RNA试验基础

marker2007 心肌组织很难拿到，请问采用检测血液中MicroRNA水平来替代心脏组织的MicroRNA水平检测吗？谢谢！woxingwosu 肯定不行的，两者不一样。marker2007 楼上版主您好，我已检测2对心脏病患者的全血MicroRNA,结果发现hsa-miR-21与hsa-miR-26b在2次实验中均升高近2倍，面对这样的结果，我有点茫然，1）不知道分析hsa-miR-21与hsa-miR-26b的功能，二者 ...

syn2767 请教各位师兄，小弟想研究肿瘤中lncRNA-即长非编码RNA的情况，请问开始用什么方法，用芯片筛选吗，多谢freecell "研究肿瘤中lncRNA-即长非编码RNA的情况", 研究什么情况？wlh0369 我觉得应该先将lncRNA从总RNA中分离出来，再进行下一步研究yaoyao82986 你好，看到你发的这篇帖子是今年年初的，我现在也遇到和你相似的问题，请问你当时是怎么解决的？如何筛选出的lncRNA？非常感谢 ...

qingyu2010 我是分子菜鸟一只。。。查基因序列的时候发现有些基因有两个polyA，这是为啥呢？望各位师兄师姐解惑啊~苍山暮雪 基因序列没polyA吧，A尾巴是在RNA加工中添加的吧qingyu2010 呃。。。我说的是polyA signal。。。苍山暮雪 有些基因有多个polyA位点的，通过不同剪接方式产生不同的蛋白，大鼠降钙素基因神马的就是这样本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你， ...

霍一刀hxs 各位战友，谁知道哪些网站或者软件可以预测RNA的二级结构？谢谢。吴佰霖 Mfold这个网站霍一刀hxs 吴佰霖 wrote:Mfold这个网站谢谢。投你一票。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

gaoyongxin 请问谁有mir-21在癌症术后升高的文献或者其他miRNA升高的相关文献zhidan1728 我看到过miRNA21在癌症方法的综述，也看到过其在心血管方法的文献，不过你可以在pubmed上搜搜，应该就找得到。gaoyongxin 这一方面的文章我也看了很多 都是miR-21术后下调的 没有看到过上调的 但是我现在需要的是上调的文献的支持 其他miRNA术后上调的也可以dnazyme Upregulation of mi ...

zitong1983 如题，近期可能研究某基因3’-UTR对mRNA稳定性的影响，有没有软件或者在线工具可以预测与3‘-UTR结合的protein？谢谢freecell 参考此文： http://www.springerlink.com/content/q877h6000762p0h2/#section=794249&page=1zitong1983 freecell wrote:参考此文： http://www.springerlink.com/ ...

caoyu19841026 请问哪位做过大鼠活体内行RNA干扰（最好是针对血管内皮），具体步骤是？有没有好的公司可以推荐？谢谢。我的邮箱是caoyu1379934@sina.comfreecell 自己检索一下。此类文献汗牛充栋： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16725144caoyu19841026 谢谢指点！本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都 ...

AlloY 用什么办法能预测出来呢？谢谢!shilei5794749 UCSC genome browser - genes and gene predication tracks - sno/miRNA trackDescriptionThis track displays positions of four different types of RNA in the human genome:precursor forms of microRNAs (pre-miRNAs)C/D box small nucleolar RNAs (C/D b ...

紫石榴 最近在研究心肌缺血对某microRNA的调控，有文献报道在原代细胞中随时间下调，我用的是H9c2心肌细胞系做的，想做个验证，顺便找最佳干预点。考虑经费问题，所以先用RT-PCR的方法做趋势，再上real time。我是提取总RNA，定量后（量和纯度都还好），用过茎环引物逆转录，再PCR电泳的，但做出的结果与设想趋势不符，且重复性很差，不知道哪里不对。麻烦高手指导下。版主zhujoker留言:RT-PCR这种半定量是不 ...

sahalafeisha 我要做心血管方面的实验，想要构建microRNA过表达和反义核酸病毒载体，请问用腺病毒还是慢病毒，二者之间有什么区别。谢放各位高手！song333 most people use lentivirus,lenti is RNA virus, can integrate into host genome for long term assay; can infect into nondividing cells; high efficiency; easy to make virus.zhuj ...

