RNA试验基础

taijiwu 我测了一段miRNA的种子序列，如何查找它存在于哪一段基因的区域内，BLAST、miRBase、TargeScan如何使用，还请各位战友提供帮助。谢谢！woxingwosu 有了目的序列后这个我想BLAST应该可以出来了吧。具体做法你自己摸索估计比让人在网上教更快。当然什么具体问题可以提出来。mirbase和targetscan也是一样。下面的连接是NCBI的中文教程，希望对你有所帮助。http://bi ...

豪斯 请问版内高手一个问题，目前有哪些机制可以在上游调节miR，有没有相关的文献，谢谢LoftyMan 基本的就是RNA polymerase II吧，其他的一开始分为cellular和viral好学习一些这么火爆的话题，在Nature搜索一下microRNA的Review就行了，08年Bryan R. Cullen有一篇，最近他又有一篇新的所谓上游的调控，这个问题我觉得可能比发现miRNA的新target更难，建议楼主暂时不要考 ...

凉石榴 譬如说 hsa-mir-196 这个hsa是什么意思呢 ？woxingwosu 呵呵，这个应该是代表物种吧。 hsa代表Homo sapiens （人）。zjubell 凉石榴 wrote:譬如说 hsa-mir-196 这个hsa是什么意思呢 ？贴一下常用的脊椎动物的：另附一份所有的Homo sapiens (human) hsaPan troglodytes (chimpanzee) ptrMacaca mulatta (rhesus monkey) mccMus musculus (mouse) m ...

xcydcg 我现在搜集全血标本，想要提取RNA，但是由于临床标本搜集较难，所以想要先保存然后一起提。请教各位高手应该怎么保存血标本呢？如果标本放在4°后多长时间就必须放在零下八十保存。如果我先前用triton处理过细胞，是不是就提不出RNA了？谢谢各位指导。北京rnai 前一段时间提过全血，是用tirzol提的，但是效果不是很好，一种方法是采血后直接-80冻存，提的时候加trizol另外一种是用淋巴分离液分离后提的，效 ...

xcydcg 各位大虾：本人近期想做miroRNA方面的试验，想请教各位哪些公司做这方面比较强，北京有没有，还有，大家觉得芯片哪些比较好呢？谢谢各位了:)版主freecell留言:当然是ABI的较好一些，自己搜搜就能找到的啊！或者找个销售员问问就清楚了吧！xujian2004265 你是做哪方面的？xcydcg 好，谢谢各位了。我主要想代理一个公司帮忙做有关miRNA的东西，所以想看看各位有没有什么经验，哪家公司做的比较好。h ...

lantianshi 在网上查到转录起始位点通常为一个嘌呤，就是说不是一个A就是一个G。而记着好像分子生物学上曾经给过序列特征，是ANTA(G)....,有确切了解这个序列特征的同学或者老师吗？请解答一下！lmnsmu 转录起始位点是指合成RNA的第一个核苷酸所对应的模板序列，RNA的第一位即5'-端总是GTP或ATP，GTP更常见。那么转录起始位点应该是C或T序列，但是不是所有的C或T是起始位点，一般是存在于特征性序列中 ...

恋梅时节 http://www.mirbase.org/lide658 你想问什么问题啊？是具体的使用方法吗？你要查找什么？恋梅时节 lide658 wrote:你想问什么问题啊？是具体的使用方法吗？你要查找什么？miRBase的用途，最好详细点的；如果没有，能不能给我解答下，用miRBase找靶基因的方法？nicolewendyyang 网站上写的还是比较清楚的吧，自己看说不定比在网上问更加容易哦雨水占 请问楼主miRBase怎么预测靶 ...

bobbymm shRNA要做连接的时候发现 annealing buffer 没有了。可以用 PCR buffer代替不？zhujoker 就用普通的去离子水就可以了，没有那么复杂。不要想当然得使用PCR buffer。bobbymm 用的是TAKARA的PCR BUFFER ，连接的还不错。已经送去测序了。谢谢回复。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongco ...

fanghuan1986 肝病患者外周血中怎么能检测到肝组织中的人端粒酶逆转录酶（hTERT）mRNA和甲胎蛋白mRNA 呢？本人认为转录水平应该发生在肝细胞中的，外周血中应该检测不到转录水平。恳请给予指教，不胜感激。woxingwosu 现在的研究已经表明了人的外周血中确实存在DNA和mRNA（Circulating DNA or RNA），一些癌症的患者（肝癌，肠癌，乳腺癌等等）的外周血中的一些mRNA含量有所增加，从而可以用来作 ...

leo_tao_jesus 本人想做关于microRNA方面的研究，现在刚刚入门，请大家帮帮忙分享下手头的文献。。十分感谢！zhujoker http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/?term=let-7中文的吧你就在万方里面找吧，很多的！leo_tao_jesus 谢谢啦~~恋梅时节 cell的一篇关于let-7家族对RAs的调控，希望对你有帮助！本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验 ...

