软件可以把这三者的交集弄出来？吴佰霖 据我所知，是可以的。在DAINA这个网站里，楼主可以找一下onlove001 同问这个问题 请求指点。。谢谢。。。。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的 ...