jian_an1 园内有没有人知道 MiRNA表达谱的数据库.谢谢了zhujoker http://www.ebi.ac.uk/这个网站有。请仔细查找。artneer http://www.ebi.ac.uk/gxa/我最近刚好在做方面的工作希望能多多交流啊本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙伴师兄微信号：shixiongcoming

lyingfei 各位同仁：最近浏览了一些最新文献，计划选取某一miRNA 作为研究目标，讨论它与胃肠道肿瘤的关系。但仅有1篇文献简单提到过它在胃肠道肿瘤的表达异常。因此觉得立题是否成功的首要问题是该miRNA在该正常组织和肿瘤组织中表达是否有差异。如在正常和异常组织中均无表达，则该立题无意义。如有差异则故事可继续。因此，我请大家讨论在科研立题中，除了做必要的预实验来证明某一miRNA在正常和异常组织的表达差异，仅根 ...

springhello 转录起始位点是不是第一个外显子的第一个碱基？song333 yes版主zhujoker留言:不清楚不要妄下结论！woxingwosu 我觉得不一样，转录起始位点应该在第一个外显子的第一个碱基的上游。转录起始位点是DNA分子中开始RNA转录的位置，而第一个外显子是经过剪切后留下来的第一个外显子，一般来说，应该在其5’还有一段UTR序列（还是在转录起始位点的下游），因此一般来讲，转录起始位点应该在第一 ...

springhello 请问大家，转录起始位点是如何定位的？谢谢woxingwosu +1是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应的DNA链上的碱基，即转录起始位点（TSS），一般都是A或者G开头。目前有一些软件可以预测TSS，网上搜索一下就有了。kongxingxing123 你可以做一下5‘-race实验来确定转录起始位点。本文由丁香园论坛提供，想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你，都可以成为师兄的好伙 ...

twinkling0 请教一下，我是新手，刚开始做miRNA荧光定量。内参是5sRNA，3个待测miRNA。逆转录用的茎环引物。请教，逆转录的时候，是将4种逆转录引物混合在一起，还是单管逆转录？混合逆转录，之前做预实验的时候，与单管相比差了2-3个CT。但是单管的话，会不会因为每管的逆转录效率不同，荧光PCR时，待测 miRNA和内参失去了可比性？另外，如果可以用混合逆转录的话，有没有什么逆转录酶或者盒子推荐？万分感谢！超马 单管 ...

wuxinkaoyan 大家好：　我有几个关于实验的问题向您请教下！希望您给予指导！谢谢！１、简单介绍下我现在要做的实验，我们用的是micrRNA，序列如下：microRNA-15-a: 5'-UAGCAGCACAUAAUGGUUUGUG-3'microRNA-16-1: 5'-UAGCAGCACGUAAAUAUUGGCG-3’按照文献上说的，为了增强稳定性，我们合成了其互补链，做转染的时候用的是双链，转染到细胞质后，其会自动降解成单链，然 ...

refrigritor2005 弱弱地问：所有的mRNA都在细胞浆里吗？即使其翻译（？）的蛋白质位于细胞核内？woxingwosu mRNA本身应该是在细胞核中合成的（少量在线粒体中），成熟后才转运到细胞浆（cytoplasm）里面去，所以说不可能所有的mRNA都在细胞浆里面。而且真核的mRNA必须通过核孔转运到细胞浆并且在细胞浆才能进行翻译。翻译的蛋白质能在细胞核中有一部分是由于这个蛋白质含有核定位序列（NLS, nucl ...

taijiwu 给一个靶基因，经证实已发现有一种及其以上的miRNA可以调控此靶基因，如何根据这几种miRNA及其靶基因来删选新的miRNA!以减少假阳性率！纠结中，还请高人帮忙！woxingwosu 如果不多的话，就一个个试？taijiwu 二楼的方法不好，一个一个试得花多长时间啊，等找到相关的miRNAb别人可能文章都出几篇了，况且还浪费那么多的资金!不可取LoftyMan LZ有毛病？二楼的方法是截至现在唯一实用的方法， ...

taijiwu 据文献报道，miRNA可以降解或抑制靶基因的翻译，是否还有其他调节方式，能否可以促进靶基因的稳定，还请高人回答路得自己走 taijiwu wrote:据文献报道，miRNA可以降解或抑制靶基因的翻译，是否还有其他调节方式，能否可以促进靶基因的稳定，还请高人回答路得自己走 taijiwu wrote:据文献报道，miRNA可以降解或抑制靶基因的翻译，是否还有其他调节方式，能否可以促进靶基因的稳定，还请高人回答不知是否 ...

taijiwu 给一个miRNA极其序列，如何查找它的转录起始位置，存在于哪个基因片段的内含子区域。请高人指点。霍一刀hxs taijiwu wrote:给一个miRNA极其序列，如何查找它的转录起始位置，存在于哪个基因片段的内含子区域。请高人指点。这两个网址。http://www.mirbase.org/http://biochemistry.dxy.cn/bbs/topic/15429796?tpg=1&age=0taijiwu 能否介 ...