yunasha1986 我想咨询一下你们公司能不能帮助检测人类细胞的microRNA表达谱，我有正常的大肠癌HT-29细胞，以及RNA干扰后的HT-29细胞，我想检测对比下两类细胞microRNA表达谱的变化情况，特别需要包含miR-183,miR-1224-3p,miR-1184,miR-1205,miR-1207-5p,miR-486-3p,miR-423-5p,miR198,miR-455-3p,miR-214,miR-922 ...

light666 miRNA序列比较短小，用探针检测时设计难度比较大，因而许多文章都推荐使用MGB探针。但是不是一定要用MGB探针呢？毕竟MGB比较贵，普通TaqMan探针虽然也不便宜，但比MGB已经便宜不少了。light666 看了不少文章，用的都是 Taqman MicroRNA assays。请问高手们，这个东西里面的TaqMan探针是MGB的吗？谢谢bluesteven 是的，里面的就是Taqman-MGB，我们以前用过，要是 ...

qinbingsx 各位大侠，本人想让目标microRNA在细胞中过表达，以前看到的好像大都是用mimic，看到有帖子说表达前体实验效果较好，我想请问一下质粒过表达的microRNA前体是转入细胞内后再生成成熟的目的microRNA吗？这种microRNA前体那一家公司可以买到啊？请赐教，非常感谢！freecell 可以咨询ambion公司，专门做RNA的。willion1985 锐博生物本文由丁香园论坛提供，想了解更 ...

wxf09211230016 准备做microRNA，请问各位高手，microRNA提取、标记到定量PCR哪个公司的试剂比较好呀？刚刚接触，请大家多多指教,先谢过了。zhujoker ABI的，做实验之前自己查查好吗？wxf09211230016 恩，谢谢了bluesteven NOVLAND的你可以咨询下，价格上比较有优势，也有全套的提取和检测本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都 ...

2004seedfive 各位仁兄！提取植物的miRNA哪家公司的试剂盒提取的质量好谢谢freecell 做核酸提取，Qiagen比较专业；其中做RNA的话，Ambion自称RNA技术公司，相对比较可靠。艾博思 2004seedfive wrote:各位仁兄！提取植物的miRNA哪家公司的试剂盒提取的质量好谢谢Ambion现在的ABI,invitrogen。Qiagen的在纯化这块不错，但是miRNA的认可度不高。blues ...

willion1985 miRNA功能动物实验方法willion1985 antagomir动物实验方案，做miRNA缺失性研究，大家觉得如何？freecell This paper plus its references are helpful for this study.http://www.nature.com/nmeth/journal/v6/n1/full/nmeth0109-37.htmlfunds 本实验室为上海高校科研室，现对外开放可代做miRNA ...

haiya116 请教一下，看文献的时候发现MicroRAN有时也叫miRNA，不知道和mRNA有没有区别？是不是指同样的RNA？谢谢！zhujoker mRNA，为 messenger RNA 的简称，或称为信使RNA。mRNA是由DNA经由转录而来，带着相应的遗传讯息，为下一步转译成蛋白质提供所需的讯息。在细胞中，mRNA从合成到被降解，经过了数个步骤。在转录的过程中，第二型RNA聚合酶（RNA polymerase II）从DNA中复 ...

zhuyuan0099 我看国外文献，在用药物刺激RNA沉默某个基因的细胞克隆时，多数这样分组分组control siRNA+药物组，control siRNA组，要沉默基因siRNA+药物组，要沉默基因siRNA组。其中control siRNA组和要沉默基因siRNA组一定要吗？为什么？请各位老师指点，小弟刚接触，见笑了。freecell 当然需要。control siRNA组：RNAi试验必须沉默基因siRNA组： 你没有加药物时的背 ...

light666 如题。miRNA的前面加上cel是什么意思？谢谢martin4720 C. elegans miRNA= Caenorhabditis elegans miRNAs秀丽隐杆线虫秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegans，C. elegans）是一种可以独立生存的线虫 （roundworm），其个体小，成体仅1.5mm长，为雌雄同体（hermaphrodites），雄性个体仅占群体的0.2％，可自体受精或双性生殖；在20℃下 ...

kiss9499 小弟新人，最近想做mirna的ISH，定了exiqon的探针，fitc标记的，有哪位兄弟做过的，发个protocol参考一下，虽然官网有，但是英文的，看起来不舒服，而且还有个小疑问，就是fitc标记的探针，杂交完直接就去荧光显微镜看荧光吗，还是要再买个抗fitc的抗体反应才能看到荧光？谢谢了啊，求助求助啊freecell 你的问题，答案在这里：http://www.nature.com/nprot/journ ...